| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 812,930 | G→T | G305G (GGC→GGA) | unknown ← | Exopolyphosphatase (EC 3.6.1.11) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 812,930 | 0 | G | T | 98.8% | 240.2 / ‑4.2 | 83 | G305G (GGC→GGA) | unknown | Exopolyphosphatase (EC 3.6.1.11) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base T (44/38); total (44/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.70e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 | |||||||||||
CACAATGCCCACTTCATGCAAACGCGCTGCCCAAAAAAGCACATCCTGCATTTCCGGAATTAGCTCGGTGTTTTGCCAGGCATTATATTGATTAAACAATAAAACCGCGCTTTGATACACCCGCTCTGCCTGTGCCTGATCGATATTAAATTGCTCCGCCAAACCTAGTGCGGTGCGCTCCCGAATA‑‑‑TTGTTGACCTGAAAATTTTGCTCCAGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCGCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGTTTAAACCGTTGAATTTCAGTTGGTTAAAATGGGAATGTTGTAAAGTTTGTTCAATCAATTGGTCTAAGCGGGGCGCCGTGATGGTGCCGTTGGGATCGATATTTTCGTAAATTACTTGATGCACGGTTTTGATTGTTCCTGATG > 1/812690‑813168 | cacaATGCCCACTTCATGCAAACGCGCCGCCCAAAAAAGCACATCCTGCATTTCCGGAATTAGCTCGGTGTTTTGCCAGGCATTATATTGATTAAACAATAAAACCGCGCTTTGATACACCCGCTCTGCCTGTGCCTGATCGATATTAAATTGCTCCGCCAAACCCAGTGCCGTACGTTCCCGAATA‑‑‑TTGTTGACCTGAAAATTTTGCTCCAGGCTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCGCCGTCGGAAt < 1:381873/251‑1 (MQ=255) 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aaaaGCACATCCTGCATTTCCGGAATTAGCTCGGTGTTTTGCCAGGCATTATATTGATTAAACAATAAAACCGCGCTTTGATACACCCGCTCTGCCTGTGCCTGATCGATATTAAATTGCTCCGCCAAACCTAGTGCGGTGCGCTCCCGAATA‑‑‑TTGTTGACCTGAAAATTTTGCTCCAGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAAc < 1:281880/251‑1 (MQ=255) gAATTAGCTCGGTGTTTTGCCAGGCATTATATTGATTAAACAATAAAACCGCGCTTTGATACACCCGCTCTGCCTGTGCCTGATCGATATTAAATTGCTCCGCCAAACCTAGTGCGGTGCGCTCCCGAATA‑‑‑TTGTTGACCTGAAAATTTTGCTCCAGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATcc > 1:674333/1‑250 (MQ=255) gCATTATATTGATTAAACAATAAAACCGCGCTTTGATACACCCGCTCTGCCTGTGCCTGATCGATATTAAATTGCTCCGCCAAACCTAGTGCGGTGCGCTCCCGAATA‑‑‑TTGTTGACCTGAAAATTTTGCTCCAGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGt > 1:791629/1‑250 (MQ=255) gCATTATATTGATTAAACAATAAAACCGCGCTTTGATACACCCGCTCTGCCTGTGCCTGATCGATATTAAATTGCTCCGCCAAACCTAGTGCGGTGCGCTCCCGAATA‑‑‑TTGTTGACCTGAAAATTTTGCTCCAGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGt > 1:827857/1‑250 (MQ=255) tataTTGATTAAACAATAAAACCGCGCTTTGATACACCCGCTCTGCCTGTGCCTGATCGATATTAAATTGCTCCGCCAAACCTAGTGCGGTGCGCTCCCGAATA‑‑‑TTGTTGACCTGAAAATTTTGCTCCAGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAggg > 1:356345/1‑251 (MQ=255) tataTTGATTAAACAATAAAACCGCGCTTTGATACACCCGCTCTGCCTGTGCCTGATCGATATTAAATTGCTCCGCCAAACCTAGTGCGGTGCGCTCCCGAATA‑‑‑TTGTTGACCTGAAAATTTTGCTCCAGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAggg > 1:835063/1‑251 (MQ=255) atatTGATTAAACAATAAAACCGCGCTTTGATACACCCGCTCTGCCTGTGCCTGATCGATATTAAATTGCTCCGCCAAACCTAGTGCGGTGCGCTCCCGAATA‑‑‑TTGTTGACCTGAAAATTTTGCTCCAGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGt > 1:851218/1‑251 (MQ=255) gATTAAACAATAAAACCGCGCTTTGATACACCCGCTCTGCCTGTGCCTGATCGATATTAAATTGCTCCGCCAAACCTAGTGCGGTGCGCTCCCGAATA‑‑‑TTGTTGACCTGAAAATTTTGCTCCAGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCA‑GGTTTaaa > 1:353983/1‑250 (MQ=255) cAATAAAACCGCGCTTTGATACACCCGCTCTGCCTGTGCCTGATCGATATTAAATTGCTCCGCCAAACCTAGTGCGGTGCGCTCCCGAATA‑‑‑TTGTTGACCTGAAAATTTTGCTCCAGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGtt < 1:569424/240‑1 (MQ=255) 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ttGATACACCCGCTCTGCCTGTGCCTGATCGATATTAAATTGCTCCGCCAAACCTAGTGCGGTGCGCTCCCGAATA‑‑‑TTGTTGACCTGAAAATTTTGCTCCAGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGTTTAAACCGTTGAATTTCAGTTGGTTaa > 1:718395/1‑251 (MQ=255) gATACACCCGCTCTGCCTGTGCCTGATCGATATTAAATTGCTCCGCCAAACCTAGTGCGGTGCGCTCCCGAATA‑‑‑TTGTTGACCTGAAAATTTTGCTCCAGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGTTTAAACCGTTGAATTTCAGTTGGTTaaaa > 1:43351/1‑251 (MQ=255) aTACACCCGCTCTGCCTGTGCCTGATCGATATTAAATTGCTCCGCCAAACCTAGTGCGGTGCGCTCCCGAATA‑‑‑TTGTTGACTTGAAAATTTTGCTCCAGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGTTTAAACCGTTGAATTTCAGTTGGTTAAAAt < 1:439753/251‑1 (MQ=255) 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< 1:287754/162‑1 (MQ=255) gAATA‑‑‑TTGTTGACCTGAAAATTTTGCTCCAGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGTTTAAACCGTTGAATTTCAGTTGGTTAAAATGGGAATGTTGTAAAGTTTGTTCAGTCAATTGGTCTAAGCGGGGCGCCGTGATGGTGCCGTTGGGATCg > 1:899628/1‑251 (MQ=255) ta‑‑‑tTGTTGACCTGAAAATTTTGCTCCAGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGTTTAAACCGTTGAATTTCAGTTGGTTAAAATGGGAATGTTGTAAAGTTTGTTCAATCAATTGGTCTAAGCGGGGCGCCGTGATGGTGCCGTTGGGATCGata < 1:868030/251‑1 (MQ=255) gAAAATTTTGCTCCAGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGTTTAAACCGTTGAATTTCAGTTGGTTAAAATGGGAATGTTGTAAAGTTTGTTCAATCAATTGGTCTAAGCGGGGCGCCGTGATGGTGCCGTTGGGATCGATATTTTCGTAAAtt > 1:543349/1‑251 (MQ=255) ttGCTCCAGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGTTTAAACCGTTGAATTTCAGTTGGTTAAAATGGGAATGTTGTAAAGTTTGTTCAATCAATTGGTCTAAGCGGGGCGCCGTGATGGTGCCGTTGGGATCGATATTTTCGTAAATTACTTGAt < 1:837943/251‑1 (MQ=255) gCTCCAGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGTTTAAACCGTTGAATTTCAGTTGGTTAAAATGGGAATGTTGTAAAGTTTGTTCAATCAATTGGTCTAAGCGGGGCGCCGTGATGGTGCCGTTGGGATCGATATTTTCGTAAATTACTTGATg > 1:100641/1‑250 (MQ=255) cTCCAGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGTTTAAACCGTTGAATTTCAGTTGGTTAAAATGGGAATGTTGTAAAGTTTGTTCAATCAATTGGTCTAAGCGGGGCGCCGTGATGGTGCCGTTGGGATCGATATTTTCGTAAAt < 1:765884/240‑1 (MQ=255) cTCCAGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGTTTAAACCGTTGAATTTCAGTTGGTTAAAATGGGAATGTTGTAAAGTTTGTTCAATCAATTGGTCTAAGCGGGGCGCCGTGATGGTGCCGTTGGGATCGATATTTTCGTAAATTACTTGATGc < 1:787540/250‑1 (MQ=255) aGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAggg < 1:236525/123‑1 (MQ=255) aGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGtt > 1:560462/1‑125 (MQ=255) aGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGTTTAAACCGTTGAATTTCAGTTGGTTAAAATGGGAATGTTGTAAAGTTTGTTCAATCAATTGGTCTAAGCGGGGCGCCGTGAt > 1:301769/1‑206 (MQ=255) 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(MQ=255) gcgcAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGTTTAAACCGTTGAATTTCAGTTGGTTAAAATGGGAATGTTGTAAAg < 1:860865/149‑1 (MQ=255) gcgcAATGCTCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGTTTAAACCGTTGAATTTCAGTTGGTTAAAATGGGAATGTTGTAAAGTTTGTTCAATCAATTGGTCTAAGCGGGGCGCCGTGATGGTGc < 1:784527/191‑1 (MQ=255) | CACAATGCCCACTTCATGCAAACGCGCTGCCCAAAAAAGCACATCCTGCATTTCCGGAATTAGCTCGGTGTTTTGCCAGGCATTATATTGATTAAACAATAAAACCGCGCTTTGATACACCCGCTCTGCCTGTGCCTGATCGATATTAAATTGCTCCGCCAAACCTAGTGCGGTGCGCTCCCGAATA‑‑‑TTGTTGACCTGAAAATTTTGCTCCAGACTGTACATTACGCCTTCGCGCAATGCGCCGTCGGAATAGCGCATTTTTTCAATGTGAAAATTTTCAAAAACCGCGCTTAAAATCGCTAATCCCGGCACAAAAACATCGGCACGGTCAGGGTTTAAACCGTTGAATTTCAGTTGGTTAAAATGGGAATGTTGTAAAGTTTGTTCAATCAATTGGTCTAAGCGGGGCGCCGTGATGGTGCCGTTGGGATCGATATTTTCGTAAATTACTTGATGCACGGTTTTGATTGTTCCTGATG > 1/812690‑813168 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |