| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 150,339 | A→G | N174S (AAC→AGC) | unknown → | Phage protein (ACLAME 1194) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 150,339 | 0 | A | G | 100.0% | 145.1 / NA | 49 | N174S (AAC→AGC) | unknown | Phage protein (ACLAME 1194) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (23/26); total (23/26) | |||||||||||
TAAAAACGTTCAAATGTCATGATTTACTTGGTTATTATGAGTCCGAACCAGACTTAGAGATTGCCGCAGCATGGGATTATAAAGGTAATTTTGACGGTAGTCGTAGAGATTTAGACATTGTCGGCATGTGGCGAGAACCCAAGCCAATTAAGGCGCCTTTACGTGAATTGCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAACCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAACGGTATCAAGAGTAACAACAGACCGCGAAAGTGCGGTTTTTTATTTTTATCAAAACAGGAGAAATTCAAATGTTAAAATATTTTATATCTTGGTTATGTTCTTTTATCTATCCACTTAACGG > 1/150105‑150582 | tAAAAACGTTTAAATGTCATGATTTACTTGGTTATTATGAGTCCGAACCAGACTTAGAGATTGCCGCAGCATGGGATTATAAAGGTAATTTTGACGGTAGTCGTAGAGATTTAGACATTGTCGGCATGTGGCGAGAACCCAAGCCAATTAAGGCGCCTTTACGTGAATTGCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTa < 1:386965/251‑1 (MQ=255) aCGTTTAAATGTCATGATTTACTTGGTTATTATGAGTCCGAACCAGACTTAGAGATTGCCGCAGCATGGGATTATAAAGGTAATTTTGACGGTAGTCGTAGAGATTTAGACATTGTCGGCATGTGGCGAGAACCCAAGCCAATTAAGGCGCCTTTACGTGAATTGCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAg > 1:237657/1‑251 (MQ=255) cGTTTAAATGTCATGATTTACTTGGTTATTATGAGTCCGAACCAGACTTAGAGATTGCCGCAGCATGGGATTATAAAGGTAATTTTGACGGTAGTCGTAGAGATTTAGACATTGTCGGCATGTGGCGAGAACCCAAGCCAATTAAGGCGCCTTTACGTGAATTGCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAgctgcgattccca > 1:843394/1‑240 (MQ=255) aTTTACTTGGTTATTATGAGTCCGAACCAGACTTAGAGATTGCCGCAGCATGGGATTATAAAGGTAATTTTGACGGTAGTCGTAGAGATTTAGACATTGTCGGCATGTGGCGAGAACCCAAGCCAATTAAGGCGCCTTTACGTGAATTGCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAagag < 1:107940/251‑1 (MQ=38) ggTTATTATGAGTCCGAACCAGACTTAGAGATTGCCGCAGCATGGGATTATAAAGGTAATTTTGACGGTAGTCGTAGAGATTTAGACATTGTCGGCATGTGGCGAGAACCCAAGCCAATTAAGGCGCCTTTACGTGAATTGCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCa > 1:745079/1‑251 (MQ=255) ccGAACCAGACTTAGAGATTGCCGCAGCATGGGATTATAAAGGTAATTTTGACGGTAGTCGTAGAGATTTAGACATTGTCGGCATGTGGCGAGAACCCAAGCCAATTAAGGCGCCTTTACGTGAATTGCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTagag < 1:324814/251‑1 (MQ=39) ccGAACCAGACTTAGAGATTGCCGCAGCATGGGATTATAAAGGTAATTTTGACGGTAGTCGTAGAGATTTAGACATTGTCGGCATGTGGCGAGAACCCAAGCCAATTAAGGCGCCTTTACGTGAATTGCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTagag < 1:665011/251‑1 (MQ=39) gAACCAGACTTAGAGATTGCCGCAGCATGGGATTATAAAGGTAATTTTGACGGTAGTCGTAGAGATTTAGACATTGTCGGCATGTGGCGAGAACCCAAGCCAATTAAGGCGCCTTTACGTGAATTGCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTagag > 1:126818/1‑249 (MQ=38) gACTTAGAGATTGCCGCAGCATGGGATTATAAAGGTAATTTTGACGGTAGTCGTAGAGATTTAGACATTGTCGGCATGTGGCGAGAACCCAAGCCAATTAAGGCGCCTTTACGTGAATTGCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTagag < 1:551755/243‑1 (MQ=37) cTTAGAGATTGCCGCAGCATGGGATTATAAAGGTAATTTTGACGGTAGTCGTAGAGATTTAGACATTGTCGGCATGTGGCGAGAACCCAAGCCAATTAAGGCGCCTTTACGTGAATTGCCTAAGCCAATCTACGAGGTACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGat > 1:522719/1‑251 (MQ=37) ttAGAGATTGCCGCAGCATGGGATTATAAAGGTAATTTTGACGGTAGTCGTAGAGATTTAGACATTGTCGGCATGTGGCGAGAACCCAAGCCAATTAAGGCGCCTTTACGTGAATTGCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGata < 1:538723/251‑1 (MQ=37) aTTGCCGCAGCATGGGATTATAAAGGTAATTTTGACGGTAGTCGTAGAGATTTAGACATTGTCGGCATGTGGCGAGAACCCAAGCCAATTAAGGCGCCTTTACGTGAATTGCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACaa < 1:865293/251‑1 (MQ=37) caTGGGATTATAAAGGTAATTTTGACGGTAGTCGTAGAGATTTAGACATTGTCGGCATGTGGCGAGAACCCAAGCCAATTAAGGCGCCTTTACGTGAATTGCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAgac < 1:131122/251‑1 (MQ=37) ataAAGGTAATTTTGACGGTAGTCGTAGAGATTTAGACATTGTCGGCATGTGGCGAGAACCCAAGCCAATTAAGGCGCCTTTACGTGAATTGCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATc < 1:14641/251‑1 (MQ=37) cGGTAGTCGTAGAGATTTAGACATTGTCGGCATGTGGCGAGAACCCAAGCCAATTAAGGCGCCTTTACGTGAATTGCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTagag > 1:264940/1‑199 (MQ=255) gaTTTAGACATTGTCGGCATGTGGCGAGAACCCAAGCCAATTAAGGCGCCTTTACGTGAATTGCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAag > 1:350986/1‑155 (MQ=255) gaTTTAGACATTGTCGGCATGTGGCGAGAACCCAAGCCAATTAAGGCGCCTTTACGTGAATTGCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAAc > 1:407956/1‑242 (MQ=37) gaTTTAGACATTGTCGGCATGTGGCGAGAACCCAAGCCAATTAAGGCGCCTTTACGTGAATTGCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAACg > 1:808075/1‑251 (MQ=37) aTTTAGACATTGTCGGCATGTGGCGAGAACCCAAGCCAATTAAGGCGCCTTTACGTGAATTGCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAAc < 1:81688/249‑1 (MQ=37) gCATGTGGCGAGAACCCAAGCCAATTAAGGCGCCTTTACGTGAATTGCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAACGGTATCAAGAGTaacaa > 1:726078/1‑251 (MQ=37) aCCCAAGCCAATTAAGGCGCCTTTACGTGAATTGCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAACGGTATCAAGAGTAACAACAGACCGCGAAAg < 1:10239/251‑1 (MQ=37) ccAAGCCAATTAAGGCGCCTTTACGTGAATTGCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAACGGTATCAAGAGTAACAACAGACCGCGAAAGTg < 1:556550/251‑1 (MQ=37) gCCAATTAAGGCGCCTTTACGTGAATTGCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAg > 1:286575/1‑159 (MQ=255) tACGTGAATTGCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATTGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTAc < 1:284855/119‑1 (MQ=255) tACGTGAATTGCCTAAGCCAATCTACAAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAACGGTATCAAGAGTAACAACAGACCGCGAAAGTGCGGTTTTTTATTTTTATCaaa > 1:627747/1‑251 (MQ=37) aTTGCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAACGGTATCAAGAGTAACAACAGACCGCGAAAGTGCGGTTTTTTATTTTTATCAAAACAGgag < 1:379309/251‑1 (MQ=37) gCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTgaga > 1:109294/1‑173 (MQ=255) gCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAACGGTATCa > 1:826788/1‑195 (MQ=255) gCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAACGGTATCAAGAGTAACAACAGACCGCGAAAGTGCGGTTTTTTATTTTTATCAAAACAGGAGaaa > 1:46432/1‑251 (MQ=37) aTACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAACGGTATCAAGAGTAACAACAGACCGCGAAAGTGCGGTTTTTTATTTTTATCAAAACAGGAGAAATTCAGATGTTAAAATAttt > 1:755179/1‑251 (MQ=37) gTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGat < 1:212009/105‑1 (MQ=255) gTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATg < 1:157972/146‑1 (MQ=255) gTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAACGGTATCAAGAGTAACAACAGACCGCGAAAGTGCGGTTTTTTATTTTTATCAAAACAGGAGAAATTCAGATGTTAAAATATTTTATATCTTgg > 1:488604/1‑251 (MQ=37) atatTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAg > 1:671907/1‑113 (MQ=255) atatTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAACGGTATCAAGAGTAACAACAGACCGCGAAAGTGCGGTTTTTTATTTTTATCAAAAc < 1:862557/207‑1 (MQ=38) atatTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAACGGTATCAAGAGTAACAACAGACCGCGAAAGTGCGGTTTTTTATTTTTATCAAAACAGGAGAAATTCAGATGTTAAAATATTTTATATCTTGGTTATGtt > 1:243246/1‑251 (MQ=37) tatTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAACGGTATCAAGAGTAACAACAGACCGCGAAAGTGCGGTTTTTTATTTTTATCAAAACAGGAGAAATTCAGATGTTAAAATATTTTATATCTTGGTTATGtt > 1:28989/1‑250 (MQ=37) tatTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAACGGTATCAAGAGTAACAACAGACCGCGAAAGTGCGGTTTTTTATTTTTATCAAAACAGGAGAAATTCAGATGTTAAAATATTTTATATCTTGGTTATGtt > 1:635794/1‑250 (MQ=37) gTACTATTTGGGGTCGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAACGGTATCAAGAGTAACAACAGACCGCGAAAGTGCGGTTTTTTATTTTTATCAAAACAGGAGAAATTCAGATGTTAAAATATTTtata > 1:385155/1‑232 (MQ=255) cGGATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAACGGTATCAAGAGTAACAACAGACCGCGAAAGTGCGGTTTTTTATTTTTATCAAAACAGGAGAAATTCAGATGTTAAAATATTTTATATCTTGGTTATGTTCTTTTATCTATCCACTTAAc < 1:267404/251‑1 (MQ=37) gATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAACgg < 1:300960/132‑1 (MQ=255) gATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAACGGTATCAAGAGTAACAACAGACCGCGAAAGTGCGGTTTTTTATTTTTATCAAAACAGGAGAAATTCAGATGTTAAAat > 1:90260/1‑208 (MQ=255) gATCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAACGGTATCAAGAGTAACAACAGACCGCGAAAGTGCGGTTTTTTATTTTTATCAAAACAGGAGAAATTCAGATGTTAAAATATTTTATATc < 1:32459/218‑1 (MQ=255) aTCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAACGGTATCAag < 1:157730/138‑1 (MQ=255) aTCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAACGGTATCAAGAGTAACAACAGACCGCGAAAGTGCGGTTTTTTATTTTTATCAAAACAGGAGAAATTCAGATGTTAAAATATTTTATATCTTGGTTATGTTCTTTTATCTATCCACTTAACgg < 1:527903/250‑1 (MQ=25) aTCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAACGGTATCAAGAGTAACAACAGACCGCGAAAGTGCGGTTTTTTATTTTTATCAAAACAGGAGAAATTCAGATGTTAAAATATTTTATATCTTGGTTATGTTCTTTTATCTATCCACTTAACgg < 1:239978/250‑1 (MQ=25) aTCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAACGGTATCAAGAGTAACAACAGACCGCGAAAGTGCGGTTTTTTATTTTTATCAAAACAGGAGAAATTCAGATGTTAAAATATTTTATATCTTGGTTATGTTCTTTTATCTATCCACTTAACgg < 1:604989/250‑1 (MQ=25) aTCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAACGGTATCAAGAGTAACAACAGACCGCGAAAGTGCGGTTTTTTATTTTTATCAAAACAGGAGAAATTCAGATGTTAAAATATTTTATATCTTGGTTATGTTCTTTTATCTATCCACTTAACgg < 1:861604/250‑1 (MQ=25) aTCTAAGCCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAACGGTATCAAGAGTAACAACAGACCGCGAAAGTGCGGTTTTTTATTTTTATCAAAACAGGAGAAATTCAGATGTTAAAATATTTTATATCTTGGTTATGTTCTTTTATCTATCCACTTAACgg < 1:154325/250‑1 (MQ=25) | TAAAAACGTTCAAATGTCATGATTTACTTGGTTATTATGAGTCCGAACCAGACTTAGAGATTGCCGCAGCATGGGATTATAAAGGTAATTTTGACGGTAGTCGTAGAGATTTAGACATTGTCGGCATGTGGCGAGAACCCAAGCCAATTAAGGCGCCTTTACGTGAATTGCCTAAGCCAATCTACGAGATACCGGATGGTGCAGAATATTTGTACTATTTGGGGTCGGATCTAAACCAGAAGCTGCTGGTAAAAAGCGTAAGAGCCAAAGAGCATTACCACTCGGCACTAGAGCATGGCAGATATTACAAATCAAAAGACGACGTAATCCAAGTTATTGAGATGTTAACTGGTAAACGGTATCAAGAGTAACAACAGACCGCGAAAGTGCGGTTTTTTATTTTTATCAAAACAGGAGAAATTCAAATGTTAAAATATTTTATATCTTGGTTATGTTCTTTTATCTATCCACTTAACGG > 1/150105‑150582 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |