| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 917,472 | C→T | A249V (GCG→GTG) | unknown → | Chorismate mutase I (EC 5.4.99.5) / Prephenate dehydratase (EC 4.2.1.51) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 917,472 | 0 | C | T | 100.0% | 256.7 / NA | 88 | A249V (GCG→GTG) | unknown | Chorismate mutase I (EC 5.4.99.5) / Prephenate dehydratase (EC 4.2.1.51) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (37/51); total (37/51) | |||||||||||
TGTATGATTTGTTACAGCACACCGATTTATTTTTGGTGGGCGAACTTGCCTATCCGATTCAACATTGCGTGTTAGTGAATGAACAGGATGATTTGAGCAAAATTGATACCTTGTACAGCCACCCACAAGTGATTCAACAATGCAGTCAATTTATCCAAGGTTTACGGGTGCATATTGAATATTGTGAAAGTAGCTCCCATGCCATGCAGTTGGTTGCCGGTTTAAATAAGCCGAATATTGCGGCATTAGGTAATGAGGACGGCGGCAAGTTGTATGGCTTGAAAGTGTTGCGACGCAATATCGCCAACCAAGAAAACAATATTACCCGTTTTATCGTGATCGCGAAGAAAGCACACAGCGTCTCCCCGCAAATTCACACCAAAACGCTATTGTTAATGAGCACAGGGCAACAAGCGGGATCTTTGGTTGACGCCTTATTGGTGTTTAAAAAGCACCATATTAATATGACAAAGCTGGAGTCCCGCCC > 1/917232‑917718 | tgtATGATTTGTTACAGCACACCGATTTATTTTTGGTGGGCGAACTTGCCTATCCGATTCAACATTGCGTGTTAGTGAATGAACAGGATGATTTGAGCAAAATTGATACCTTGTACAGCCGCCCACAAGTGATTCAACAATGCAGTCAATTTATCCAAGGTTTACGGGTGCATATTGAATATTGTGAAAGTAGCTCCCATGCCGTGCAGTTGGTTGCCGGTTTAAATAAGCCGAATATTGTGGCATTAGGt < 1:834978/251‑1 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TGTATGATTTGTTACAGCACACCGATTTATTTTTGGTGGGCGAACTTGCCTATCCGATTCAACATTGCGTGTTAGTGAATGAACAGGATGATTTGAGCAAAATTGATACCTTGTACAGCCACCCACAAGTGATTCAACAATGCAGTCAATTTATCCAAGGTTTACGGGTGCATATTGAATATTGTGAAAGTAGCTCCCATGCCATGCAGTTGGTTGCCGGTTTAAATAAGCCGAATATTGCGGCATTAGGTAATGAGGACGGCGGCAAGTTGTATGGCTTGAAAGTGTTGCGACGCAATATCGCCAACCAAGAAAACAATATTACCCGTTTTATCGTGATCGCGAAGAAAGCACACAGCGTCTCCCCGCAAATTCACACCAAAACGCTATTGTTAATGAGCACAGGGCAACAAGCGGGATCTTTGGTTGACGCCTTATTGGTGTTTAAAAAGCACCATATTAATATGACAAAGCTGGAGTCCCGCCC > 1/917232‑917718 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |