| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 129,880 | G→A | R6W (CGG→TGG) | unknown ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 129,880 | 0 | G | A | 100.0% | 135.9 / NA | 48 | R6W (CGG→TGG) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (28/20); total (28/20) | |||||||||||
ATACAATAAGACTCAATTTTGAAATTGAGTGTTTAAAATTACTCATAAAAAAACTCCTTAGAAATTAAAGTAATAGTCTAATATTTAATTAATAATCCCACTAAATTTTATAACTGCTTGAAATTTTTAAGTGGACGTAATCGCATAAACTGCTTGGGCAGTTTAACACAATAAACAAAATACGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCGGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAACGTTCTTTAACACATTGAAAAACTTTGTTTTTTCTGACCGCACTTTATTAAATTAAGTTAAGGCTAAATATGCGGCTTATTCGTGCATACCTAATTTTTTCTCCAAATAGTGGATATTAGTGCCACCTTTTTGGAAGTTTTCATCGTCTAAAATAAGATCATGTAACGGGATATTGGTTTTAAT > 1/129661‑130111 | aTACAATAAGACTCAATTTTGAAATTGAGTGTTTAAAATTACTCATAAAAAAACTCCTTAGAAATTAAAGTAATAGTCTAATATTTAATTAATAATCCCACTAAATTTTATAACTGCTTGAAATTTTTAAGTGGACGTAATCGCATAAACTGCTTGGGCAGTTTAACACAATAAACAAAATACGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGc < 1:411625/251‑1 (MQ=255) gTAATAGTCTAATATTTAATTAATAATCCCACTAAATTTTATAACTGCTTGAAATTTTTAAGTGGACGTAATCGCATAAACTGCTTGGGCAGTTTAACACAATAAACAAAATACGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATATTTTATTc < 1:8970/164‑1 (MQ=255) gTAATAGTCTAATATTTAATTAATAATCCCACTAAATTTTATAACTGCTTGAAATTTTTAAGTGGACGTAATCGCATAAACTGCTTGGGCAGTTTAACACAATAAACAAAATACGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAAc > 1:382529/1‑199 (MQ=255) tAATAGTCTAATATTTAATTAATAATCCCACTAAATTTTATAACTGCTTGAAATTTTTAAGTGGACGTAATCGCATAAACTGCTTGGGCAGTTTAACACAATAAACAAAATACGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAACGTTCTTTAACACATTGAAAAACTTTGTTTTTTCTGACCGCACTTTattaaat < 1:18189/250‑1 (MQ=255) tAATAGTCTAATATTTAATTAATAATCCCACTAAATTTTATAACTGCTTGAAATTTTTAAGTGGACGTAATCGCATAAACTGCTTGGGCAGTTTAACACAATAAACAAAATACGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAACGTTCTTTAACACATTGAAAAACTTTGTTTTTTCTGACCGCACTTTattaaat < 1:519664/250‑1 (MQ=255) tAATAGTCTAATATTTAATTAATAATCCCACTAAATTTTATAACTGCTTGAAATTTTTAAGTGGACGTAATCGCATAAACTGCTTGGGCAGTTTAACACAATAAACAAAATACGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAACGTTCTTTAACACATTGAAAAACTTTGTTTTTTCTGACCGCACTTTattaaat < 1:382076/250‑1 (MQ=255) gTCTAATATTTAATTAATAATCCCACTAAATTTTATAACTGCTTGAAATTTTTAAGTGGACGTAATCGCATAAACTGCTTGGGCAGTTTAACACAATAAACAAAATACGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAACGTTCTTTAACACATTGAAAAACTTTGTTTTTTCTGAc < 1:48421/230‑1 (MQ=255) attaatAATCCCACTAAATTTTATAACTGCTTGAAATTTTTAAGTGGACGTAATCGCATAAACTGCTTGGGCAGTTTAACACAATAAACAAAATACGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAACGTTCTTTAac > 1:508278/1‑191 (MQ=255) cACTAAATTTTATAACTGCTTGAAATTTTTAAGTGGACGTAATCGCATAAACTGCTTGGGCAGTTTAACACAATAAACAAAATACGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAACGTTCTTTAACACATTGAAAAACTTTGTTTTTTCTGACCGCACTTTATTAAATTAAGTTAAGGCTAAata < 1:448757/239‑1 (MQ=255) aCTAAATTTTATAACTGCTTGAAATTTTTAAGTGGACGTAATCGCATAAACTGCTTGGGCAGTTTAACACAATAAACAAAATACGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAAc > 1:566716/1‑169 (MQ=255) aTTTTATAACTGCTTGAAATTTTTAAGTGGACGTAATCGCATAAACTGCTTGGGCAGTTTAACACAATAAACAAAATACGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTc > 1:339437/1‑142 (MQ=255) aTTTTATAACTGCTTGAAATTTTTAAGTGGACGTAATCGCATAAACTGCTTGGGCAGTTTAACACAATAAACAAAATACGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAACGTTCTTTAACACATTGAAAAACTTTGTTTTTTCTGACCGCACTTTATTAAATTAAGTTAAGGCTAAATATGCGGCTTATTCGTGCAt > 1:19306/1‑251 (MQ=255) aTTTTATAACTGCTTGAAATTTTTAAGTGGACGTAATCGCATAAACTGCTTGGGCAGTTTAACACAATAAACAAAATACGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAACGTTCTTTAACACATTGAAAAACTTTGTTTTTTCTGACCGCACTTTATTAAATTAAGTTAAGGCTAAATATGCGGCTTATTCGTGCAt > 1:420358/1‑251 (MQ=255) 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ttttATAACTGCTTGAAATTTTTAAGTGGACGTAATCGCATAAACTGCTTGGGCAGTTTAACACAATAAACAAAATACGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAACGTTCTTTAACACATTGAAAAACTTTGTTTTTTCTGACCGCACTTTATTAAATTAAGTTAAGGCTAAata > 1:574121/1‑232 (MQ=255) ttttATAACTGCTTGAAATTTTTAAGTGGACGTAATCGCATAAACTGCTTGGGCAGTTTAACACAATAAACAAAATACGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAACGTTCTTTAACACATTGAAAAACTTTGTTTTTTCTGACCGCACTTTATTAAATTAAGTTAAGGCTAAATATGCGGCTTATTCGTGCATa > 1:901443/1‑251 (MQ=255) ttATAACTGCTTGAAATTTTTAAGTGGACGTAATCGCATAAACTGCTTGGGCAGTTTAACACAATAAACAAAATACGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATAttt < 1:253039/121‑1 (MQ=255) ttATAACTGCTTGAAATTTTTAAGTGGACGTAATCGCATAAACTGCTTGGGCAGTTTAACACAATAAACAAAATACGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAACGTTCTTTAGCACATTGAAAAACTTTGTTTTTTCTGACCGCACTTTATTAAATTAAGTTAAGGCTAAATATGCGGCTTATTCGTGCATAc > 1:427124/1‑250 (MQ=255) 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(MQ=255) cGCATAAACTGCTTGGGCAGTTTAACACAATAAACAAAATACGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAACGTTCTTTAACACATTGAAAAACTTTGTTTTTTCTGACCGCACTTTATTAAATTAAGTTAAGGCTAAATATGCGGCTTATTCg > 1:780354/1‑209 (MQ=255) cATAAACTGCTTGGGCAGTTTAACACAATAAACAAAATACGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAACGTTCTTTAACACATTGAAAAACTTTGTTTTTTCTGACCGCACTTTATTAAATTAAGTTAAGGCTAAATATGCGGCTTATTCGTGCATACCTAATTTTTTCTCCAAATAGTGGATATTAGTg > 1:520228/1‑246 (MQ=255) gTTTAACACAATAAACAAAATACGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAACGTTCTTTAacac < 1:196185/120‑1 (MQ=255) gTTTAACACAATAAACAAAATACGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAACGTTCTTTAACACATTGAAAAACTTTGTTTTTTCTGACCGCACTTTATTAAATTAAGTTAAGGCTAAATATGCGGCTTATTCGTGCATACCTAATTTTTTCTCCAAATAGTGGATATTAGTGCCACCTTTTTGGAAGTTTTCAt > 1:563336/1‑251 (MQ=255) 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aaaTACGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAACGTTCTTTAACACATTGAAAAACTTTGTTTTTTCTGACCGCACTTTATTAAATTAAGTTAAGGCTAAATATGCGGCTTATTCGTGCATACCTAATTTTTTCTCCAAATAGTGGATATTAGTGCCACCTTTTTGGAAGTTTTCATCGTCTAAAATAAGATCa > 1:508562/1‑251 (MQ=255) aCGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAACGTTCTTTAACACATTGAAAAACTTTGTTTTTTCTGACCGCACTTTATTAAATTAAGTTAAGGCTAAATATGCGGCTTATTCGTGCATACCTAATTTTTTCTCCAAATAGTGGATATTAGTGCCACCTTTTTGGAAGTTTTCATCGTCTAAAATAAGATCATGTa < 1:773635/251‑1 (MQ=255) aaaTTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAACGTTCTTTAACACATTGAAAAACTTTGTTTTTTCTGACCGCACTTTATTAAATTAAGTTAAGGCTAAATATGCGGCTTATTCGTGCATACCTAATTTTTTCTCCAAATAGTGGATATTAGTGCCACCTTTTTGGAAGTTTTCATCGTCTAAAATAAGATCATGTAACGGGATATTg < 1:857296/251‑1 (MQ=255) aTTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAACGTTCTTTAACACATTGAAAAACTTTGTTTTTTCTGACCGCACTTTattaaat > 1:601916/1‑126 (MQ=255) 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taataaAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAACGTTCTTTAACACATTGAAAAACTTTGTTTTTTCTGACCGCACTTTATTAAATTAAGTTAAGGCTAAATATGCGGCTTATTCGTGCATACCTAATTTTTTCTCCAAATAGTGGATATTAGTGCCACCTTTTTGGAAGTTTTCATCGTCTAAAATAAGATCATGTAACGGGATATTGGttt > 1:332367/1‑251 (MQ=255) ataaAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAACGTTCTTTAACACATTGAAAAACTTTGTTTTTTCTGACCGCACTTTATTAAATTAAGTTAAGGCTAAata > 1:432063/1‑139 (MQ=255) aaaaaaaaCCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAACGTTCTTTAACACATTGAAAAACTTTGTTTTTTCTGACCGCACTTTATTAAATTAAGTTAAGGCTAAATATGCGGCTTATTCGTGCATACCTAATTTTTTCTCCAAATAGTGGATATTAGTGCCACCTTTTTGGAAGTTTTCATCGTCTAAAAt > 1:483912/1‑212 (MQ=255) aaaaaaaaCCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAACGTTCTTTAACACATTGAAAAACTTTGTTTTTTCTGACCGCACTTTATTAAATTAAGTTAAGGCTAAATATGCGGCTTATTCGTGCATACCTAATTTTTTCTCCAAATAGTGGATATTAGTGCCACCTTTTTGGAAGTTTTCATCGTCTAAAATAAGATCATGTAACGGGATATTGGTTTTAAt > 1:95880/1‑242 (MQ=255) | ATACAATAAGACTCAATTTTGAAATTGAGTGTTTAAAATTACTCATAAAAAAACTCCTTAGAAATTAAAGTAATAGTCTAATATTTAATTAATAATCCCACTAAATTTTATAACTGCTTGAAATTTTTAAGTGGACGTAATCGCATAAACTGCTTGGGCAGTTTAACACAATAAACAAAATACGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCGGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAACGTTCTTTAACACATTGAAAAACTTTGTTTTTTCTGACCGCACTTTATTAAATTAAGTTAAGGCTAAATATGCGGCTTATTCGTGCATACCTAATTTTTTCTCCAAATAGTGGATATTAGTGCCACCTTTTTGGAAGTTTTCATCGTCTAAAATAAGATCATGTAACGGGATATTGGTTTTAAT > 1/129661‑130111 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |