| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 596,532 | A→C | K4Q (AAA→CAA) | unknown → | Cyclic AMP receptor protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 596,532 | 0 | A | C | 100.0% | 243.6 / NA | 80 | K4Q (AAA→CAA) | unknown | Cyclic AMP receptor protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (44/36); total (44/36) | |||||||||||
TTAGCCGAAGAAACATTGGTCAATATCGTGGAAAGCGTTATTTTGCGCGAAGGGACCGATTATGGTTCACATGAACAGACTTTCGAACAAAAAAAGAAAGCATTGCTGAACAGGATCCGCCAGGGAAGCGCGGTGATTGTTTGGTCTGAATTACATGAATCTATCGACATAAAAGATAAAACGGAATTTTTTAGATAAACTGCTTAGTTTTTCATAATTTAGATGGAGGTTTAACGTGCAGGAAAAAAATGCACAAGCTACGCAATCAATGGATCCGACACTTGAGTGGTTTTTATCCCACTGCCACATCCATAAATATCCGTCTAAAAGCACATTAATCAACGCCGGCGAAAAAGCCGAGACACTTTATTATTTAATTCAAGGCTCCGTGTCCGTTTTGGTCAAAGATGAAGACGGCAAAGAAATGATCCTCACCTATTTAAGCCAAGGGGATTTTTTCGGCGAAGCGGGCTTATTTGAAGAAGGACAA > 1/596288‑596777 | ttAGCCGAAGAAACATTGGTCAATATCGTGGAAAGCGTTATTTTGCGCGAAGGGACCGATTATGGTTCACATGAACAGACTTTCGAACAAAAAAAGAAAGCATTGCTGAACAGGATCCGCCAGGGAAGCGCGGTGATTGTTTGGTCTGAATTACATGAATCTATCGACATAAAAGATAAAACGGAATTTTTTAGATAAACTGCTTAGTTTTTCATAATTTAGATGGAGGTTTAACGTGCAGGaacaaaa < 1:490787/249‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) tGCAGGAACAAAACGCACAAGCTACGCAATCAATGGATCCGACACTTGAGTGGTTTTTATCCCACTGCCACATCCATAAATATCCGTCTAAAAGCACATTAATCAACGCCGGCGAAAAAGCCGAGACACTTTATTATTTAATTCAAGGCTCCGTGTCCGTTTTGGTCAAAGATGAAGACGGCAAAGaaa > 1:322840/1‑189 (MQ=255) ggAACAAAACGCACAAGCTACGCAATCAATGGATCCGACACTTGAGTGGTTTTTATCCCACTGCCACATCCATAAATATCCGTCTAAAAGCACATTAATCAACGCCGGCGAAAAAGCCGAGACACTTTATTATTTAATTCAAGGCTCCGTGTCCGTTTTGGTCAAAGATGAAGACGGCAAAGAAATGATCCTCACCTATTTAAGCCAAGGGGATTTTTTCGGCGAAGCGGGCTTATTTGAAGAAGGACaa > 1:117227/1‑250 (MQ=255) | TTAGCCGAAGAAACATTGGTCAATATCGTGGAAAGCGTTATTTTGCGCGAAGGGACCGATTATGGTTCACATGAACAGACTTTCGAACAAAAAAAGAAAGCATTGCTGAACAGGATCCGCCAGGGAAGCGCGGTGATTGTTTGGTCTGAATTACATGAATCTATCGACATAAAAGATAAAACGGAATTTTTTAGATAAACTGCTTAGTTTTTCATAATTTAGATGGAGGTTTAACGTGCAGGAAAAAAATGCACAAGCTACGCAATCAATGGATCCGACACTTGAGTGGTTTTTATCCCACTGCCACATCCATAAATATCCGTCTAAAAGCACATTAATCAACGCCGGCGAAAAAGCCGAGACACTTTATTATTTAATTCAAGGCTCCGTGTCCGTTTTGGTCAAAGATGAAGACGGCAAAGAAATGATCCTCACCTATTTAAGCCAAGGGGATTTTTTCGGCGAAGCGGGCTTATTTGAAGAAGGACAA > 1/596288‑596777 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |