| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 125,165 | T→C | K180K (AAA→AAG) | unknown ← | Fic domain protein, HP1159 type |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 125,165 | 0 | T | C | 99.1% | 309.1 / ‑4.9 | 109 | K180K (AAA→AAG) | unknown | Fic domain protein, HP1159 type |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (52/56); total (52/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.14e-01 | |||||||||||
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
TGTTTAAGCTGCGTCACCACCGCGTTCATGTCGGTTTCCGCATCAAACAAAGCAATCACATCCGTATTACCCCACAAACGGGTTTCCCCCTGCAGCGGCTCAAAAATCGGCGTGTCCTGACTGTCCATAAAAGTCACTGATACCGATCCGATTTCTTCTAAGAAATCACTGAGTTGCTCTGCCTTTTCGTTAGTACTGTTCAGGCGAATTTGAATCCAAGCCATACTTATTCCTTATTA‑TTTCCCGTAACCTTCGTAATAATAAGATTGCTCAATACCTTTAAAAATCATCTCACGGTTATTCACATCATCAGTCAAATTACTTTGTAATAAAAAGCGAATTTCCAAATCATTAATCGGACTGCGCTCCATAGCTTGTAAATACAACGTTTTATCTACATTTTGCCAATTAACCACTTTGCCTAAGTTTTTCTTTAAAATTAAATCTAACCAAATACGGGTTGAACGTCCATTTCCTTCCCAAAAC > 1/124926‑125411 | tGTTTAATCTGCGTCTCCTCCGCGTTCATGTCGGTTTCCGCATCAAACAAAGCAATCTCATCCATATTACCCCACAAACGGGTTTCCCCCTTCAGCGGCTCAAAAATCGGCGTGTCCTGACTGTCCATAAAAGTCACTGATTCCGATCCGATTTCTTCTAAGAAATCACTGAGTTGCACTGCCTTTTCGTTATTACTGTTCAGGCGAATTTGAATCCAAGCCATACTTATTCCTTATTA‑CTTCCCGTAAcc < 1:22821/251‑1 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ttatta‑CTTCCCGTAACCTTCGTAATAATAAGATTGCTCAATACCTTTAAAAATCATCTCACGGTTATTCACATCATCAGTCAAATTACTTTGTAATAAAAAGCGAATTTCCAAATCATTAATCGGACTGCGCTCCATAGCTTGTAAATACAACGTTTTATCTACATTTTGCCAATTAACCACTTTGCCTAAGTTTTTCTTTAAAATTAAATCTAACCAAATACGGGTTGAACGTCCATTTCCTTCCCaaa > 1:655601/1‑251 (MQ=255) atta‑ctTCCCGTAACCTTCGTAATAATAAGATTGCTCAATACCTTTAAAAATCATCTCACGGTTATTCACATCATCAGTCAAATTACTTTGTAATAAAAAGCGAATTTCCAAATCATTAATCGGACTGCGCTCCATAGCTTGTAAATACAACGTTTTATCTACATTTTGCCAATTAACCACTTTGCCTAAGTTTTTCTTTAAAATTAAATCTAACCAAATACGGGTTGAACGTCCATTTCCTTCCCAAAAc < 1:449871/251‑1 (MQ=255) atta‑ctTCCCGTAACCTTCGTAATAATAAGATTGCTCAATACCTTTAAAAATCATCTCACGGTTATTCACATCATCAGTCAAATTACTTTGTAATAAAAAGCGAATTTCCAAATCATTAATCGGACTGCGCTCCATAGCTTGTAAATACAACGTTTTATCTACATTTTGCCAATTAACCACTTTGCCTAAGTTTTTCTTTAAAATTAAATCTAACCAAATACGGGTTGAACGTCCATTTCCTTCCCAAAAc < 1:456347/251‑1 (MQ=255) | 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |