| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 702,320 | C→T | A192T (GCT→ACT) | unknown ← | Na(+)‑dependent branched‑chain amino acid transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 702,320 | 0 | C | T | 100.0% | 238.2 / NA | 83 | A192T (GCT→ACT) | unknown | Na(+)‑dependent branched‑chain amino acid transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (38/45); total (38/45) | |||||||||||
GAAAAATACAGTGCAGCGAGTAATACCACTGAAATACAGCCGGCGAAAATGGTGTAACGCATGATTTTATGCGGCTCGGTGACATTTTTACTGCTTAATGCTCGGGCAACGATACCGCCGAAGGCGATCGCTGCCAACACATCCATGGTTTGATATCCACTGATTAAGCCTGTAGTTAGTACAGAACCCTCGGCATAGGCTTTGCTTGGCGCAGAGATCTCAGATAATGGGGAAATAAATACGGCAGCGGTAACCACCACCAATAACACCAATAACGCCGGCGTCATAAATTTGCCTACGCTGGAAATAATGGTGTTCGGTTTTAACATGAATAACATGGCGATAATGTTAAATGCCACGGCGAAAATCAGGTGGTTCGCGGAGGTGTCCGCCACAATCTCCAACGGTACCAACGCCATTTCATAGGCGACATTGGTAATGCGTGGCATGGCGAAAGTGGAACCAATCACCAAATATAAGGTGGCTAAAAACAG > 1/702073‑702566 | gAAAAATACAGTGCAGCGAGTAATACCACTGAAATACAGCCGGCGAAAATGGTGTAACGCATGATTTTATGCGGCTCGGTGACATTTTTACTGCTTAATGCTCGGGCAACGATACCGCCGAAGGCGATCGCTGCCAACACATCCATGGTTTGATATCCACTGATTAAGCCTGTAGTTAGTACAGAACCCTCGGCATAGGCTTTGCTTGGCGCAGAGATCTCAGATAATGGGGAAATAAATACGGCAGTGGt > 1:84090/1‑251 (MQ=255) aaTACAGTGCAGCGAGTAATACCACTGAAATACAGCCGGCGAAAATGGTGTAACGCATGATTTTATGCGGCTCGGTGACATTTTTACTGCTTAATGCTCGGGCAACGATACCGCCGAAGGCGATCGCTGCCAACACATCCATGGTTTGATATCCACTGATTAAGCCTGTAGTTAGTACAGAACCCTCGGCATAGGCTTTGCTTGGCGCAGAGATCTCAGATAATGGGGAAATAAATACGGCAGTGGTAacc < 1:288164/251‑1 (MQ=255) aaTACAGTGCAGCGAGTAATACCACTGAAATACAGCCGGCGAAAATGGTGTAACGCATGATTTTATGCGGCTCGGTGACATTTTTACTGCTTAATGCTCGGGCAACGATACCGCCGAAGGCGATCGCTGCCAACACATCCATGGTTTGATATCCACTGATTAAGCCTGTAGTTAGTACAGAACCCTCGGCATAGGCTTTGCTTGGCGCAGAGATCTCAGATAATGGGGAAATAAATACGGCAGTGGTAacc < 1:634853/251‑1 (MQ=255) aTACAGTGCAGCGAGTAATACCACTGAAATACAGCCGGCGAAAATGGTGTAACGCATGATTTTATGCGGCTCGGTGACATTTTTACTGCTTAATGCTCGGGCAACGATACCGCCGAAGGCGATCGCTGCCAACACATCCATGGTTTGATATCCACTGATTAAGCCTGTAGTTAGTACAGAACCCTCGGCATAGGCTTTGCTTGGCGCAGAGATCTCAGATAATGGGGAAATAAATACGGCAGTGGTAacc > 1:803484/1‑250 (MQ=255) 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1:36188/1‑251 (MQ=255) gaTCTCAGATAATGGGGAAATAAATACGGCAGTGGTAACCACCACCAATAACACCAATAACGCCGGCGTCATAAATTTGCCTACGCTGGAAATAATGGTGTTCGGTTTTAACATGAATAACATGGCGATAATGTTAAATGCCACGGCGAAAATCAGGTGGTTCGCGGAGGTGTCCGCCACAATCTCCAACGGTACCAACGCCATTTCATAGGCGACATTGGTAATGCGTGGCATGGCGAAAGTGGAACCaa > 1:381374/1‑251 (MQ=255) gaTCTCAGATAATGGGGAAATAAATACGGCAGTGGTAACCACCACCAATAACACCAATAACGCCGGCGTCATAAATTTGCCTACGCTGGAAATAATGGTGTTCGGTTTTAACATGAATAACATGGCGATAATGTTAAATGCCACGGCGAAAATCAGGTGGTTCGCGGAGGTGTCCGCCACAATCTCCAACGGTACCAACGCCATTTCATAGGCGACATTGGTAATGCGTGGCATGGCGAAAGTGGAACCaa > 1:303442/1‑251 (MQ=255) ctcAGATAATGGGGAAATAAATACGGCAGTGGTAACCACcaccaataacaccaataa > 1:460888/1‑57 (MQ=255) ctcAGATAATGGGGAAATAAATACGGCAGTGGTAACCACCACCAATAACACCAATAACGCCGGCGTCATAAATTTGCCTACGCTGGAAATAATGGTGTTCGGTTTTAACATGAATAACATGGCGATAATGTTAAATGCCACGGCGAAAATCAGGTGGTTCGCGGAGGTGTCCGCCACAATCTCCAACGGTACCAACGCCATTTCATAGGCGACATTGGTAATGCGTGGCATGGCGAAAGTGGAACCAATCa > 1:421334/1‑251 (MQ=255) 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GAAAAATACAGTGCAGCGAGTAATACCACTGAAATACAGCCGGCGAAAATGGTGTAACGCATGATTTTATGCGGCTCGGTGACATTTTTACTGCTTAATGCTCGGGCAACGATACCGCCGAAGGCGATCGCTGCCAACACATCCATGGTTTGATATCCACTGATTAAGCCTGTAGTTAGTACAGAACCCTCGGCATAGGCTTTGCTTGGCGCAGAGATCTCAGATAATGGGGAAATAAATACGGCAGCGGTAACCACCACCAATAACACCAATAACGCCGGCGTCATAAATTTGCCTACGCTGGAAATAATGGTGTTCGGTTTTAACATGAATAACATGGCGATAATGTTAAATGCCACGGCGAAAATCAGGTGGTTCGCGGAGGTGTCCGCCACAATCTCCAACGGTACCAACGCCATTTCATAGGCGACATTGGTAATGCGTGGCATGGCGAAAGTGGAACCAATCACCAAATATAAGGTGGCTAAAAACAG > 1/702073‑702566 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |