| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 872,996 | C→T | P427P (CCG→CCA) | unknown ← | Protein TadG, associated with Flp pilus assembly |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 872,996 | 0 | C | T | 100.0% | 369.6 / NA | 121 | P427P (CCG→CCA) | unknown | Protein TadG, associated with Flp pilus assembly |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (61/60); total (61/60) | |||||||||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
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ttgttgCATAATCCGGCATTCATTAATTTAACTAATGTACCTTTAGTTGGGCGATTATCTTCTCCATCAGATAACACCAGAAGTATGCGTCTTGTATTTGTATTAAGTTTGCTTGGTGTAGCTTCCGGATCTTTATTAGTATCCATCATAAGGTTAGTCCCTATAAACATACCTGAAGTAACAGCTGTCCCTCCGTCTGGAGTAATTTCGTTTAAAGCATTTGACACACCCGGTTTTTTCTTGTCAAACCa < 1:793469/251‑1 (MQ=255) gCATAATCCGGCATTCATTAATTTAACTAATGTACCTTTAGTTGGGCGATTATCTTCTCCATCAGATAACACCAGAAGTATGCGTCTTGTATTTGTATTAAGTTTGCTTGGTGTAGCTTCCGGATCTTTATTAGTATCCATCATAAGGt > 1:716800/1‑149 (MQ=255) aTCCGGCATTCATTAATTTAACTCATGTACCTTTAGTTGGTAGATTATCTTCTCCTTCAGATAACACCAGAAGTATGCGTCTTGTATTTGTATTAAGTTTGCTTGGTGTAGCTTCCGGATCTTTATTAg > 1:802135/1‑129 (MQ=255) aTCCGGCATTCATTAATTTAACTAATGTACCTTTAGTTGGGCGATTATCTTCTCCATCAGATAACACCAGAAGTATGCGTCTTGTATTTGTATTAAGTTTGCTTGGTGTAGCTTCCGGATCTTTATTAGTATCCATCATAAGGTTAGTCCCTATAAAc > 1:702237/1‑158 (MQ=255) aTCCGGCATTCATTAATTTAACTAATGTACCTTTAGTTGGGCGATTATCTTCTCCATCAGATAACACCAGAAGTATGCGTCTTGTATTTGTATTAAGTTTGCTTGGTGTAGCTTCCGGATCTTTATTAGTATCCATCATAAGGTTAGTCCCTATAAACATACCTGAAGTa < 1:578180/170‑1 (MQ=255) 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atAATGTACCTTTAGTTGGGCGATTATCTTCTCCATCAGATAACACCAGAAGTATGCGTCTTGTATTTGTATTAAGTTTGCTTGGTGTAGCTTCCGGATCTTTATTAGTATCCATCATAAGGCTAGTCACTATACACATACCTGACGTAAAAGCCGTCCCTCTGTCTGGGGTAATTTCGTTTAAGGCATTTGACACACGCGGTTATTTCTTGCCAAACCATGCTTGAGTTGTCTCTTTCCATTCGCattt > 1:426611/2‑250 (MQ=255) gTACCTTTAGTTGGGCGATTATCTTCTCCATCAGATAACACCAGAAGTATGCGTCTTGTATTTGTATTAAGTTTGCTTGGTGTAGCTTCCGGATCTTTATTAGTATc > 1:103711/1‑107 (MQ=255) gTACCTTTAGTTGGGCGATTATCTTCTCCATCAGATAACACCAGAAGTATGCGTCTTGTATTTGTATTAAGTTTGCTTGGTGTAGCTTCCGGATCTTTATTAGTATCCATCATAAGGTTAGTCCCTATAAACATACCTGAAGTAACAGCTGTCCCTCCGTCTGGAGTAATTTCGTTTAAAGCATTTGACACACCCGGTTTTTTCTTGTCAAACCATGCTTGAGTTGTCTCTTTCCCTTCGCTTTTCCCTaa > 1:744850/1‑251 (MQ=255) aCCTTTAGTTGGGCGATTATCTTCTCCATCAGATAACACCAGAAg > 1:217820/1‑45 (MQ=255) aCCTTTAGTTGGGCGATTATCTTCTCCATCAGATAACACCAGAAGTATGCGTCTTGTATTTGTATTAAGTTTGCTTGGTGTAGCTTCCGGATCTTTATTAGTATCCATCATAAGGTTAGTCCCTATAAACATACCTGAAGTAACAGCTGTCCCTCCGTCTGGAGTAATTTCGTTTAAAGCATTTGACACACCCGGTTTTTTCTTGTCAAACCATGCTTGAGt < 1:631644/222‑1 (MQ=255) aCCTTTAGTTGGGCGATTATCTTCTCCATCAGATAACACCAGAAGTATGCGTCTTGTATTTGTATTAAGTTTGCTTGGTGTAGCTTCCGGATCTTTATTAGTATCCATCATAAGGTTAGTCCCTATAAACATACCTGAAGTAACAGCTGTCCCTCCGTCTGGAGTAATTTCGTTTAAAGCATTTGACACACCCGGTTTTTTCTTGTCAAACCATGCTTGAGTTGTCTCTTTCCCTTCGCTTTTCCCTaaa > 1:790625/1‑250 (MQ=255) aCCTTTAGTTGGGCGATTATCTTCTCCATCAGATAACACCAGAAGTATGCGTCTTGTATTTGTATTAAGTTTGCTTGGTGTAGCTTCCGGATCTTTATTAGTATCCATCATAAGGTTAGTCCCTATAAACATACCTGAAGTAACAGCTGTCCCTCCGTCTGGAGTAATTTCGTTTAAAGCATTTGACACACCCGGTTTTTTCTTGTCAAACCATGCTTGAGTTGTCTCTTTCCCTTCGCTTTTCCCTAAAc < 1:786891/251‑1 (MQ=255) tAGTTGGGCGATTATCTTCTCCATCAGATAACACCAGAAGTATGCGTCTTGTATTTGTATTAAGTTTGCTTGGTGTAGCTTCCGGATCTTTATTAGTATCCATCATAAGGTTAGTCCCTATAAACATACCTGAAGTAACAGCTGTCCCTCCGTCTGGAGTAATTTCGTTTAAAGCATTTGACACACCCGGTTTTTTCTTGTCAAACCATGCTTGAGTTGtct < 1:621993/222‑1 (MQ=255) | AAAACTAATGATTTGTCTGAAAGCATCTAATAATCCCTGCTTACTGAATACAGGATAATATTGTTTACCGACGCACTGTTTCCATACGTTTACTTGATCTTGGGGTGGATTATAACCAAGTGCAACAAAAGCAACGCGTGCTTCCACTTTAGGGTACTTAGTATCTTGTAATGAGTCAATCTTTCCTTTAATTTTGTTGCATAATCCGGCATTCATTAATTTAACTAATGTACCTTTAGTCGGGCGATTATCTTCTCCATCAGATAACACCAGAAGTATGCGTCTTGTATTTGTATTAAGTTTGCTTGGTGTAGCTTCCGGATCTTTATTAGTATCCATCATAAGGTTAGTCCCTATAAACATACCTGAAGTAACAGCTGTCCCTCCGTCTGGAGTAATTTCGTTTAAAGCATTTGACACACCCGGTTTTTTCTTGTCAAACCATGCTTGAGTTGTCTCTTTCCCTTCGCTTTTCCCTAAAC > 1/872756‑873237 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |