| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 816,460 | C→T | A422A (GCG→GCA) | unknown ← | Inner membrane component of TAM transport system |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 816,460 | 0 | C | T | 100.0% | 230.2 / NA | 80 | A422A (GCG→GCA) | unknown | Inner membrane component of TAM transport system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (36/44); total (36/44) | |||||||||||
GCTTTGCCTTGTGAGCTTAATTTGCCTGATAACTGGGCCGGGAAGACGGATAAGTATTTGCCCACATTGATTTTTGCCAACTGCAAATGGCTGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACCGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGCCTTATCGGCGGTGAAATGTAGCGTTAATGGCAATTTCGGCGCAGCAGGTTGTGCCTGCGCTTCCAGTGTCGTTTC‑TAAGGCACCCTGGGTTTGCAGGGAAAGTGCGGTCTGTTTTTTCAGCGATCCTGAAAGCGTTAGAT > 1/816215‑816701 | gCTTTGCCTTGTGAGCTTAATTTGCCTGATAACTGGGCCGGGAAGACGGATAAGTATTTGCCCACATTGATTTTTGCCAACTGCAAATGGCTGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCAc < 1:699222/250‑1 (MQ=255) tGCCTTGTGAGCTTAATTTGCCTGATAACTGGGCCGGGAAGACGGATAAGTATTTGCCCACATTGATTTTTGCCAACTGCAAATGGCTGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACttttt > 1:889797/1‑251 (MQ=255) gCCTTGTGAGCTTAATTTGCCTGATAACTGGGCCGGGAAGACGGATAAGTATTTGCCCACATTGATTTTTGCCAACTGCAAATGGCTGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTa > 1:860619/1‑251 (MQ=255) cTTGTGAGCTTAATTTGCCTGATAACTGGGCCGGGAAGACGGATAAGTATTTGCCCACATTGATTTTTGCCAACTGCAAATGGCTGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAg < 1:441950/251‑1 (MQ=255) cTTGTGAGCTTAATTTGCCTGATAACTGGGCCGGGAAGACGGATAAGTATTTGCCCACATTGATTTTTGCCAACTGCAAATGGCTGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAg < 1:140516/251‑1 (MQ=255) cTTGTGAGCTTAATTTGCCTGATAACTGGGCCGGGAAGACGGATAAGTATTTGCCCACATTGATTTTTGCCAACTGCAAATGGCTGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAg < 1:849340/251‑1 (MQ=255) gCTTAATTTGCCTGATAACTGGGCCGGGAAGACGGATAAGTATTTGCCCACATTGATTTTTGCCAACTGCAAATGGCTGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACtt > 1:308848/1‑251 (MQ=255) cTTAATTTGCCTGATAACTGGGCCGGGAAGACGGATAAGTATTTGCCCACATTGATTTTTGCCAACTGCAAATGGCTGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACt < 1:500399/249‑1 (MQ=255) tAACTGGGCCGGGAAGACGGATAAGTATTTGCCCACATTGATTTTTGCCAACTGCAAATGGCTGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAAt > 1:370344/1‑251 (MQ=255) cTGGGCCGGGAAGACGGATAAGTATTTGCCCACATTGATTTTTGCCAACTGCAAATGGCTGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAAtctc < 1:216152/251‑1 (MQ=255) ccGGGAAGACGGATAAGTATTTGCCCACATTGATTTTTGCCAACTGCAAATGGCTGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTc < 1:206950/250‑1 (MQ=255) cGGGAAGACGGATAAGTATTTGCCCACATTGATTTTTGCCAACTGCAAATGGCTGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCaa > 1:171118/1‑251 (MQ=255) cGGGAAGACGGATAAGTATTTGCCCACATTGATTTTTGCCAACTGCAAATGGCTGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAAACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCaa > 1:73023/1‑251 (MQ=255) gATAAGTATTTGCCCACATTGATTTTTGCCAACTGCAAATGGCTGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAaca > 1:492263/1‑250 (MQ=255) gATAAGTATTTGCCCACATTGATTTTTGCCAACTGCAAATGGCTGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCCGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAAtc < 1:873566/233‑1 (MQ=255) aTAAGTATTTGCCCACATTGATTTTTGCCAACTGCAAATGGCTGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAacac < 1:197431/250‑1 (MQ=255) aTAAGTATTTGCCCACATTGATTTTTGCCAACTGCAAATGGCTGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAacac < 1:513101/250‑1 (MQ=255) aaGTATTTGCCCACATTGATTTTTGCCAACTGCAAATGGCTGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAg < 1:878929/251‑1 (MQ=255) gTATTTGCCCACATTGATTTTTGCCAACTGCAAATGGCTGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAAtctc > 1:541342/1‑230 (MQ=255) gTATTTGCCCACATTGATTTTTGCCAACTGCAAATGGCTGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGAt > 1:265142/1‑251 (MQ=255) gTATTTGCCCACATTGATTTTTGCCAACTGCAAATGGCTGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGAt > 1:570207/1‑251 (MQ=255) gTATTTGCCCACATTGATTTTTGCCAACTGCAAATGGCTGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGAt > 1:740696/1‑251 (MQ=255) tATTTGCCCACATTGATTTTTGCCAACTGCAAATGGCTGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGAt < 1:8975/250‑1 (MQ=255) caTTGATTTTTGCCAACTGCAAATGGCTGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTg > 1:754691/1‑250 (MQ=255) caTTGATTTTTGCCAACTGCAAATGGCTGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTg > 1:330393/1‑250 (MQ=255) cAACTGCAAATGGCTGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTAt < 1:810720/251‑1 (MQ=255) cTGCAAATGGCTGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGt > 1:133073/1‑251 (MQ=255) gCAAATGGCTGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTa > 1:110656/1‑251 (MQ=255) cAAATGGCTGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTa < 1:674778/250‑1 (MQ=255) tGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTGACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTAt < 1:792887/251‑1 (MQ=255) gTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCGAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTAtt > 1:467984/1‑251 (MQ=255) gTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAat > 1:566068/1‑198 (MQ=255) gTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACg < 1:97736/245‑1 (MQ=255) gTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTAtt > 1:420211/1‑251 (MQ=255) ccAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATtgtg < 1:205165/251‑1 (MQ=255) aGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACgg < 1:744614/241‑1 (MQ=255) gCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGc < 1:301624/248‑1 (MQ=255) aaTGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGAACTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGCCTTAt < 1:590940/251‑1 (MQ=255) tGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGCCTTATcg < 1:17591/251‑1 (MQ=255) aGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGCCTTATCGGCGGTGAGATGt > 1:392230/1‑251 (MQ=255) gTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGCCTTATCGGCGGTGGAATGTa > 1:622743/1‑251 (MQ=255) gCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCAc < 1:371988/125‑1 (MQ=255) gCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTAt > 1:727307/1‑203 (MQ=255) ttGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACCCCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGCCTTATcggcgggtttattaaagggtttctgta > 1:429771/1‑230 (MQ=255) ttGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCttt > 1:636986/1‑198 (MQ=255) gTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGc > 1:137162/1‑217 (MQ=255) aTTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGc < 1:748445/214‑1 (MQ=255) cACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAata > 1:76120/1‑146 (MQ=255) aCTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAacac < 1:615390/153‑1 (MQ=255) aCGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCTCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGCCTTATCGGCGGTGAAATGTAGCGTTAATGGCAATTTCGGCGCAGCAGGTTGTGcc < 1:431394/251‑1 (MQ=255) cgTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTAt < 1:143164/188‑1 (MQ=255) cgTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGCCTTATCGGCGGTGGAATGTAGGGGTTATGGGAATTTTGGCgcagccgggtgttccct > 1:434784/1‑238 (MQ=255) aaGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGcc < 1:190780/190‑1 (MQ=255) aaGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGc > 1:298185/1‑189 (MQ=255) tttCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGc < 1:848031/172‑1 (MQ=255) ttCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGCCTTATCGGCGGTGAAATGTAGCGTTAATGGCAATTTCGGCGCAGCAGGTTGTGCCTGCGCTTCCAGTGTCGTTTC‑TAAgg < 1:613052/251‑1 (MQ=255) acaTTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACAcc > 1:496616/1‑120 (MQ=255) ggATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATc < 1:31434/138‑1 (MQ=255) ggATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGc < 1:645228/162‑1 (MQ=255) ggATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGCCTTATCGGCGGTGAAAAGTAGCGGTAATTGGAATTTTGGCGCCGCAGGGTGTGGCTGCGCCTCCAGTGGCGTTTC‑TAAGGCACCCCggg > 1:862749/1‑251 (MQ=255) aaTGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGATTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACTCCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGCCTTATCGGCGGTGAAATGTAGCGTTAATGGCAATTTCGGCGCAGCAGGTTGTGCCTGCGCTTCCAGTGTCGTTTC‑TAAGGCACCCTGGGTTTGc < 1:735722/251‑1 (MQ=255) ggCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGCCTTATCGGCGGTGGAATGTAGCGGTTATGGCAATTTTTGCGCAGCAGGGTGTGCCCGCGCTTCCCGGGTCGTTTT‑TTAGGCACCCTGGGttttccgg > 1:170743/1‑246 (MQ=255) ggCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGCCTTATCGGCGGTGAAATGTATCGTTAATGGCAATTTTTGCGCCGCCGGGTGTGCCTTCGCTTTCCGTGTCGTTTCTTAAGGC‑CCCCGGGGTTGCAgg > 1:521095/1‑251 (MQ=255) gCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGCCTTATCGGCGGTGAAATGTAGCGTTAATGGCAATTTCGGCGCAGCAGGTTGTGCCTGCGCTTCCAGTGTCGTTTC‑TAAGGCACCCTg < 1:40505/240‑1 (MQ=255) cTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGCCTTATCGGCGGTGGAATTTAGCGGTAATTGCAATTTTGGCGCAGCAGGGTGTGGCTGCGCTTCCAGGGTCGTTTT‑TTAAGCACCCTGGGGTTGCAgggg > 1:679264/1‑250 (MQ=255) gTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATc < 1:222013/100‑1 (MQ=255) tAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGCCTTATCGGCGGTGAAATGTAGCGTTAATGGCAATTTCGGCGCAGCAGGTTGTGCCTGCGCTTCCAGTGTCGTTTC‑TAAGGCACCCTGGGTTTGCAGGGAAAGTGCGGTc < 1:171063/250‑1 (MQ=255) aTTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGCCTTATCGGCGGTGAAATGt < 1:183848/158‑1 (MQ=255) aTTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGCCTTATCGGCGGTGAAATGTTGCGTTTATAGCAATTTTTGCGCCGCAGGGTGTGGCTGCGCCTCCCGTGTCGTTTT‑TCATGCCCCCCGGGGTTGCGGGGGAAGTGCggg > 1:299572/1‑246 (MQ=255) aTTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGCCTTATCGGCGGTGAAAAGTAGGGTTTATTGGAATTTTTGCGCAGCAGGGTGTGGCTGCGCTTCCCGGGTCGTTTC‑TTATGCAcccctggggtgtaggggaagtggggg > 1:579005/1‑224 (MQ=255) ttAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGCCTTATCGGCGGTGAAATGTAGCGTTAATGGCAATTTCGGCGCAGCAGGTTGTGCCTGCGCTTCCAGTGTCGTTTC‑TAAGGCACCCTGGGTTTGCAGGGAAAGTGCGGTCTGttt < 1:211246/251‑1 (MQ=255) gagTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGCCTTATCGGCGGTGGAATATAGGGGTAATGGCAATTTCTGGGCCGCCGGGTGTGCCTGCGCTTCCCGTGGCGTTTT‑TTAAGCACCCTGGGTTTTTAGGGGAAGAGCGGTCTGttttttt > 1:385807/1‑250 (MQ=255) aaTTCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGCCTTATCGGCGGTGAAATGTAGCGTTAATGGCAATTTCGGCGCAGCAGGTTGTGCCTGCGCTTCCAGTGTCGTTTC‑TAAGGCACCCTGGGTTTGCAGGGAAAGTGCGGTCTGTTTTTTCAGCGATCCTGaaa < 1:729282/251‑1 (MQ=255) ttCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGCCTTATCGGCGGTGAAATGTAGCGTTAATGGCAATTTCGGCGCAGCAGGTTGTGCCTGCGCTTCCAGTGTCGTTTC‑TAAGGCACCCTGGGTTTGCAGGGAAAGTGCGGTCTGTTTTTTCAGCGATCCTGAAAGc < 1:725119/251‑1 (MQ=255) ttCCCATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGCCTTATCGGCGGTGAAATGTAGCGTTAATGGCAATTTCGGCGCAGCAGGTTGTGCCTGCGCTTCCAGTGTCGTTTC‑TAAGGCACCCTGGGTTTGCAGGGAAAGTGCGGTCTGTTTTTTCAGCGATCCTGAAAGc < 1:789766/251‑1 (MQ=255) tCCCATGCCACTGACTGCACTTTCTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGCCTTATCGGCGGTGAAATGTAGCGTTAATGGCAATTTCGGCGCAGCAGGTTGTGCCTGCGCTTCCAGTGTCGTTTC‑t < 1:425265/193‑1 (MQ=255) cccATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGcc < 1:595989/117‑1 (MQ=255) cccATGCCACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGCCTTATCGGCGGTGAAATGTAGCGTTAATGGCAATTTCGGCGCAGCAGGTTGTGCCTGCGCTTCCAGTGTCGTTTC‑TAAGGCAccc < 1:358823/201‑1 (MQ=255) ccACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGCCTTATCGGCGGTGAAATGTAGCGTTTATGGCAATTTTTGCGCAGCAGGTTGTGCCTGCGCTTCCCGTGTCGTTTT‑TTAAGCACCCCGGGGTTGCCGGGGAAGTGCGGGCTGTTTTTTTAGCGATCCTGGAAGCGGTAGAt > 1:210192/1‑250 (MQ=255) ccACTGACTGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGCCTTATCGGCGGTGAAATGTAGCGTTAATGGCAATTTCGGCGCAGCAGGTTGTGCCTGCGCTTCCAGTGTCGTTTC‑TAAGGCACCCTGGGTTTGCAGGGAAAGTGCGGTCTGTTTTTTCAGCGATCCTGAAAGCGTTAGAt < 1:474410/250‑1 (MQ=255) | GCTTTGCCTTGTGAGCTTAATTTGCCTGATAACTGGGCCGGGAAGACGGATAAGTATTTGCCCACATTGATTTTTGCCAACTGCAAATGGCTGTCCCAGGCAATGCCGTCACGCCAGTTCAAATTGCCTTGTAATTCTGCCGAACCACTTAACGCGTTAAGCAAGAGACGCTGAATTTCCACATTGGATAAATGGCTAACTGCCTGTAATTTAAGAGTGTTGGTTGGAATTCCCATGCCACTGACCGCACTTTTTAAGTTCACTTGTGCCGTCAGTAAATCTCCTTCAATATCCAACACCAGATCGTTAATTTGCAGCGGATCTTTATTGTTAAACGGGTATTGTGCCTTATCGGCGGTGAAATGTAGCGTTAATGGCAATTTCGGCGCAGCAGGTTGTGCCTGCGCTTCCAGTGTCGTTTC‑TAAGGCACCCTGGGTTTGCAGGGAAAGTGCGGTCTGTTTTTTCAGCGATCCTGAAAGCGTTAGAT > 1/816215‑816701 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |