| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 869,732 | T→C | F240F (TTT→TTC) | unknown → | Sodium‑dependent transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 869,732 | 0 | T | C | 100.0% | 229.4 / NA | 78 | F240F (TTT→TTC) | unknown | Sodium‑dependent transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (35/43); total (35/43) | |||||||||||
CCGTTTGGCTAATTACTTTATTGATTTTATCCCTCGGTGTACAAAAAGGTGTTGCGCGCACTTCTGTGATTTTTATGCCAATTTTAGTCATCATGTTTGTCACTTTAATGGTTTATTCCTTATTTTTACCGGGCGCAGAAAAAGGGTTGGATGCCCTGTTCTCGCCGGATTGGGATAAATTAAAAGACCCGAGCGTCTGGATTGCCGCTTACGGACAAATATTCTTCTCCCTTTCCATTTGTTTTGGTATTATGGTGACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGCAATTATTAGG > 1/869488‑869977 | ccGTTTGGCTAATTACTTTATTGATTTTATCCCTCGGTGTACAAAAAGGTGTTGCGCGCACTTCTGTGATTTTTATGCCAATTTTAGTCATCATGTTTGTCACTTTAATGGTTTATTCCTTATTTTTACCGGGCGCAGAAAAAGGGTTGGATGCCCTGTTCTCGCCGGATTGGGATAAATTAAAAGACCCGAGCGTCTGGATTGCCGCTTACGGACAAATATTCTTCTCCCTTTCCATTTGTTTCGGtatt > 1:269313/1‑251 (MQ=255) 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tAAAAGACCCGAGCGTCTGGATTGCCGCTTACGGACAAATATTCTTCTCCCTTTCCATTTGTTTCGGTATTATGGTGACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGt > 1:357597/1‑251 (MQ=255) aaaaGACCCGAGCGTCTGGATTGCCGCTTACGGACAAATATTCTTCTCCCTTTCCATTTGTTTCGGTATTATGGTGACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCACCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGtc < 1:876590/251‑1 (MQ=255) aCCCGAGCGTCTGGATTGCCGCTTACGGACAAATATTCTTCTCCCTTTCCATTTGTTTCGGTATTATGGTGACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGcc > 1:685017/1‑203 (MQ=255) cGTCTGGATTGCCGCTTACGGACAAATATTCTTCTCCCTTTCCATTTGTTTCGGTATTATGGTGACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGcc > 1:827705/1‑244 (MQ=255) ccGCTTACGGACAAATATTCTTCTCCCTTTCCATTTGTTTCGGTATTATGGTGACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAAcc < 1:63792/251‑1 (MQ=255) ccGCTTACGGACAAATATTCTTCTCCCTTTCCATGTGTTTCGGTATTATGGTGGCCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAAcc < 1:103769/251‑1 (MQ=255) gACAAATATTCTTCTCCCTTTCCATTTGTTTCGGTATTATGGTGACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGcc > 1:650703/1‑134 (MQ=255) 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ttcttcTCCCTTTCCATTTGTTTCGGTATTATGGTGACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGt < 1:884724/210‑1 (MQ=255) ccTTTCCATTTGTTTCGGTATTATGGTGACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGc < 1:34758/251‑1 (MQ=255) ccTTTCCATTTGTTTCGGTATTATGGTGACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGc < 1:146610/251‑1 (MQ=255) ttCCATTTGTTTCGGTATTATGGTGACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAAcc < 1:74468/64‑1 (MQ=255) 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CCGTTTGGCTAATTACTTTATTGATTTTATCCCTCGGTGTACAAAAAGGTGTTGCGCGCACTTCTGTGATTTTTATGCCAATTTTAGTCATCATGTTTGTCACTTTAATGGTTTATTCCTTATTTTTACCGGGCGCAGAAAAAGGGTTGGATGCCCTGTTCTCGCCGGATTGGGATAAATTAAAAGACCCGAGCGTCTGGATTGCCGCTTACGGACAAATATTCTTCTCCCTTTCCATTTGTTTTGGTATTATGGTGACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGCAATTATTAGG > 1/869488‑869977 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |