| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 739,352 | T→C | intergenic (‑309/+6) | unknown ← / ← unknown | Mobile element protein/Diacylglycerol kinase (EC 2.7.1.107) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 739,352 | 0 | T | C | 100.0% | 260.3 / NA | 92 | intergenic (‑309/+6) | unknown/unknown | Mobile element protein/Diacylglycerol kinase (EC 2.7.1.107) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (52/40); total (52/40) | |||||||||||
GTTGAGGGTTTATATAAGGGGATTTTACGCCATTAAGCCCTCTTTCACGAAAGGCTTTT‑‑CCAATAAATGACTTGAGAACGAGAAATCTGATGAAATTTAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAGTTTTTTAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTCATTTTTGCCGATGTTTTTTAGTTAAACAACATTAATCCCCAAGTGACCACTACGATAACTAAGGCGACAAACACGGCAGCGGAGCCTTGATCTTTGGCACGCCCGGAGAGTTCGTGGCGTTCGGTGCCGATGCGATCGACCACGGCTTCAATGGCGCTGTTGAGCAGTTCTACCACCAACACCAACAACACGGAACCAATCATCAGGGCGCGTTCAATGGCATTTTCGCCGAGCCATAACGCCAGCGGGATCATG > 1/739110‑739595 | gTTGAGGGTTTATATAAGGGGATTTTACGCCATTAAGCCCTCTTTCACGAAAGGCTTTT‑‑CCAATAAATGACTTGAGAACGAGAATTCTGATGAAATTTAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGGTAGTTTTTTAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTCATTTTTGCCGACGTTTTTTa > 1:608973/1‑251 (MQ=255) 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> 1:871676/1‑251 (MQ=255) gagTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTCATTTTTGCCGACGTTTTTTAGTTAAACAACATTAATCCCCAAGTGACCACTACGATAACTAAGGCGACAAACACGGCAGCGGAGCCTTGATCTTTGGCACGCCCGGAGAGTTCGTGGCGTTCGGTGCCGATGCGATCGACCACGGCTTCAATGGCGCTGTTGAGCAGTTCTACcaccaacaccaa > 1:659921/1‑251 (MQ=255) gTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTCATTTTTGCCGACGTTTTTTAGTTAAACAACATTAATCCCCAAGTGACCACTACGATAACTAAGGCGACAAACACGGCAGCGGAGCCTTGATCTTTGGCACGCCCGGAGAGTTCGTGGCGTTCGGTGCCGATGCGATCGACCACGGCTTCAATGGCGCTGTTGAGCAGTTCTACCAccaacaccaaca > 1:297002/1‑251 (MQ=255) aGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTCATTTTTGCCGACGTTTTTTAGTTAAACAACATTAATCCCCAAGTGACCACTACGATAACTAAGGCGACAAACACGGCAGCGGAGCCTTGATCTTTGGCACGCCCGGAGAGTTCGTGGCGTTCGGTGCCGATGCGATCGACCACGGCTTCAATGGCGCTGTTGAGc > 1:771960/1‑226 (MQ=255) 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1:417805/224‑1 (MQ=255) ttttGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTCATTTTTGCCGACGTTTTTTAGTTAAACAACATTAATCCCCAAGTGACCACTACGATAACTAAGGCGACAAACACGGCAGCGGAGCCTTGATCTTTGGCACGCCCGGAGAGTTCGTGGCGTTCGGTGCCGATGCGATCGACCACGGCTTCAATGGCGCTGTTGAGCAGTTCTACCACCAACACCAACAACACGGAACCAATCATCAGGGCGCGTTCAATGGCAt < 1:299953/250‑1 (MQ=255) aaaggcttaaaaaGTGCGGTCATTTTTGCCGACGTTTTTTAGTTAAACAACATTAATCCCCAAGTGACCACTACGATAACTAAGGCGACAAACACGGCAGCGGAGCCTTGATCTTTGGCACGCCCGGAGAGTTCGTGGCGTTCGGTGCCGATGCGATCGACCACGGCTTCAATGGCGCTGTTGAGCAGTTCTACCACCAACACCAACAACACGGAACCAATCATCAGGGCGCGTTCAATGGCATTTTCGc < 1:829890/240‑1 (MQ=255) gTGCAGAGCAAAGTGCGGTCATTTTTGCCGACGTTTTTTAGTTAAACAACATTAATCCCCAAGTGACCACTACGATAACTAAGGCGACAAACACGGCAGCGGAGCCTTGATCTTTGGCACGCCCGGAGAGTTCGTGGCGTTCGGTGCCGATGCGATCGACCACGGCTTCAATGGCGCTGTTGAGCAGTTCTACCACCAACACCAACAACACGGAACCAATCATCAGGGCGCGTTCAATGGCATTTTCGCCg > 1:601331/1‑251 (MQ=255) 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GTTGAGGGTTTATATAAGGGGATTTTACGCCATTAAGCCCTCTTTCACGAAAGGCTTTT‑‑CCAATAAATGACTTGAGAACGAGAAATCTGATGAAATTTAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAGTTTTTTAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTCATTTTTGCCGATGTTTTTTAGTTAAACAACATTAATCCCCAAGTGACCACTACGATAACTAAGGCGACAAACACGGCAGCGGAGCCTTGATCTTTGGCACGCCCGGAGAGTTCGTGGCGTTCGGTGCCGATGCGATCGACCACGGCTTCAATGGCGCTGTTGAGCAGTTCTACCACCAACACCAACAACACGGAACCAATCATCAGGGCGCGTTCAATGGCATTTTCGCCGAGCCATAACGCCAGCGGGATCATG > 1/739110‑739595 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |