| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 887,184 | 2 bp→AG | coding (879‑880/1923 nt) | unknown → | tRNA cytosine(34) acetyltransferase (EC 2.3.1.193) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 887,184 | 0 | G | A | 100.0% | 234.7 / NA | 80 | M293I (ATG→ATA) | unknown | tRNA cytosine(34) acetyltransferase (EC 2.3.1.193) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (40/40); total (40/40) | |||||||||||
| * | 1 | 887,185 | 0 | A | G | 100.0% | 237.6 / NA | 80 | T294A (ACG→GCG) | unknown | tRNA cytosine(34) acetyltransferase (EC 2.3.1.193) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (40/40); total (40/40) | |||||||||||
GTCAAGATTTTCAATGAATTTTCCGGTGTCGAAATCCCCTTTATGCCACCTGATGAACTGCGCCAAAAGGTTGGTGAAAATCCACAGCAATTTGCGGATTCGTGGTTATTTGTGGACGAAGCGGCGATGATTCCGTTGGATACGCTGTTTGATTTAACGACTGCCTTTAAACGTATTGTGCTGACGACCACCATTCACAGCTACGAAGGCACGGGCAGGGGCTTCTTGTTAAAATTCATGACGAAAACCGACCGCACTTTGCGGCATTTTGAATTGTTCAGCCCGTTACGTTGGCAGGCGGATGACAAACTGGAGCGCTTTATTGATGAATTGTTGTTGTGTGATTGCGAAGATCGTCTGACGCAACCGCGTTACGATGCCAACCTTGCCAAACAGATTCAGATTTCTTACGAAGAACAGATTCCGCCTTATCAAATCGAATCGGTTTATGGCTTGCTGACCTTGGCGCATTACCGAAC > 1/886945‑887423 || gTCAATATTTTCAATGAATTTGCCGCTGCGGAAATCCCGTTTATATCGCCTGATGAACTGCGTCGAAAGATTGGTGAAAATCCGCAGCAATTTGCGGATTTATGGTTATTTGTGGATGAAGCGGCGATGATCCCGTTGGATACGCTGTTTGCTTTAACTGCCGTCTTTAAACGCATTGTGCTGACCACGACCATTCACAGTTACGAGGGTACGGGCAGGGGCTTCTTGTTAAAATTCATAGCGAACaccga > 1:265432/1‑251 (MQ=255) 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1:810904/249‑1 (MQ=255) tGTTAAAATTCATAGCGAACACCGACCGCACTTTTCGGCATTTTGAATTGTTCAGCCCGCTACTTTGGCAGGCGGATGACAAACTGGAGCGCTTTATTGACGAATTGTTGTTGTGTGATTGCGAAGATCGTCTGCCGCAACCGTGTTATGACGCTAACCTTGCCGAACAGATTCAGATTTCTTACAAAGAACGGATTCCGCCTAATCAAATCGAATCGATTTATGGCTTGCTGACTTTGGCGCATTACCgc < 1:386945/251‑2 (MQ=255) tGTTAAAATTCATAGCGAACACCGACCGCACTTTTCGGCATTTTGAATTGTTCAGCCCGCTACGTTGGCAGGCGGATGACAAACTGGAGCGCTTTATTGACGAATTGTTGTTGTGTGATTGCGAAGATCGTCTGCCGCAACCGTGTTATGACGCTAACCTTGCCGAACAGATTCAGATTTCTTACAAAGAACGGATTCCGCCTAATCAAATCGAATCGGTTTATGGCTTGCTGACTTTGGCGCATTACCg > 1:480086/1‑250 (MQ=255) gTTAAAATTCATAGCGAACACCGACCGCACTTTTCGGCATTTTGAATTGTTCAGCCCGCTACGTTGGCAGGCGGATGACAAACTGGAGCGCTTTATTGACGAATTGTTGTTGTGTGATTGCGAAGATCGTCTGCCGCAACCGTGTTatgacgctaacc > 1:554007/1‑147 (MQ=255) 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GTCAAGATTTTCAATGAATTTTCCGGTGTCGAAATCCCCTTTATGCCACCTGATGAACTGCGCCAAAAGGTTGGTGAAAATCCACAGCAATTTGCGGATTCGTGGTTATTTGTGGACGAAGCGGCGATGATTCCGTTGGATACGCTGTTTGATTTAACGACTGCCTTTAAACGTATTGTGCTGACGACCACCATTCACAGCTACGAAGGCACGGGCAGGGGCTTCTTGTTAAAATTCATGACGAAAACCGACCGCACTTTGCGGCATTTTGAATTGTTCAGCCCGTTACGTTGGCAGGCGGATGACAAACTGGAGCGCTTTATTGATGAATTGTTGTTGTGTGATTGCGAAGATCGTCTGACGCAACCGCGTTACGATGCCAACCTTGCCAAACAGATTCAGATTTCTTACGAAGAACAGATTCCGCCTTATCAAATCGAATCGGTTTATGGCTTGCTGACCTTGGCGCATTACCGAAC > 1/886945‑887423 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |