| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 641,997 | G→A | T10T (ACG→ACA) | unknown → | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 641,997 | 0 | G | A | 100.0% | 235.7 / NA | 83 | T10T (ACG→ACA) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (49/34); total (49/34) | |||||||||||
ACGAACTTTTAAAAGGACTAAATGATGAGTAGAGAGCTTTTAACAATTTCAATGGCAATGCTTAAACCTCGAAATGATATTGAGCATTCTCTATCTTATGGTTCCGAACCAGTTATTTATACTATGCCGACAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACGGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAATTTTTGATATAAAGAGAGAAAAGTATGATTACTAATGAAGAAAAATTAAGTAGACAAAAATCAGTTCAATTTGCTATTGATAACAATCGTCTTGAGGGATTGGATACTGATAGCGATATTTTA > 1/641757‑642215 | aCGAACTTTTAAAAGGACTAAATGATGAGTAGAGAGCTTTTAACAATTTCAATGGCAATGCTTAAACCTCGAAATGATATTGAGCATTCTCTATCTTATGGTTCCGAACCAGTTATTTATACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAg < 1:65091/251‑1 (MQ=255) cTTTTAAAAGGACTAAATGATGAGTAGAGAGCTTTTAACAATTTCAATGGCAATGCTTAAACCTCGAAATGATATTGAGCATTCTCTATCTTATGGTTCCGAACCAGTTATTTATACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTa > 1:30889/1‑251 (MQ=255) cTTTTAAAAGGACTAAATGATGAGTAGAGAGCTTTTAACAATTTCAATGGCAATGCTTAAACCTCGAAATGATATTGAGCATTCTCTATCTTATGGTTCCGAACCAGTTATTTATACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTa > 1:474549/1‑251 (MQ=255) tAAAAGGACTAAATGATGAGTAGAGAGCTTTTAACAATTTCAATGGCAATGCTTAAACCTCGAAATGATATTGAGCATTCTCTATCTTATGGTTCCGAACCAGTTATTTATACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAAt < 1:875560/251‑1 (MQ=255) gACTAAATGATGAGTAGAGAGCTTTGAACAATTTCAATGGCAATGCTTAAACCTCGAAATGATATTGAGCATTCTCTATCTTATGGTTCCGAACCAGTTATTTATACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATa > 1:782788/1‑251 (MQ=255) gatgaGTAGAGAGCTTTTAACAATTTCAATGGCAATGCTTAAACCTCGAAATGATATTGAGCATTCTCTATCTTATGGTTCCGAACCAGTTATTTATACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAg > 1:727619/1‑251 (MQ=255) gTAGAGAGCTTTTAACAATTTCAATGGCAATGCTTAAACCTCGAAATGATATTGAGCATTCTCTATCTTATGGTTCCGAACCAGTTATTTATACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAg < 1:118082/223‑1 (MQ=255) gTAGAGAGCTTTTAACAATTTCAATGGCAATGCTTAAACCTCGAAATGATATTGAGCATTCTCTATCTTATGGTTCCGAACCAGTTATTTATACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAAtt > 1:122396/1‑233 (MQ=255) gTAGAGAGCTTTTAACAATTTCAATGGCAATGCTTAAACCTCGAAATGATATTGAGCATTCTCTATCTTATGGTTCCGAACCAGTTATTTATACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCta > 1:173208/1‑251 (MQ=255) cTTTTAACAATTTCAATGGCAATGCTTAAACCTCGAAATGATATTGAGCATTCTCTATCTTATGGTTCCGAACCAGTTATTTATACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTc < 1:199934/249‑1 (MQ=255) cTTTTAACAATTTCAATGGCAATGCTTAAACCTCGAAATGATATTGAGCATTCTCTATCTTATGGTTCCGAACCAGTTATTTATACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTc < 1:797157/249‑1 (MQ=255) tttAACAATTTCAATGGCAATGCTTAAACCTCGAAATGATATTGAGCATTCTCTATCTTATGGTTCCGAACCAGTTATTTATACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTG‑AAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAAtt < 1:553009/251‑1 (MQ=255) tGCTTAAACCTCGAAATGATATTGAGCATTCTCTATCTTATGGTTCCGAACCAGTTATTTATACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCgaga > 1:482751/1‑251 (MQ=255) gCTTAAACCTCGAAATGATATTGAGCATTCTCTATCTTATGGTTCCGAACCAGTTATTTATACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCgaga > 1:690398/1‑250 (MQ=255) aTGATATTGAGCATTCTCTATCTTATGGTTCCGAACCAGTTATTTATACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTg < 1:731606/251‑1 (MQ=255) gATATTGAGCATTCTCTATCTTATGGTTCCGAACCAGTTATTTATACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTa > 1:332318/1‑244 (MQ=255) aGCATTCTCTATCTTATGGTTCCGAACCAGTTATTTATACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTtcaatcaa > 1:396576/1‑251 (MQ=255) aTTCTCTATCTTATGGTTCCGAACCAGTTATTTATACTATGCGTCCAATTTGGACGGTTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTg < 1:420405/191‑1 (MQ=255) ttCTCTATCTTATGGTTCCGAACCAGTTATTTATACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTAttt < 1:657110/236‑1 (MQ=255) ttCTCTATCTTATGGTTCCGAACCAGTTATTTATACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTAttt > 1:881615/1‑236 (MQ=255) ttCTCTATCTTATGGTTCCGAACCAGTTATTTATACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCaataat > 1:688704/1‑251 (MQ=255) ttCTCTATCTTATGGTTCCGAACCAGTTATTTATACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCaataat < 1:739668/251‑1 (MQ=255) tctcTATCTTATGGTTCCGAACCAGTTATTTATACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTAt > 1:483863/1‑233 (MQ=255) ctctATCTTATGGTTCCGAACCAGTTATTTATACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGc > 1:693271/1‑229 (MQ=255) aTCTTATGGTTCCGAACCAGTTATTTATACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCtatta > 1:873523/1‑190 (MQ=255) gTTCCGAACCAGTTATTTATACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTg > 1:677210/1‑176 (MQ=255) gTTCCGAACCAGTTATTTATACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTAttt < 1:423507/222‑1 (MQ=255) gTTCCGAACCAGTTATTTATACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTAt < 1:372212/220‑1 (MQ=255) tatttatACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAg < 1:406440/138‑1 (MQ=255) tatttatACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAg > 1:269414/1‑138 (MQ=255) tatttatACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGc > 1:49829/1‑187 (MQ=255) tatttatACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGc < 1:858741/199‑1 (MQ=255) tatttatACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTAttt < 1:543301/209‑1 (MQ=255) tatttatACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTtc > 1:540642/1‑214 (MQ=255) tatttatACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCaataat < 1:55116/224‑1 (MQ=255) tatttatACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAATTTTTGATATAAag > 1:513866/1‑237 (MQ=255) tatttatACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAATTTTTGATATAAAGAGAGAAAAGTATGa > 1:178467/1‑251 (MQ=255) tatttatACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAATTTTTGATATAAAGAGAGAAAAGTATGa > 1:537347/1‑251 (MQ=255) tatttatACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAATTTTTGATATAAAGAGAGAAAAGTATGa > 1:118506/1‑251 (MQ=255) tttatACTATGCGTCCAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAATTTTTGATATAAAGAGAGAAAAGTATGAtt > 1:326222/1‑251 (MQ=255) gcgtccAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCAt < 1:583980/172‑1 (MQ=255) aTTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAg > 1:662859/1‑119 (MQ=255) gCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACATGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTg < 1:64033/135‑1 (MQ=255) gCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACg < 1:143783/170‑1 (MQ=255) gCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTAttt > 1:266372/1‑181 (MQ=255) gCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTAttt > 1:840549/1‑181 (MQ=255) gCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTAttt > 1:560391/1‑181 (MQ=255) gCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTAttt > 1:611226/1‑181 (MQ=255) gCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAATTTTTGATATAAAGAGAGAAAAGTATGATTACTAATGAAGAAAAATTAAGTAGACa > 1:267112/1‑251 (MQ=255) tGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAAttttt < 1:393582/196‑1 (MQ=255) gACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTtc > 1:356064/1‑181 (MQ=255) aCAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAATTTTTGATATAAAGAGAGAAAAGTATGATTACTAATGAAGAAAAATTAAGTAGACAAAAATc < 1:431894/251‑1 (MQ=255) cAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAATTTTTGATATAAAGAGAGAAAAGTATGATTACTAATg > 1:210785/1‑225 (MQ=255) aaGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAATTTTTGATATAAAGAGAGAAAAGTATGATTACTAATGAAGAAAAATTAAGTAGACAAAAATCAGTTCaa > 1:621413/1‑251 (MQ=255) gTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAATTTTTGATATAAAGAGAGAAAAGTATGATTACTAATGAAGAAAAATTAAGTAGACAAAAATCAGTTCAAtt > 1:164786/1‑251 (MQ=255) gTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCAACTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAATTTTTGATATAAAGAGAGAAAAGTATGATTACTAATGAAGAAAAATTAAGTAGACAAAAATCAGTTCAAtt > 1:584100/1‑251 (MQ=255) aTGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCCCTGCTATTTTGCTCAATCAATAATTTTTGATATAAAGAGAGAAAAGTATGATTACTAATGAAGAAAAATTAAGTAGACAAAAATCAGTTCAATTTg > 1:247912/1‑249 (MQ=255) gggCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAATTTTTGATATAAAGAGAGAAAAGTATGATTACTAATg < 1:368135/208‑1 (MQ=255) gggCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAATTTTTGATATAAAGAGAGAAAAGTATGATTACTAATGAAGAAAAATTAAGTAGACAAAAATCAGTTCAATTTGCTATTg < 1:716125/250‑1 (MQ=255) aaTATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTg < 1:823030/107‑1 (MQ=255) atatAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGc > 1:116772/1‑107 (MQ=255) atatAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTc > 1:748509/1‑115 (MQ=255) atatAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTAttt < 1:323142/152‑1 (MQ=255) atatAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAATTTTTGATATAAAGAGAGAAAAGTATGATTACTAATGAAGAAAAATTAAGTAGACAAAAATCAGTTCAAttt > 1:442277/1‑238 (MQ=255) atatAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAATTTTTGATATAAAGAGAGAAAAGTATGATTACTAATGAAGAAAAATTAAGTAGACAAAAATCAGTTCAATTTGCTa < 1:355264/242‑1 (MQ=255) atatAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAATTTTTGATATAAAGAGAGAAAAGTATGATTACTAATGAAGAAAAATTAAGTAGACAAAAATCAGTTCAATTTGCTATTGATAACa > 1:571400/1‑251 (MQ=255) atatAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAATTTTTGATATAAAGAGAGAAAAGTATGATTACTAATGAAGAAAAATTAAGTAGACAAAAATCAGTTCAATTTGCTATTGATAACa > 1:800975/1‑251 (MQ=255) atatAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAATTTTTGATATAAAGAGAGAAAAATATGATTACTAATGAAGAAAAATTAAATAGACAAAAATCAGTTCAATTTGTTATTGATAACa > 1:488672/1‑251 (MQ=255) ataAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAATTTTTGATATAAAGAGAGAAAAGTATGATTACTAATGAAGAAAAATTAAGTAGACAAAAATCAGTTCAATTTGCTATTGATAACAAt < 1:193389/251‑1 (MQ=255) ataAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAATTTTTGATATAAAGAGAGAAAAGTATGATTACTAATGAAGAAAAATTAAGTAGACAAAAATCAGTTCAATTTGCTATTGATAACAAt < 1:300682/251‑1 (MQ=255) agcTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAATTTTTGATATAAAGAGAGAAAAGTATGATTACTAATGAAGAAAAATTAAGTAGACAAAAATCAGTTCAATTTGCTATTGATAACAATCGTCTTg > 1:710844/1‑251 (MQ=255) gctgTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTAttt > 1:428896/1‑139 (MQ=255) gCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAATTTTTGATATAAAGAGAGAAAAGTATGATTACTAATGAAGAAAAATTAAGt > 1:862347/1‑198 (MQ=255) tCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTAttt < 1:668128/130‑1 (MQ=255) tCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTtc > 1:818293/1‑135 (MQ=255) cTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACTGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTg < 1:770434/131‑1 (MQ=255) cTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAATTTTTGATATAAAGAGAGAAAAGTATGATTACTAATGAAGAAAAATTAAGTAGACAAAAATCAGTTCAATTTGCTATTGATAACAATCGTCt < 1:377142/235‑1 (MQ=255) cTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAATTTTTGATATAAAGAGAGAAAAGTATGATTACTAATGAAGAAAAATTAAGTAGACAAAAATCAGTTCAATTTGCTATTGATAACAATCGTCTTGAGGGATTGGATa > 1:309136/1‑249 (MQ=255) tGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAATTTTTGATATAAAGAGAGAAAAGTATGATTACTAATGAAGAAAAATTAAGTAGACAAAAATCAGTTCAATTTGCTATTGATAACAATCGTCTTGAGGGATTGGATACTGAt < 1:126695/251‑1 (MQ=255) gTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAATTTTTGATATAAAGAGAGAAAAGTATGATTAc > 1:792236/1‑168 (MQ=255) cTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAATTTTTGATATAAAGAGAGAAAAGTATGATTACTAATGAAGAAAAATTAAGTAGACAAAAATCAGTTCAATTTGCTATTGATAACAATCGTCTTGAGGGATTGGATACTGATAGCGATATTTTa > 1:647521/1‑251 (MQ=255) gCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAATTTTTGATATAAAGAGAGAAAAGTATGATTACTAATGAAGAAAAATTAAGTAGACAAAAATCAGTTCAATTTGCTATTGATAACAAt < 1:189208/194‑1 (MQ=255) gCGACAGGCACAGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAATTTTTGATATAAAGAGAGAAAAGTATGATTACTAATGAAGAAAAATTAAGTAGACAAAAATCAGTTCAATTTGCTATTGATAACAATCGTCTTGAGGGATTGGATACTGa < 1:291816/217‑1 (MQ=255) | ACGAACTTTTAAAAGGACTAAATGATGAGTAGAGAGCTTTTAACAATTTCAATGGCAATGCTTAAACCTCGAAATGATATTGAGCATTCTCTATCTTATGGTTCCGAACCAGTTATTTATACTATGCCGACAATTTGGACGGCTATGACAATAGAAGTTTATGAGGGGCAATATAAGCAAGCTGCTGTTGCATCTATGGGGTAGGCGACTTGTGGAGATTGAAAAAACGGCGACAGGCACGGCTAAAAAAGTGGTAAAATTTGATAACTATGAGTGCTATTATTCAAATTCGGCGGTTGCATTGCGAGACGCTCTGCTATTTTGTTCAATCAATAATTTTTGATATAAAGAGAGAAAAGTATGATTACTAATGAAGAAAAATTAAGTAGACAAAAATCAGTTCAATTTGCTATTGATAACAATCGTCTTGAGGGATTGGATACTGATAGCGATATTTTA > 1/641757‑642215 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |