| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 619,451 | C→T | E98K (GAA→AAA) | unknown ← | DNA polymerase III delta subunit (EC 2.7.7.7) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 619,451 | 0 | C | T | 100.0% | 278.6 / NA | 96 | E98K (GAA→AAA) | unknown | DNA polymerase III delta subunit (EC 2.7.7.7) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (44/52); total (44/52) | |||||||||||
GTTGTTTTCGTAGCTGTAACACAACAACTGCACCGCTTCTTGTTCAATGCTTAACCCCAACATCTTCGCCCGATTCGCCACCCAGCGGGGCAATTGTTCGGCATTGGGGGTTTGACAGTTTACCAATACCGCCTGCGGTTCATACTGATTCGCCGCCATAAACCACGCCTGCTTTTCAGCGGCTTTAGTGAGTTTGGCTAAACGGAAAATCGGTAGCACATCGGGCTGAAGCAACGAAATGAATTCGGATAAGTTTTTCTGTAAAAGTGCGGTCGCATTTTCAGGTAAATCTAAAATAATGAGCTGTTTATTGAAAAATAAGCCCATGGATTGCACCCGCTCGAATAAATCATTCCAGTCGGTGGAGGCATTAATGTCCAGTTCAACTTTTTCATCGAATCCCCGCTGAAGCGCCGTTTGGTAAATACCATTGGCGCTTTCATTGAGCAACAACGGATCCTCGCCCACCAGAAAATACACATGGGCTAAAT > 1/619206‑619696 | gttgttTTCGTAGCTGTAACACAACAACTGCACCGCTTCTTGTTCAATGCTTAACCCCAACATCTTCGCCCGATTCGCCACCCAGCGGGGCAATTGTTCGGCATTGGGGGTTTGACAGTTTACCAATACCGCCTGCGGTTCATACTGATTCGCCGCCATAAACCACGCCTGCTTTTCAGCGGCTTTAGTGAGTTTGGCTAAACGGAAAATCGGTAGCACATCGGGCTGAAGCAACGAAATGAATTTGGa < 1:184746/249‑1 (MQ=255) 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cTGTAACACAACAACTGCACCGCTTCTTGTTCAATGCTTAACCCCAACATCTTCGCCCGATTCGCCACCCAGCGGGGCAATTGTTCGGCATTGGGGGTTTGACAGTTTACCAATACCGCCTGCGGTTCATACTGATTCGCCGCCATAAACCACGCCTGCTTTTCAGCGGCTTTAGTGAGTTTGGCTAAACGGAAAATCGGTAGCACATCGGGCTGAAGCAACGAAATGAATTTGGATAAGTTTTTCTGTaa > 1:597490/1‑251 (MQ=255) cTGTAACACAACAACTGCACCGCTTCTTGTTCAATGCTTAACCCCAACATCTTCGCCCGATTCGCCACCCAGCGGGGCAATTGTTCGGCATTGGGGGTTTGACAGTTTACCAATACCGCCTGCGGTTCATACTGATTCGCCGCCATAAACCACGCCTGCTTTTCAGCGGCTTTAGTGAGTTTGGCTAAACGGAAAATCGGTAGCACATCGGGCTGAAGCAACGAAATGAATTTGGATAAGTTTTTCTGTaa > 1:773241/1‑251 (MQ=255) gTAACACAACAACTGCACCGCTTCTTGTTCAATGCTTAACCCCAACATCTTCGCCCGATTCGCCACCCAGCGGGGCAATTGTTCGGCATTGGGGGTTTGACAGTTTACCAATACCGCCTGCGGTTCATACTGATTCGCCGCCATAAACCACGCCTGCTTTTCAGCGGCTTTAGTGAGTTTGGCTAAACGGAAAATCGGTAGCACATCGGGCTGAAGCAACGAAATGAATTTGGATAAGTTTTTCTGTaaaa > 1:25746/1‑251 (MQ=255) 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aTGCTTAACCCCAACATCTTCGCCCGATTCGCCACCCAGCGGGGCAATTGTTCGGCATTGGGGGTTTGACAGTTTACCAATACCGCCTGCGGTTCATACTGATTCGCCGCCATAAACCACGCCTGCTTTTCAGCGGCTTTAGTGAGTTTGGCTAAACGGAAAATCGGTAGCACATCGGGCTGAAGCAACGAAATGAATTTGGATAAGTTTTTCTGTAAAAGTGCGGTCGCATTTTCAGGTAAATCTAAaat < 1:710288/251‑1 (MQ=255) aTGCTTAACCCCAACATCTTCGCCCGATTCGCCACCCAGCGGGGCAATTGTTCGGCATTGGGGGTTTGACAGTTTACCAATACCGCCTGCGGTTCATACTGATTCGCCGCCATAAACCACGCCTGCTTTTCAGCGGCTTTAGTGAGTTTGGCTAAACGGAAAATCGGTAGCACATCGGGCTGAAGCAACGAAATGAATTTGGATAAGTTTTTCTGTAAAAGTGCGGTCGCATTTTCAGGTAAATCTAAaat < 1:798042/251‑1 (MQ=255) aTGCTTAACCCCAACATCTTCGCCCGATTCGCCACCCAGCGGGGCAATTGTTCGGCATTGGGGGTTTGACAGTTTACCAATACCGCCTGCGGTTCATACTGATTCGCCGCCATAAACCACGCCTGCTTTTCAGCGGCTTTAGTGAGTTTGGCTAAACGGAAAATCGGTAGCACATCGGGCTGAAGCAACGAAATGAATTTGGATAAGTTTTTCTGTAAAAGTGCGGTCGCATTTTCAGGTAAATCTAAaat < 1:208165/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |