| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 770,361 | C→T | intergenic (+143/‑310) | unknown → / → unknown | tRNA‑specific 2‑thiouridylase MnmA (EC 2.8.1.13)/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 770,361 | 0 | C | T | 100.0% | 255.0 / NA | 90 | intergenic (+143/‑310) | unknown/unknown | tRNA‑specific 2‑thiouridylase MnmA (EC 2.8.1.13)/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (42/48); total (42/48) | |||||||||||
ACGAACCACAAATTGCGGTCACTCCGGGACAATCGGCGGTGTTTTATTTAGACGAAATTTGCCTTGGCGGCGGCATCATTGAAAAGCAATTAAAATAAATACGATTTGAATTAAAAGTGGCTTGCCCCTAAAAGTTGGATAGGCCGGTAAACTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGCTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAATTGTCCGTGCTGTCATTACGCTCTTCTTCCGTTGCCTACGGGCATATTTTTCCAACGCAAGCCAGAGAGACCGCCTAGACCGCAAGATATTGAGAAT > 1/770121‑770606 | aCGAACCACAAATTGCGGTCACTCCGGGACAATCGGCGGTGTTTTATTTAGACGAAATTTGCCTTGGCGGTGGCATCATTGAAAAGCAATTAAAATAAATACGATTTGAATTAAAAGTGGCTTGCCCCTAAAAGTTGGATAGGCCGGTAAACTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGTTTTGCAGTTc < 1:59793/251‑1 (MQ=255) 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ACGAACCACAAATTGCGGTCACTCCGGGACAATCGGCGGTGTTTTATTTAGACGAAATTTGCCTTGGCGGCGGCATCATTGAAAAGCAATTAAAATAAATACGATTTGAATTAAAAGTGGCTTGCCCCTAAAAGTTGGATAGGCCGGTAAACTAGATACTGAGTCCTATTCTATATTGTGTAGATCTCAATCTTTTTGAATCCGGTTTAAACCGTTTTTGGTTGTAATATACGAAGTATGCTTTGCAGTTCAGTGATTAAATAGCTGATCCATGTCGGTGAAAGTCTTGTAAAGTCGTATTAAAAACCATTCCTCCGCACAGATAGATTTGATTGCGATCCAACATGCGGAGTTGTATCTTAGTGTTTCCACCCACAACGCAGAAGAAATTGTCCGTGCTGTCATTACGCTCTTCTTCCGTTGCCTACGGGCATATTTTTCCAACGCAAGCCAGAGAGACCGCCTAGACCGCAAGATATTGAGAAT > 1/770121‑770606 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |