| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 944,187 | C→G | N568K (AAC→AAG) | unknown → | DNA topoisomerase III (EC 5.99.1.2) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 944,187 | 0 | C | G | 100.0% | 224.8 / NA | 74 | N568K (AAC→AAG) | unknown | DNA topoisomerase III (EC 5.99.1.2) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (39/35); total (39/35) | |||||||||||
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atTCACAGCACTGAAGCAGGGAGGATTCTGATTAAGGCCTTGCCTGATGTGGCAACTCAGCCCGATATGACCGCACATTGGGAATCCCAGTTGGACGGTATTAGCCGCAAACAGGCGAGTTATCAGCTATTTATGGAAAACCTGACGCAACTTTTGCCGGAATTGTTACATTACATTAATTTTTCCGCCTTGCGTGAGTTAAGTCGGCATAATTCGGGTGTCAAAAAGCAGGGCATTAATAAAGAAAACAt > 1:689203/1‑251 (MQ=255) atTCACAGCACTGAAGCAGGGAGGATTCTGATTAAGGCCTTGCCTGATGTGGCAACTCAGCCCGATATGACCGCACATTGGGAATCCCAGTTGGACGGTATTAGCCGCAAACAGGCGAGTTATCAGCTATTTATGGAAAACCTGACGCAACTTTTGCCGGAATTGTTACATTACATTAATTTTTCCGCCTTGCGTGAGTTAAGTCGGCATAATTCGGGTGTCAAAAAGCAGGGCATTAATAAAGAAAACAt > 1:7736/1‑251 (MQ=255) tCACAGCACTGAAGCAGGGAGGATTCTGATTAAGGCCTTGCCTGATGTGGCAACTCAGCCCGATATGACCGCACATTGGGAATCCCAGTTGGACGGTATTAGCCGCAAACAGGCGAGTTATCAGCTATTTATGGAAAACCTGACGCAACTTTTGCCGGAATTGTTACATTACATTAATTTTTCCGCCTTGCGTGAGTTAAg > 1:517330/1‑201 (MQ=255) 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gCACTGAAGCAGGGAGGATTCTGATTAAGGCCTTGCCTGATGTGGCAACTCAGCCCGATATGACCGCACATTGGGAATCCCAGTTGGACGGTATTAGCCGCAAACAGGCGAGTTATCAGCTATTTATGGAAAACCTGACGCAACTTTTGCCGGAATTGTTACATTACATTAATTTTTCCGCCTTGCGTGAGTTAAGTCGGCATAATTCGGGTGTCAAAAAGCAGGGCATTAATAAAGAAAACATCGAGAAt > 1:382942/1‑251 (MQ=255) gAAGCAGGGAGGATTCTGATTAAGGCCTTGCCTGATGTGGCAACTCAGCCCGATATGACCGCACATTGGGAATCCCAGTTGGACGGTATTAGCCGCAAACAGGCGAGTTATCAGCTATTTATGGAAAACCTGACGCAACTTTTGCCGGAATTGTTACATTACATTAATTTTTCCGCCTTGCGTGAGTTAAGTCGGCATAATTCGGGTGTCAAAAAGCAGGGCATTAATAAAGAAAACAt < 1:837551/239‑1 (MQ=255) aaGCAGGGAGGATTCTGATTAAGGCCTTGCCTGATGTGGCAACTCAGCCCGATATGACCGCACATTGGGAATCCCAGTTGGACGGTATTAGCCGCAAACAGGCGAGTTATCAGCTATTTATGGAAAACCTGACGCAACTTTTGCCGGAATTGTTACATTACATTAATTTTTCCGCCTTGCGTGAGTTAAGTCGGCATAATTCGGGTGTCAAAAAGCAGGGCATTAATAAAGAAAACATCGAGAATCACGa < 1:506412/250‑1 (MQ=255) ggaTTCTGATTAAGGCCTTGCCTGATGTGGCAACTCAGCCCGATATGACCGCACATTGGGAATCCCAGTTGGACGGTATTAGCCGCAAACAGGCGAGTTATCAGCTATTTATGGAAAACCTGACGCAACTTTTGCCGGAATTGttacat > 1:707699/1‑149 (MQ=255) ggaTTCTGATTAAGGCCTTGCCTGATGTGGCAACTCAGCCCGATATGACCGCACATTGGGAATCCCAGTTGGACGGTATTAGCCGCAAACAGGCGAGTTATCAGCTATTTATGGAAAACCTGACGCAACTTTTGCCGGAATTGTTACATTACATTAATTTTTCCGCCTTGCGTGAGTTAAGTCGGCATAATTCGGGTGTCAAAAAGCAGGGCATTAATAAAGAAAACATCGAGAATCACGAAAAGTTAACg > 1:244203/1‑251 (MQ=255) gATTAAGGCCTTGCCTGATGTGGCAACTCAGCCCGATATGACCGCACATTGGGAATCCCAGTTGGACGGTATTAGCCGCAAACAGGCGAGTTATCAGCTATTTATGGAAAACCTGACGCAACTTTTGCCGGAATTGttac > 1:577230/1‑140 (MQ=255) gATTAAGGCCTTGCCTGATGTGGCAACTCAGCCCGATATGACCGCACATTGGGAATCCCAGTTGGACGGTATTAGCCGCAAACAGGCGAGTTATCAGCTATTTATGGAAAACCTGACGCAACTTTTGCCGGAATTGTTACATTACATTAATTTTTCCGc < 1:241333/159‑1 (MQ=255) gATTAAGGCCTTGCCTGATGTGGCAACTCAGCCCGATATGACCGCACATTGGGAATCCCAGTTGGACGGTATTAGCCGCAAACAGGCGAGTTATCAGCTATTTATGGAAAACCTGACGCAACTTTTGCCGGAATTGTTACATTACATTAATTTTTCCGCCTTGCGTGAGTTAAGTCGGCATAATTCGGGTGTCAAAAAGCAGGGCATTaata < 1:861953/212‑3 (MQ=255) gATTAAGGCCTTGCCTGATGTGGCAACTCAGCCCGATATGACCGCACATTGGGAATCCCAGTTGGACGGTATTAGCCGCAAACAGGCGAGTTATCAGCTATTTATGGAAAACCTGACGCAACTTTTGCCGGAATTGTTACATTACATTAATTTTTCCGCCTTGCGTGAGTTAAGTCGGCATAATTCGGGTGTCAAAAAGCAGGGCATTAATAAAGAAAAc > 1:80822/1‑220 (MQ=255) gATTAAGGCCTTGCCTGATGTGGCAACTCAGCCCGATATGACCGCACATTGGGAATCCCAGTTGGACGGTATTAGCCGCAAACAGGCGAGTTATCAGCTATTTATGGAAAACCTGACGCAACTTTTGCCGGAATTGTTACATTACATTAATTTTTCCGCCTTGCGTGAGTTAAGTCGGCATAATTCGGGTGTCAAAAAGCAGGGCATTAATAAAGAAAACATCGAGAATCACGAAAAg > 1:238807/1‑238 (MQ=255) gATTAAGGCCTTGCCTGATGTGGCAACTCAGCCCGATATGACCGCACATTGGGAATCCCAGTTGGACGGTATTAGCCGCAAACAGGCGAGTTATCAGCTATTTATGGAAAACCTGACGCAACTTTTGCCGGAATTGTTACATTACATTAATTTTTCCGCCTTGCGTGAGTTAAGTCGGCATAATTCGGGTGTCAAAAAGCAGGGCATTAATAAAGAAAACATCGAGAATCACGAAAAGTTAACg > 1:873368/1‑244 (MQ=255) | GATTGTCAGTAAAAAAACGCAGCCGCCGAAACACTTCACCGACGCGACTTTGCTTTCCGCCATGACAGGCATTGCCCGCTTCGTGCAGGATAAAGAATTGAAAAAAATCTTGCGTGAAACCGATGGGCTTGGTACCGAAGCCACCCGTGCGGGCATCATCGAGTTGTTGTTTAAACGCGGTTTTCTGTATAAAAAAGGGCGCAATATTCACAGCACTGAAGCAGGGAGGATTCTGATTAACGCCTTGCCTGATGTGGCAACTCAGCCCGATATGACCGCACATTGGGAATCCCAGTTGGACGGTATTAGCCGCAAACAGGCGAGTTATCAGCTATTTATGGAAAACCTGACGCAACTTTTGCCGGAATTGTTACATTACATTAATTTTTCCGCCTTGCGTGAGTTAAGTCGGCATAATTCGGGTGTCAAAAAGCAGGGCATTAA‑AAAGAAAACATCGAGAATCACGAAAAGTTAACG > 1/943947‑944423 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |