| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 906,906 | G→A | A276T (GCG→ACG) | unknown → | UDP‑N‑acetylmuramoyl‑L‑alanine‑‑D‑glutamate ligase (EC 6.3.2.9) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 906,906 | 0 | G | A | 100.0% | 286.8 / NA | 99 | A276T (GCG→ACG) | unknown | UDP‑N‑acetylmuramoyl‑L‑alanine‑‑D‑glutamate ligase (EC 6.3.2.9) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (47/52); total (47/52) | |||||||||||
CGCGAAATTAAACATTTACAATCATTGCCAAACGGCGGTGATTAATGCGGAAGATGCATTGACGTTGCCAACGACCCAGCGACCGCAAAAGCAGGTTTCTTTTGGTGAAAACCACGCGGATTATTGGTTAAAAACCGAAAATAACAAAACCTATTTAATGGCGTACGATGAAGCGGTGTTAGCCTGTGATGAAATGAAATTGACCGGTCGCCATAATTACATGAATGCCTTGGCTGCCATTGCGTTGGCACAGGCGGCAGGCATAAATTTAACCGGAATTCGAACCGCACTTTGTGCGTTCGGTGGTTTGGAGCACCGCTTCCAAGTGGCGCATATCGCTGACGGCGTGCGCTGGATTAACGATTCCAAAGCCACTAATGTGGGTAGCACCGTTGCCGCCTTAACCGGTTTGCAGGTAGCGGGCAAGCTCCATTTATTGCTCGGCGGTGACGGCAAAGGCGCGGATTTCTCCGAATTGGCACGCTT > 1/906665‑907150 | cgcgAAATTAAACATTTACAATCATTGCCAAACGGCGGTGATTAATGCGGAAGATGCATTGACGTTGCCAACGACCCAGCGACCGCAAAAGCAGGTTTCTTTTGGTGAAAACCACGCGGATTATTGGTTAAAAACCGAAAATAACAAAACCTATTTAATGGCGTACGATGAAGCGGTGTTAGCCTGTGATGAAATGAAATTGACCGGTCGCCATAATTACATGAATGCCTTGGCTGCCATTACGTTGGcac < 1:827136/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |