| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 833,990 | T→C | C279R (TGC→CGC) | unknown → | Transcriptional regulator, LysR family |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 833,990 | 0 | T | C | 100.0% | 191.1 / NA | 68 | C279R (TGC→CGC) | unknown | Transcriptional regulator, LysR family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (35/33); total (35/33) | |||||||||||
AACCCGAAAATTTCTTTTACAGCAATTTTCAAAAGATCAGATTTCTCTGCTTAAGTTTATGGAAATCAATAGTTTAGAAGGTATTAAACGTTGTGTAATGAATGGATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAATGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCACTTTCTGAATTGAGTGGTTTTAGAACGAAATCATTATTCTATTGTCACACTGAATTAGCAATGCGGAGGTGTAAAACAAACATTTGAGCCTCTTGTCCAAAAACAGTATGCTATG > 1/833758‑834227 | aaCCCGAAAATTTCTTTTACAGCAATTTTCAAAAGATCAGATTTCTCTGCTTAAGTTTATGGAAATCAATAGTTTAGAAGGTATTAAACGTTGTGTAATGAATGGATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTg > 1:635717/1‑251 (MQ=255) ttttCAAAAGATCAGATTTCTCTGCTTAAGTTTATGGAAATCAATAGTTTAGAAGGTATTAAACGTTGTGTAATGAATGGATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACAt < 1:562390/251‑1 (MQ=255) ttttCAAAAGATCAGATTTCTCTGCTTAAGTTTATGGAAATCAATAGTTTAGAAGGTATTAAACGTTGTGTAATGAATGGATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACAt < 1:196261/251‑1 (MQ=255) tttCAAAAGATCAGATTTCTCTGCTTAAGTTTATGGAAATCAATAGTTTAGAAGGTATTAAACGTTGTGTAATGAATGGATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACGGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTggt > 1:851653/1‑226 (MQ=255) aTCAGATTTCTCTGCTTAAGTTTATGGAAATCAATAGTTTAGAAGGTATTAAACGTTGTGTAATGAATGGATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAaat < 1:65193/249‑1 (MQ=255) aTTTCTCTGCTTAAGTTTATGGAAATCAATAGTTTAGAAGGTATTAAACGTTGTGTAATGAATGGATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATcc < 1:183571/249‑1 (MQ=255) tctcTGCTTAAGTTTATGGAAATCAATAGTTTAGAAGGTATTAAACGTTGTGTAATGAATGGATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGat < 1:864981/251‑1 (MQ=255) aTGGAAATCAATAGTTTAGAAGGTATTAAACGTTGTGTAATGAATGGATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGat > 1:796904/1‑236 (MQ=255) aaTCAATAGTTTAGAAGGTATTAAACGTTGTGTAATGAATGGATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACAt < 1:366483/213‑1 (MQ=255) aaTCAATAGTTTAGAAGGTATTAAACGTTGTGTAATGAATGGATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGaaaa < 1:792916/238‑1 (MQ=255) aaTCAATAGTTTAGAAGGTATTAAACGTTGTGTAATGAATGGATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGaaaa < 1:594939/238‑1 (MQ=255) aaTCAATAGTTTAGAAGGTATTAAACGTTGTGTAATGAATGGATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAAtt > 1:703200/1‑251 (MQ=255) cAATAGTTTAGAAGGTATTAAACGTTGTGTAATGAATGGATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAAc > 1:184184/1‑208 (MQ=255) gTTTAGAAGGTATTAAACGTTGTGTAATGAATGGATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGc < 1:303477/195‑1 (MQ=255) gTTTAGAAGGTATTAAACGTTGTGTAATGAATGGATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGc > 1:110663/1‑195 (MQ=255) gTTTAGAAGGTATTAAACGTTGTGTAATGAATGGATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTa > 1:40409/1‑251 (MQ=255) gTATTAAACGTTGTGTAATGAATGGATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAaat < 1:129830/204‑1 (MQ=255) gTATTAAACGTTGTGTAATGAATGGATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAaat < 1:226163/204‑1 (MQ=255) gTATTAAACGTTGTGTAATGAATGGATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTa > 1:63701/1‑251 (MQ=255) aCGTTGTGTAATGAATGGATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAg < 1:784744/216‑1 (MQ=255) tgtgTAATGAATGGATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAAt < 1:31838/251‑1 (MQ=255) gtgtAATGAATGGATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACAt < 1:625169/184‑1 (MQ=255) gtgtAATGAATGGATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAaataa < 1:778792/194‑1 (MQ=255) gtgtAATGAATGGATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAAt > 1:33754/1‑250 (MQ=255) gtAATGAATGGATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAaat < 1:758771/190‑1 (MQ=255) gtAATGAATGGATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGaaaa > 1:356915/1‑247 (MQ=255) atgaatgGATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTaa > 1:440083/1‑250 (MQ=255) ggATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTTAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAaat < 1:827763/181‑1 (MQ=255) gATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGTCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGaaaa < 1:204729/197‑1 (MQ=255) gATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCa > 1:789008/1‑251 (MQ=255) gATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCa > 1:497446/1‑251 (MQ=255) ttCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCACTTTCTGAAt < 1:182691/251‑1 (MQ=255) ttCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCACTTTCTGAAt < 1:660948/251‑1 (MQ=255) ttCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCACTTTCTGAAt < 1:883761/251‑1 (MQ=255) ccATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAAtt > 1:867463/1‑198 (MQ=255) ttttCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCACTTTCTGAATTGAGTGGTTTTAGAAc < 1:789791/251‑1 (MQ=255) cTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCACTTTCTg < 1:488349/214‑1 (MQ=255) cTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCACTTTCTGAATTGAGTGGTTTTAGAACGAAATCATTATTCTATTg > 1:870229/1‑251 (MQ=255) gAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTggg > 1:494242/1‑103 (MQ=255) aaaTGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCACTTTCTGAATTGAGTGGTTTTAGAACGAAATCATTATTCTATTGTcac < 1:840993/251‑1 (MQ=255) gggTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCACTTTCTGAATTGAGTGGTTTTAGAACGAAATCATTATTCTATTGTcaca > 1:277885/1‑248 (MQ=255) ggTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTg < 1:288323/111‑1 (MQ=255) aTGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCACttt > 1:572697/1‑199 (MQ=255) aTGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCACTTTCTg > 1:233024/1‑202 (MQ=255) aTGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCACTTTCTGAATTGAGTGGTTTTAGAACGAAATCATTATTCTATTGTCACACTGAAtt > 1:659624/1‑251 (MQ=255) gTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAaataa > 1:659220/1‑124 (MQ=255) gTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCACTTTCTGAATTGAGTGGTTTTAGAACGAAATCATTATTCTATTGTCACACTGAATTAg > 1:809167/1‑251 (MQ=255) gTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCACTTTCTGAATTGAGTGGTTTTAGAACGAAATCATTATTCTATTGTCACACTGAATTAg > 1:642148/1‑251 (MQ=255) gTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCACTTTCTGAATTGAGTGGTTTTAGAACGAAATCATTATTCTATTGTCACACTGAATTAg > 1:582667/1‑251 (MQ=255) ttGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCACTTTCTGAATTGAGTGGTTTTAGAACGAAATCATTATTCTATTGTCACACTGAATTAGc < 1:728846/251‑1 (MQ=255) gCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCACTTTCTGAATTGAGTGGTTTTAGAACGAAATCATTATTCTATTGTCACACTGAATTAGCAATGCg > 1:234131/1‑251 (MQ=255) cTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCACTTTCTGAATTGAGTGGTTTTAGAACGAAATCATTATTc < 1:699181/224‑1 (MQ=255) cTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCACTTTCTGAATTGAGTGGTTTTAGAACGAAATCATTATTc > 1:535118/1‑224 (MQ=255) gTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCACTTTCTg < 1:518754/190‑1 (MQ=255) gTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCACTTTCTGAATTGAGTGGTTTTAGAACGAAATCATTATTCTATTGTCACACTGAATTAGc > 1:206977/1‑229 (MQ=255) aCGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAaat > 1:162093/1‑86 (MQ=255) ggATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCACTTTCTGAATTGAGTGGTTTTAGAACGAAATCATTATTCTATTGTCACACTGAATTAGCAATGCGGAGGTGTAAAACAAACATTTGAGCctct > 1:876131/1‑245 (MQ=255) aaaTTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCACTTTc < 1:436434/153‑1 (MQ=255) aaaTTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCACTTTCTg < 1:323388/155‑1 (MQ=255) aaaTTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCACTTTCTGAATTGAGTGGTTTTAGAACGAAATCATTATTCTATTGTCACACTGAATTAGCAATGCGGAgg < 1:825966/217‑1 (MQ=255) aaaTTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCACTTTCTGAATTGAGTGGTTTTAGAACGAAATCATTATTCTATTGTCACACTGAATTAGCAATGCGGAGGTGTAAAACAAACATTTGAGCCTCTTg > 1:16573/1‑243 (MQ=255) aTTATATTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCACTTTCTGAATTGAGTGGTTTTAGAACGAAATCATTATTCTATTGTCACACTGAATTAGCAATGCGGAGGTGTaa > 1:730784/1‑220 (MQ=255) atatTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAaat < 1:465577/72‑1 (MQ=255) atatTTACCATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAaat > 1:728539/1‑72 (MQ=255) ccATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCAt > 1:85324/1‑72 (MQ=255) ccATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCACTTTCTGAATTGAGTGGTTTTAGAACGAAATCATTATTCTATTGTCACACTGAATTAGCAATGCGGAGGTGTAAAACAAACATTTGAGCct > 1:680464/1‑227 (MQ=255) ccATAAAGAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCACTTTCTGAATTGAGTGGTTTTAGAACGAAATCATTATTCTATTGTCACACTGAATTAGCAATGCGGAGGTGTAAAACAAACATTTGAGCCTCTTGTCCAAAAACAGtatgctatg > 1:447434/1‑251 (MQ=255) gAAAAACGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCACTTTCTGAATTGAGTGGTTTTAGAACGAAATCATTATTCTATTGTCACACTGAATTAGCAATGCGGAGGTGTAaaac < 1:614171/206‑1 (MQ=255) | AACCCGAAAATTTCTTTTACAGCAATTTTCAAAAGATCAGATTTCTCTGCTTAAGTTTATGGAAATCAATAGTTTAGAAGGTATTAAACGTTGTGTAATGAATGGATTAGGGGTTTCCATTATTTCTCGATTTTCCGTTGAAAACGAACTGAAAATGGGTATGTTGAAGGCTGTAGAATTAGACAGTTTTCAATTTAAACGTGGGATAAATTATATTTACCATAAAGAAAAATGCCTTTCATCAGCAATTGGGCGATTTATTGGGCTGTTGAACATACTTAAATAATCCATGATATGAAAAAGTGCGGTTAATTTGCGATTAATTTTGTTAAGTATGAAAATCGTAACGACCTCACTTTCTGAATTGAGTGGTTTTAGAACGAAATCATTATTCTATTGTCACACTGAATTAGCAATGCGGAGGTGTAAAACAAACATTTGAGCCTCTTGTCCAAAAACAGTATGCTATG > 1/833758‑834227 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |