| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 698,640 | A→G | intergenic (‑164/+20) | unknown ← / ← unknown | Aspartate‑semialdehyde dehydrogenase (EC 1.2.1.11)/Hydrolase, HAD superfamily |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 698,640 | 0 | A | G | 100.0% | 198.7 / NA | 66 | intergenic (‑164/+20) | unknown/unknown | Aspartate‑semialdehyde dehydrogenase (EC 1.2.1.11)/Hydrolase, HAD superfamily |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (30/36); total (30/36) | |||||||||||
TCATTTTCCTGCTGCATACGATCCATTAAAACGGAACCCACCATTCCGCGCCAACCGATAAAACCAACGTTTTTCATAAGTTTGTCCTTCTAGATGAGATTGAAAAGATGTTGTGTAAAGGCTTAATTAATAGCAAGAGATCACGCACAAAAGCAAGTATTTTTCGATATTTTTTTGCTTTTAAAAAATAATCGAAAAAACGACCACACTTTTTTAAATGCTCGCATTTTCATCAATGTCAGTGCCACGATCGTAAAGGCTTAATCAATCAACCCTGCCTTCACCAGAAACCGATAAATACCGTCTTGGTCGATAGGATCCGCCACATGATCGGCGATGGCTTTTAATTTCTCATGCCCGTTGCCCATGGCGACGCCGACACCCACGCGGCTTAACATTTCCAGGTCATTTAAACCGTCACCGAACGCCATCACATTTTCCATTGATAGCCCTAAATGCTTCACCGCCGTTTCAATGC > 1/698400‑698877 | tCATTTTCCTGCTGCATACGATCCATTAAAACGGAACCCACCATTCCGCGCCAACCGATAAAACCAACGTTTTTCATAAGTTTGTCCTTCTAGATGAGATTGAAAAGATGTTGTGTAAAGGCTTAATTAATAGCAAGAGATCACGCACAAAAGCAAGTATTTTTCGATATTTTTTTGCTTTTAAAAAATAATCGAAAAAACGACCACACTTTTTTAAATGCTCGCATTTTCATCAATGTCGGTGCCACGAt < 1:419021/251‑1 (MQ=255) 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cacTTTTTTAAATGCTCGCATTTTCATCAATGTCGGTGCCACGATCGTAAAGGCTTAATCAATCAACCCTGCCTTCACCAGAAACCGATAAATGCCGTCTTGGTCGATAGGATCCGCCACATGATCGGCGATGGCTTTTAATTTCTCATGCCCGTTGCCCATGGc > 1:835174/1‑165 (MQ=255) cTTTTTTAAATGCTCGCATTTTCATCAATGTCGGTGCCACGATCGTAAAGGCTTAATCAATCAACCCTGCCTTCACCAGAAACCGATAAATGCCGTCTTGGTCGATAGGATCCGCCACATGATCGGCGATGGCTTTTAATTTCTCATGCCCGTTGCCCATGGCGACGCCGACACCCACGCGGCTTAACATTTCCAGGTCATTTAAACCGTCACCGAACGCCATCACATTTTCCATTGATAGCCCTAAAtc > 1:535854/1‑249 (MQ=255) cTTTTTTAAATGCTCGCATTTTCATCAATGTCGGTGCCACGATCGTAAAGGCTTAATCAATCAACCCTGCCTTCACCAGAAACCGATAAATGCCGTCTTGGTCGATAGGATCCGCCACATGATCGGCGATGGCTTTTAATTTCTCATGCCCGTTGCCCATGGCGACGCCGACACCCACGCGGCTTAACATTTCCAGGTCATTTAAACCGTCACCGAACGCCATCACATTTTCCATTGATAGCCCTAAATGc < 1:16040/251‑1 (MQ=255) cATTTTCATCAATGTCGGTGCCACGATCGTAAAGGCTTAATCAATCAACCCTGCCTTCACCAGAAACCGATAAATGCCGTCTTGGTCGATAGGATCCGCCACATGATCGGCGATGGCTTTTAATTTCTCATGCCCGTTGCCCATGGCGACGCCGACACCCACGCGGCTTAACATTTCCAGGTCATTTAAACCGTCACCGAACGCCATCACATTTTCCATTGATAGCCCTAAATGc < 1:560989/235‑1 (MQ=255) aTTTTCATCAATGTCGGTGCCACGATCGTAAAGGCTTAATCAATCAACCCTGCCTTCACCAGAAACCGATAAATGCCGTCTTGGTCGATAGGATCCGCCACATGATCGGCGATGGCTTTTAATTTCTCATGCCCGTTGCCCATGGCGACGCCGACACCCACGCGGCTTAACATTTCCAGGTCATTTAAACCGTCACCGAACGCCATCACATTTTCCATTGATAGCCCTAAATGCTTCACCGCCGTTTCAAt < 1:474613/251‑1 (MQ=255) tttCATCAATGTCGGTGCCACGATCGTAAAGGCTTAATCAATCAACCCTGCCTTCACCAGAAACCGATAAATGCCGTCTTGGTCGATAGGATCCGCCACATGATCGGCGATGGCTTTTAATTTCTCATGCCCGTTGCCCATGGCGACGCCGACCCCCACGCGGCTTAACATTTCCAGGTCATTTAAACCGTCACCGAACGCCATCACATTTTCCATTGATAGCCCTAAATGCTTCACCGCCGTTTCAATGc < 1:782978/251‑1 (MQ=255) tcaATGTCGGTGCCACGATCGTAAAGGCTTAATCAATCAACCCTGCCTTCACCAGAAACCGATAAATGCCGTCTTGGTCGATAGGATCCGCCACATGATCGGCGATGGCTTTTAATTTCTCATGCCCGTTGCCCATGGCGACGCCGACACCCACGCGGCTTAACATTTCCAGGTCATTTAAACCGTCACCGAACGCCATCACATTTTCCATTGATAGCCCTAAATGCTTCACCGCCGTTTCAATGc > 1:288005/1‑246 (MQ=255) caATGTCGGTGCCACGATCGTAAAGGCTTAATCAATCAACCCTGCCTTCACCAGAAACCGATAAATGCCGTCTTGGTCGATAg > 1:247629/1‑83 (MQ=255) | TCATTTTCCTGCTGCATACGATCCATTAAAACGGAACCCACCATTCCGCGCCAACCGATAAAACCAACGTTTTTCATAAGTTTGTCCTTCTAGATGAGATTGAAAAGATGTTGTGTAAAGGCTTAATTAATAGCAAGAGATCACGCACAAAAGCAAGTATTTTTCGATATTTTTTTGCTTTTAAAAAATAATCGAAAAAACGACCACACTTTTTTAAATGCTCGCATTTTCATCAATGTCAGTGCCACGATCGTAAAGGCTTAATCAATCAACCCTGCCTTCACCAGAAACCGATAAATACCGTCTTGGTCGATAGGATCCGCCACATGATCGGCGATGGCTTTTAATTTCTCATGCCCGTTGCCCATGGCGACGCCGACACCCACGCGGCTTAACATTTCCAGGTCATTTAAACCGTCACCGAACGCCATCACATTTTCCATTGATAGCCCTAAATGCTTCACCGCCGTTTCAATGC > 1/698400‑698877 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |