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| * | 1 | 879,216 | 0 | T | C | 100.0% | 204.1 / NA | 67 | N31S (AAC→AGC) | unknown | Type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF, TadA subfamily |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (42/25); total (42/25) | |||||||||||
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aaCCAGTTCGTTTACTAATGAGCTTCTTTCACTTTGAAGTTCATCAATCTTTTCAACATCAAGATTGCTCAATACTTCACTTCTAAGTAAGATTTTTTGTTGTTTGGTCAGCATGTTTAACCACTACTTATTGTTTAATGAGTTTTGTaa > 1:488547/1‑150 (MQ=255) ttACTAATGAGCTTCTTTCACTTTGAAGTTCATCAATCTTTTCAACATCAAGATTGCTCAATACTTCACTTCTAAGTAAGATTTTTTGTTGTTTGGTCAGCATGTTTAACCACTACTTATTGTTTAATGAGTTTTGTAAAAAATGAGGAAAATAAACTTTGTTTTTCTTTTGGCTTACTACTGCGAGATATTGCACCAATAACCTTTAACATTAGTGAATTAATTTCCTTTTTCCCATCACGACCTAAGtt < 1:328079/251‑1 (MQ=255) cTAATGAGCTTCTTTCACTTTGAAGTTCATCAATCTTTTCAACATCAAGATTGCTCAATACTTCACTTCTAAGTAAGATTTTTTGTTGTTTGGTCAGCATGTTTAACCACTACTTATTg > 1:244210/1‑119 (MQ=255) tAATGAGCTTCTTTCACTTTGAAGTTCATCAATCTTTTCAACATCAAGATTGCTCAATACTTCACTTCTAAGTAAGATTTTTTGGTGTTTGGTCAGCATGTTTAACCACTACTTATTGTTTAATGAGTTTTGTAAAAAATGAGGAAAATAAACTTTGTTTTTCTTTTGGCTTACTACTGCGAGATATTGCACCAATAACCTTTAACATTAGTGAATTAATTTCCTTTTTCCCATCACGACCTAAGTTAATg < 1:718472/251‑1 (MQ=255) | GAATACCGGCACGTTCAACCCAGATATCATTAGGGCCATTAACTAAGATATCATTTATAGTATCGTCAGCCACGAGATCCCGTAACGGACCATAACCCTCAATCTCATCAGCAACAATTTCAGCCATAACCAGTGCATCGGATGACGTCAAATAAGTGTTACTTTTATTGGCAATACGATTAACAATCTGAACCAGTTCGTTTACTAATGAGTTTCTTTCACTTTGAAGTTCATCAATCTTTTCAACATCAAGATTGCTCAATACTTCACTTCTAAGTAAGATTTTTTGTTGTTTGGTCAGCATGTTTAACCACTACTTATTGTTTAATGAGTTTTGTAAAAAATGAGGAAAATAAACTTTGTTTTTCTTTTGGCTTACTACTGCGAGATATTGCACCAATAACCTTTAACATTAGTGAATTAATTTCCTTTTTCCCATCACGACCTAAGTTAATG > 1/879004‑879459 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |