| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,283,076 | (G)5→3 | intergenic (+143946/+110234) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,283,073 | 0 | G | . | 100.0% | 203.1 / NA | 48 | intergenic (+143943/+110238) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (25/23); total (25/23) | |||||||||||
| * | 1 | 1,283,074 | 0 | G | . | 100.0% | 203.1 / NA | 48 | intergenic (+143944/+110237) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (25/23); total (25/23) | |||||||||||
AATATTTTGGAAAAAGAAACGTTAAAAGAGCTGACGTTTAACAAACAGGGCTCTGTCGGGATGCCGTTGCCGGGGACGATTATTAAAATTGTGGATCCGGAAACCTTGCAGGAATTAGCAACGGGAGAAGACGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAACCGCTGACGTCATTGCCGAAATTGACGACGTGCGTTATTACAAAACGGGTGATAAAGGGGGCATATTGATGAGAACGGTTTTATTACTATCGTTGACCGTTATTCCCGCTTTGCGAAAGTCGGTGGCGAAATGATTAGTTTAGGCAGTGTAGAAGAACAAATTGCACAGGTTTTGAATGACGATGTGCAATTTACCGCTGCAAATGTGCCGGATGATAAAAAAGGTGAAGCGGTGGTGCTTTTAGTGAAAACCGAATCGGATATTAATGAGGTCGTCAATAT > 1/1282824‑1283298 || aaTATTTTGGAAAAAGAAACGTTAAAAGAGCTGACGTTTAACAAACAGGGCTCTGTCGGGATGCCGTTGCCGGGGACGATTATTAAAATTGTGGATCCGGAAACCTTGCAGGAATTAGCAACGGGAGAAGACGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAACCGCTGACGTCATTGCCGAAATTGACGACGTGCGTTATTACAAAACGGGTGATAAAg < 1:465965/250‑1 (MQ=255)aaTATTTTGGAAAAAGAAACGTTAAAAGAGCTGACGTTTAACAAACAGGGCTCTGTCGGGATGCCGTTGCCGGGGACGATTATTAAAATTGTGGATCCGGAAACCTTGCAGGAATTAGCAACGGGAGAAGACGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAACCGCTGACGTCATTGCCGAAATTGACGACGTGCGTTATTACAAAACGGGTGATAAAg < 1:352844/250‑1 (MQ=255) gAAAAAGAAACGTTAAAAGAGCTGACGTTTAACAAACAGGGCTCTGTCGGGATGCCGTTGCCGGGGACGATTATTAAAATTGTGGATCCGGAAACCTTGCAGGAATTAGCAACGGGAGAAGACGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAACCGCTGACGTCATTGCCGAAATTGACGACGTGCGTTATTACAAAACGGGTGATAAAgggcatattg < 1:322177/250‑8 (MQ=255) aaaaGAAACGTTAAAAGAGCTGACGTTTAACAAACAGGGCTCTGTCGGGATTGCGTTGCCGGGGACGATTATTAAAATTGTGGATCCGGAAACCTTGCAGGAATTAGGAACGGGAGAAGAAGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAAACGCTTACGGCATTTGCGAAATTGACGACGTGCCTTATTACAAAACGGGTGATAAA‑‑GGGCATATtgatg < 1:475753/251‑1 (MQ=255) 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aacaaacaGGGCTCTGTCGGGATGCCGTTGCCGGGGACGATTATTAAAATTGTGGATCCGGAAACCTTGCAGGAATTAGCAACGGGAGAAGACGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAACCGCTGACGTCATTGCCGAAATTGACGACGTGCGTTATTACAAAACGGGTGATAAA‑‑GGGCATATTGATGAGAACGGTTTTATTACTATCGTTGACCg > 1:610465/1‑251 (MQ=255) acaaacaGGGCTCTGTCGGGATGCCGTTGCCGGGGACGATTATTAAAATTGTGGATCCGGAAACCTTGCAGGAATTAGCAACGGGAGAAGACGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAACCGCTGACGTCATTGCCGAAATTGACGACGTGCGTTATTACAAAACGGGTGATAAAg < 1:751486/210‑1 (MQ=255) caaacaGGGCTCTGTCGGGATGCCGTTGCCGGGGACGATTATTAAAATTGTGGATCCGGAAACCTTGCAGGAATTAGCAACGGGAGAAGACGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAACCGCTGACGTCATTGCCGAAATTGACGACGTGCGTTATTACAAAACGGGTGATAAA‑‑GGGCATATTGATGAGAACGGTTTTATTACTATCg < 1:787293/242‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) ccTTGCAGGAATTAGCAACGGGAGAAGACGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAACCGCTGACGTCATTGCCGAAATTGACGACGTGCGTTATTACAAAACGGGTGATAAA‑‑GGGCATATTGATGAGAACGGTTTTATTACTATCGTTGACCGTTATTCCCGCTTTGCGAAAGTCGGTGGCGAAATGATTAGTTTAGGCAGTGTAGAAGAACAAAtt > 1:871780/1‑251 (MQ=255) ggAATTAGCAACGGGAGAAGACGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAACCGCTGACGTCATTGCCGAAATTGACGACGTGCGTTATTACAAAACGGGTGATAAA‑‑GGGCATATTGATGAGAACGGTTTTATTACTATCGTTGACCGTTATTCCCGCTTTGCGAAAGTCGGTGGCGAAATGATTAGTTTAGGCAGTGTAGAAGAACAAATTGCACAgg > 1:326088/1‑251 (MQ=255) aaTTAGCAACGGGAGAAGACGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAACCGCTGACGTCATTGCCGAAATTGACGACGTGCGTTATTACAAAACGGGTGATAAA‑‑GGGCATATTGATGAGAACGGTTTTATTACTATCGTTGAc > 1:593445/1‑176 (MQ=255) 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attaCAAAACGGGTGATAAA‑‑GGGCATATTGATGAGAACGGTTTTATTACTATCGTTGACCGTTATTCCCGCTTTGCGAAAGTCGGTGGCGAAATGATTAGTTTAGGCAGTGTAGAAGAACAAATTGCACAGGTTTTGAATGACGATGTGCAATTTACTGCTGCAAATGTGCCGGATGATAAAAAAGGTGAAGCGGTGGTGCtt < 1:689252/203‑1 (MQ=255) ttaCAAAACGGGTGATAAA‑‑GGGCATATTGATGAGAACGGTTTTATTACTATCGTTGACCGTTATTCCCGCTTTGCGAAAGTCGGTGGCGAAATGATTAGTTTAGGCAGTGTAGAAGAACAAATTGCACAGGTTTTGaa > 1:55479/1‑138 (MQ=255) || AATATTTTGGAAAAAGAAACGTTAAAAGAGCTGACGTTTAACAAACAGGGCTCTGTCGGGATGCCGTTGCCGGGGACGATTATTAAAATTGTGGATCCGGAAACCTTGCAGGAATTAGCAACGGGAGAAGACGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAACCGCTGACGTCATTGCCGAAATTGACGACGTGCGTTATTACAAAACGGGTGATAAAGGGGGCATATTGATGAGAACGGTTTTATTACTATCGTTGACCGTTATTCCCGCTTTGCGAAAGTCGGTGGCGAAATGATTAGTTTAGGCAGTGTAGAAGAACAAATTGCACAGGTTTTGAATGACGATGTGCAATTTACCGCTGCAAATGTGCCGGATGATAAAAAAGGTGAAGCGGTGGTGCTTTTAGTGAAAACCGAATCGGATATTAATGAGGTCGTCAATAT > 1/1282824‑1283298 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |