| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 885,651 | C→T | C17C (TGC→TGT) | unknown → | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 885,651 | 0 | C | T | 100.0% | 136.1 / NA | 46 | C17C (TGC→TGT) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (28/18); total (28/18) | |||||||||||
CTTTGTCGATCCGTATCTGAGCGAGAAGTAAGAAAAATTCGGAATGTGTAAAACTATTTCGGAAAATCAGGGTCAAACGGGCATTCTTGCTTCAGTCGCCATTTATATTAAAGCCACATATAGTTACACGTAATTCAGACTTTTAAGGTTGCTGTAGCGAGGCAATGATTCATCTATTTTCAACCTGAAGGAATATCATGTTAAAAAAATACTTACTTGTTTTACCGATTTCTATTTTAACCGCCTGCGCGGGTTATTATCCTTATCCGCAATTTGAACCCAGTTATCC‑GTCCTTTTCCGTGCAGCATAATGACGATGAAGAACATGCCGTTTTCAGCATCCGCCGCACGCATGAACCGAAATATCAGGATCCAAGATACAAAATTTCCACGGAAAACATGGAAAAATTCATTTTAGCCAAAAATAACCTGGAATATTGTTTGTTACCGGAATTGGGCAAGCAATCGGATAAACGTGTTACCGCCCTTGAAA > 1/885404‑885895 | cttTGTCGATCCGTATCTGAGCGAGAAGTAAGAAAAAGTCGGAAAGTGTAAAACTATTTCGAAAAAACAGGGTCAAACGGGCTTTCTTGCTTCAGTTGCCAT‑‑‑TA‑‑AAAGCCATATATGGTTATACGTAATTCAGGCTTTTAAGGTTGCTGCAGCGGGACAATAATTAATCTATTTCCACCCTGAAGAAATATCATGTAAAAAAAATCCTTACTTATTTTACCGATTTCTATTTTAACCGCCTGTGCCGGtt < 1:189979/250‑1 (MQ=255) 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CTTTGTCGATCCGTATCTGAGCGAGAAGTAAGAAAAATTCGGAATGTGTAAAACTATTTCGGAAAATCAGGGTCAAACGGGCATTCTTGCTTCAGTCGCCATTTATATTAAAGCCACATATAGTTACACGTAATTCAGACTTTTAAGGTTGCTGTAGCGAGGCAATGATTCATCTATTTTCAACCTGAAGGAATATCATGTTAAAAAAATACTTACTTGTTTTACCGATTTCTATTTTAACCGCCTGCGCGGGTTATTATCCTTATCCGCAATTTGAACCCAGTTATCC‑GTCCTTTTCCGTGCAGCATAATGACGATGAAGAACATGCCGTTTTCAGCATCCGCCGCACGCATGAACCGAAATATCAGGATCCAAGATACAAAATTTCCACGGAAAACATGGAAAAATTCATTTTAGCCAAAAATAACCTGGAATATTGTTTGTTACCGGAATTGGGCAAGCAATCGGATAAACGTGTTACCGCCCTTGAAA > 1/885404‑885895 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |