| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 596,232 | C→T | L197L (CTA→TTA) | unknown → | Transcriptional regulator SlmA, TetR family |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 596,232 | 0 | C | T | 100.0% | 185.8 / NA | 66 | L197L (CTA→TTA) | unknown | Transcriptional regulator SlmA, TetR family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (30/36); total (30/36) | |||||||||||
ATGTTTGAAGACGCCAAATTACAAGCCCGCGTCGCCACCTTTTTTGACCGCTTGGAATTGCAATTTGTGAACATTCTGCAAATGCGAAAATTGCGTGAAGGACGTGGCTTTAACGTGGATGAACGGATTATCGCCGCCCACTTGGTGACCCTCTGCGAAGGGCAGTTTATGCGTTATGTGCGTTCCAACTTTCGCCATATGCCGAATCAGGGTTTTAACCAGCAATGGCAACTGATGGAAAGCCTATTTGCATAATTTATTTATTTAGGTAATATGTCGTGATTATTCCTTGGCAAGAGTTAGCCGAAGAAACATTGGTCAATATCGTGGAAAGCGTTATTTTGCGCGAAGGGACCGATTATGGTTCACATGAACAGACTTTCGAACAAAAAAAGAAAGCATTGCTGAACAGGATCCGCCAGGGAAGCGCGGTGATTGTTTGGTCTGAATTACATGAATCTATCGACATAAAAGATAAAACG > 1/595989‑596470 | aTGTTTGAAGACGCCAAATTACAAGCCCGCGTCGCCACCTTTTTTGACCGCTTGGAATTGCAATTTGTGAACATTCTGCAAATGCGAAAATTGCGTGAAGGACGTGGCTTTAACGTGGATGAACGGATTATCGCCGCCCACTTGGTGACCCTCTGCGAAGGGCAGTTTATGCGTTATGTGCGTTCCAACTTTCGCCATATGCCGAATCAGGGTTTTAACCAGCAATGGCAACTGATGGAAAGCTTATTTg < 1:321121/250‑1 (MQ=255) 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aaCCAGCAATGGCAACTGATGGAAAGCTTATTTGCATAATTTATTTATTTAGGTAATATGTCGTGATTATTCCTTGGCAAGAGTTAGCCGAAGAAACATTGGTCAATATCGTGGAAAGCGTTATTTTGCGCGAAGGGACCGATTATGGTTCACATGAACAGACTTTCGAACAAAAAAAGAAAGCATTGCTGAACAGGATCCGCCAGGGAAGCGCGGTGATTGTTTGGTCTGAATTACATGAATCTATCGa > 1:804160/1‑250 (MQ=255) cAGCAATGGCAACTGATGGAAAGCTTATTTGCATAATTTATTTATTTAGGTAATATGTCGTGATTATTCCTTGGCAAGAGTTAGCCGAAGAAACATTGGTCAATATCATGGAAAGCGTTATTTTGCGCGAAGGGACCGATTATGGTTCACATGAACAGACTTTCGAACAAAAAAAGAAAGCATTGCTGAACAGGATCCGCCAGGGAAGCGCGGTGATTGTTTGGTCTGAATTACATGAATCTATCGACATa > 1:112565/1‑251 (MQ=255) ggCAACTGATGGAAAGCTTATTTGCATAATTTATTTATTTAGGTAATATGTCGTGATTATTCCTTGGCAAGAGTTAGCCGAAGAAACATTGGTCAATATCGTGGAAAGCGTTATTTTGCGCGAAGGGACCGATTATGGTTCACATGAACAGACTTTCGAACAAAAAAAGAAAGCATTGCTGAACAGGATCCGCCAGGGa < 1:335750/199‑1 (MQ=255) cTGATGGAAAGCTTATTTGCATAATTTATTTATTTAGGTAATATGTCGTGATTATTCCTTGGCAAGAGTTAGCCGAAGAAACATTGGTCAATATCGTGGAAAGCGTTATTTTGCGCGAAGGGACCGATTATGGTTCACATGAACAGACTTTCGAACAAAAAAAGAAAGCATTGCTGAACAGGATCCGCCAGGGAAGCGCGGTGATTGTTTGGTCTGAAtt > 1:847953/1‑220 (MQ=255) cTGATGGAAAGCTTATTTGCATAATTTATTTATTTAGGTAATATGTCGTGATTATTCCTTGGCAAGAGTTAGCCGAAGAAACATTGGTCAATATCGTGGAAAGCGTTATTTTGCGCGAAGGGACCGATTATGGTTCACATGAACAGACTTTCGAACAAAAAAAGAAAGCATTGCTGAACAGGATCCGCCAGGGAAGCGCGGTGATTGTTTGGTCTGAATTACATGAATCTATCGACATAAAAGATAAAACg > 1:540522/1‑251 (MQ=255) | ATGTTTGAAGACGCCAAATTACAAGCCCGCGTCGCCACCTTTTTTGACCGCTTGGAATTGCAATTTGTGAACATTCTGCAAATGCGAAAATTGCGTGAAGGACGTGGCTTTAACGTGGATGAACGGATTATCGCCGCCCACTTGGTGACCCTCTGCGAAGGGCAGTTTATGCGTTATGTGCGTTCCAACTTTCGCCATATGCCGAATCAGGGTTTTAACCAGCAATGGCAACTGATGGAAAGCCTATTTGCATAATTTATTTATTTAGGTAATATGTCGTGATTATTCCTTGGCAAGAGTTAGCCGAAGAAACATTGGTCAATATCGTGGAAAGCGTTATTTTGCGCGAAGGGACCGATTATGGTTCACATGAACAGACTTTCGAACAAAAAAAGAAAGCATTGCTGAACAGGATCCGCCAGGGAAGCGCGGTGATTGTTTGGTCTGAATTACATGAATCTATCGACATAAAAGATAAAACG > 1/595989‑596470 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |