| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 872,390 | C→T | noncoding (46/77 nt) | unknown ← | tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 872,390 | 0 | C | T | 100.0% | 126.3 / NA | 43 | noncoding (46/77 nt) | unknown | tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (17/26); total (17/26) | |||||||||||
TTGGTAAAACCAACTCTTTTGTCTACTATGCCTATTTTTAGTACCTAGAAAATCACTAAATTCCCCTGATAGGGTACTATATCAGGTACTAAAACTAAAATGAATCAAAAAAAGCATAATACACTATGGAAATGATTAAATATGTTAATTTATAAGTGGTTTTGGTTTGACTTGAATCAGAGTGAAGTAGTATGGATTAATATGTTGGTGCCCCCAACAGGACTTGAACCTGTGACCAATCGATTATGAGTCGACTGCTCTGACCGACTGAGCTATGGGGGCGGTGTGAGCGTAGAATTAAGGCGCGATTATAGGGAAATATCGGGGTAAAGTCCAGAATATTATGTGTTATTTAAAGTGCGGTTGCTTTTACCGGCGTTTTTAATGTTCAAAAACGTGGAAAAATTATTTGCCCTTTGAAAAGTCAGGTTGTTCCTTGTGATTTTAGCTGATTAGCTTTTGTGATGAGGTCATTTTTT > 1/872154‑872632 | aaaccaactcttttgtctactatgcctatttttagtacctagaaaatcactaaattcccctgatagggtactatatcaggtactaaaggTAAAACTAAAATGAATCAAAAAAAGCATAATACACTATGGAAATGATTAAATATGTTAATTTATAAGTGGTTTTGGTTTGACTTGAATCAGAGTGAAGTAGTATGGATTAATATGTTGGTGCCCCCAACAGGACTTGAACCTGTGACTAATCGATTATGAGt < 1:293933‑M2/162‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) gagTGAAGTAGTATGGATTAATATGTTGGTGCCCCCAACAGGACTTGAACCTGTGACTAATCGATTATGAGTCGACTGCTCTGACCGACTGAGCTATggggg < 1:284114/102‑1 (MQ=255) gagTGAAGTAGTATGGATTAATATGTTGGTGCCCCCAACAGGACTTGAACCTGTGACTAATCGATTATGAGTCGACTGCTCTGACCGACTGAGCTATGGGGGCGGTGTGAGCGTAGAATTAAGGCGCCATTATAgg > 1:667713/1‑136 (MQ=255) agTGAAGTAGTATGGATTAATATGTTGGTGCCCCCAACAGGACTTGAACCTGTGACTAATCGATTATGAGTCGACTGCTCTGACCGACTGAGCTATGGGGGCGGTGTGAGCGTAGAATTAAGGCGCCATTATAGGGAAATATTGGGGTAAAGTCCAGAATATTATGTGTTATTTAAAGTGCGGTTGCTTTTACCGGCGTTTTTAATGTTCAAAAACGTGGAAAAATTATTTGCCCTTTGAAAAGTCAGgt < 1:338876/250‑1 (MQ=255) aaGTAGTATGGATTAATATGTTGGTGCCCCCAACAGGACTTGAACCTGTGACTAATCGATTATGAGTCGACTGCTCTGACCGACTGAGCTATGGGGGCGGTGTGAGCGTAGAATTAAGGCGCCATTATAGGGAAATATTGGGGTAAAGTCCAGAATATTATGTGTTATTTAAAGTGCGGTTGCTTTTACCGGCGTTTTTAATGTTCAAAAACGTGGAAAAATTATTTGccc > 1:234240/1‑231 (MQ=255) 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(MQ=255) aCTTGAACCTGTGACTAATCGATTATGAGTCGACTGCTCTGACCGACTGAGCTATGGGGGCGGTGTGAGCGTAGAATTAAGGCGCCATTATAGGGAAATATTGGGGTAAAGTCCAGAat < 1:253778/119‑1 (MQ=255) ccTGTGACTAATCGATTATGAGTCGACTGCTCTGACCGACTGAGCTATGGGGGCGGTGTGAGCGTAGAATTAAGGCGCCATTATAGGGAAATATTGGGGTAAAGTCCAGAATATTATGTGTTATTTAAAGTGCGGTTGCTTTTACCGGCGTTTTTAATGTTCAAAAACGTGGAAAAATTATTTGCCCTTTGAAAAGTCAGGTTGTTCCTTGTGATTTTAGCTGATTAGCTTTTGTGATGAGGTCAtttttt < 1:219756/251‑1 (MQ=255) gtgACTAATCGATTATGAGTCGACTGCTCTGACCGACTGAGCTATGGGGGCGGTGTGAGCGTAGAATTAAGGCGCCATTATAGGGAAATATTGGGGTAAAGTCCAGAat > 1:566210/1‑109 (MQ=255) | TTGGTAAAACCAACTCTTTTGTCTACTATGCCTATTTTTAGTACCTAGAAAATCACTAAATTCCCCTGATAGGGTACTATATCAGGTACTAAAACTAAAATGAATCAAAAAAAGCATAATACACTATGGAAATGATTAAATATGTTAATTTATAAGTGGTTTTGGTTTGACTTGAATCAGAGTGAAGTAGTATGGATTAATATGTTGGTGCCCCCAACAGGACTTGAACCTGTGACCAATCGATTATGAGTCGACTGCTCTGACCGACTGAGCTATGGGGGCGGTGTGAGCGTAGAATTAAGGCGCGATTATAGGGAAATATCGGGGTAAAGTCCAGAATATTATGTGTTATTTAAAGTGCGGTTGCTTTTACCGGCGTTTTTAATGTTCAAAAACGTGGAAAAATTATTTGCCCTTTGAAAAGTCAGGTTGTTCCTTGTGATTTTAGCTGATTAGCTTTTGTGATGAGGTCATTTTTT > 1/872154‑872632 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |