| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 593,330 | T→C | intergenic (+201/+216) | unknown → / ← unknown | hypothetical protein/UPF0758 protein YicR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 593,330 | 0 | T | C | 90.9% | 162.9 / 4.7 | 66 | intergenic (+201/+216) | unknown/unknown | hypothetical protein/UPF0758 protein YicR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (4/2); new base C (21/39); total (25/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.90e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.27e-01 | |||||||||||
GGGGCGTTAGATTTATTTGAGCAAGCTGTAGCGGAAAAAGATTAATGACAGTTAAAAATAAGTTGGCTGCCGGCAATTAAAAGGAGTAAGATTTAAAACGCCAGAGCAATCTAGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGTTCTACTTATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTTGTTTATGTTTATATGATGATTCTCCGTTAAATTTGAGGGTTGTTAGTTGTTGGTGATGTGTAAAATTTACGTAGTGTTACTTAATTTAAAACCATATAA > 1/593085‑593488 | ttagatttatttgagcaagctgtagcggaaaaagattaatgatagttaaaaataagttgactgccggcaattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTAc < 1:168102‑M2/140‑1 (MQ=255) agatttatttgagcaagctgtagcggaaaaagattaatgatagttaaaaataagttgactgccggcaattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACt > 1:348389‑M2/110‑250 (MQ=255) atttatttgagcaagctgtagcggaaaaagattaatgatagttaaaaataagttgactgccggcaattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTActc < 1:858124‑M2/142‑2 (MQ=255) atttatttgagcaagctgtagcggaaaaagattaatgatagttaaaaataagttgactgccggcaattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTActc < 1:590268‑M2/142‑2 (MQ=255) atttgagcaagctgtagcggaaaaagattaatgatagttaaaaataagttgactgccggcaattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCAc < 1:23606‑M2/148‑1 (MQ=255) ctgtagcggaaaaagattaatgatagttaaaaataagttgactgccggcaattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAg < 1:802821‑M2/158‑1 (MQ=255) aaagattaatgatagttaaaaataagttgactgccggcaattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAAc < 1:21087‑M2/170‑1 (MQ=255) gattaatgatagttaaaaataagttgactgccggcaattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAAcgg > 1:489507‑M2/79‑250 (MQ=255) gattaatgatagttaaaaataagttgactgccggcaattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCCGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAacggg > 1:788641‑M2/79‑250 (MQ=255) ttaaaaataagttgactgccggcaattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATAcc < 1:505072‑M2/184‑1 (MQ=255) ttaaaaataagttgactgccggcaattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATAc < 1:460813‑M2/183‑1 (MQ=255) aaataagttgactgccggcaattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGATCAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCcgtcg < 1:388202‑M2/189‑1 (MQ=255) ccggcaattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTtgtttatgtt < 1:662066‑M2/203‑1 (MQ=255) ccggcaattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTtgtttatgtt < 1:823710‑M2/203‑1 (MQ=255) caattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTTGTTTATGTTtata < 1:639172‑M2/207‑1 (MQ=255) aattaaaaggattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTTGTTTATGTTTatat < 1:295208‑M2/208‑1 (MQ=255) ttactaatcaaaGGAGTAAGATTCAAACCGTCCGAGCAATCTGGCGGTTTTATGCAGCC‑GAAAGTCTGAGTGTTG‑‑‑‑AAACAGA‑CGTAACTGCTGAACAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGTTCTAc > 1:455571/10‑175 (MQ=255) ttactaatcaaaGGAGTAAGATTCAAACCGTCCGAGCAATCTGGCGGTTTTATGCAGCC‑GAAAGTCTGAGTGTTG‑‑‑‑AAACAGA‑CGTAACTGCTGAACAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGTTCTAc < 1:409961/166‑1 (MQ=255) ttactaatcaaaGGAGTAAGATTCAAACCGTCCGAGCAATCTGGCGGTTTTATGCAGCC‑GAAAGTCTGAGTGTTG‑‑‑‑AAACAGA‑CGTAACTGCTGAACAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGTTCTACTCATTTACTGCCGAATAGGCAgcttagaaa > 1:104402/10‑197 (MQ=255) gattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTTGTTTATGTTTATATGATGATtc < 1:179525‑M2/216‑1 (MQ=255) gattaagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGGAATACCCGTCGTTTTTTTTTATGTTTATATGATGAtt > 1:716652‑M2/35‑249 (MQ=255) aaGGAGTAAGATTCAAACCGTCCGAGCAATCTGGCGGTTTTATGCAGCC‑GAAAGTCTGAGTGTTG‑‑‑‑AAACAGA‑CGTAACTGCTGAACAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGTTCTACTCATTTACTGCCGAATAGGCAgcttagaaa > 1:462206/1‑187 (MQ=255) aagatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTTGTTTATGTTTATATGATGATTCTGCGt < 1:442944‑M2/221‑1 (MQ=255) gatttaaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTtgtttatg < 1:224828‑M2/201‑1 (MQ=255) taaaatgccagagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTTGTTTATGTTTATATGATGATTCTGCGTTAAAtt < 1:436222‑M2/227‑1 (MQ=255) gagcaatctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGGAATACCCGTCGTTTTTGTTTTTGTTTATATGATGATTTTGGGTTAAATttgagggcgat > 1:421794‑M2/15‑247 (MQ=255) atctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTTGTTTATGTTTATATGATGATTCTGCGTtaaatttgagggcgattagtc < 1:681563‑M2/242‑10 (MQ=255) atctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTTGTTTATGTTTATATGATGATTCTGCGTtaaatttgagggcgattagtc < 1:824457‑M2/242‑10 (MQ=255) atctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTTGTTTATGTTTATATGATGATTCTGCGTTAAAt < 1:290052‑M2/226‑1 (MQ=255) atctggcggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGGAATACCCCTCGGTTTTGTTTTTGTTTTTATTATGGTTCTGCGGTtaattttagggcgattagt > 1:279353‑M2/10‑242 (MQ=255) cggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTTGTTTATGTTTATATGATGATTctgcgttaaatttgagggcgattagtcgttatt < 1:859078‑M2/248‑16 (MQ=255) cggTGGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTTGTTTATGTTTATATGATGATTctgcgttaaatttgagggcgattagtcgttatt < 1:321418‑M2/248‑16 (MQ=255) aTCTGGCGGTTTTATGCAGCC‑GAAAGTCTGAGTGTTG‑‑‑‑AAACAGA‑CGTAACTGCTGAACAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGTTCTACtc > 1:9770/1‑138 (MQ=255) gtggCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTTGTTTATGTTTATATGATGATTCTGCGTTAAATTTGAgggcgattagtcgttattc < 1:603904/247‑17 (MQ=255) tggCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTTGTTTATGTTTATATGATGATTCTGCGTTAAATTTGAgggcgattagtcgttattca < 1:767941/248‑18 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1:158898/1‑233 (MQ=255) caaaGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTTGTTTATGTTTATATGATGATTCTGCGTTAAATTTGAGGGCGATTAGTCGTTATTCATGTGTAAAATTTACGTAGTGttgttttattaaattattcatac < 1:859192/251‑22 (MQ=255) gacgtAACTGCTGAACAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGTTCTACTCATTTACTGCCGaat < 1:100385/107‑2 (MQ=255) ctgctgAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATAc > 1:642986/1‑131 (MQ=255) gctgAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTTGTTTATGTTTATATGATGATTCTGCGTTAAATTTGAGGGCGATTAGTCGTTATTCATGTGTAAAATTTACGTAGTGttgttttattaaatta < 1:482745/232‑15 (MQ=255) gAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTTGTTTTTGTTTATATGATGATTCTGCGTTAAATTTGAGGGCGATTAGTCGTTATTCATGTGTAAAATTTACGTAGTGttgttt > 1:826309/1‑215 (MQ=255) gcTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATa < 1:460553/116‑1 (MQ=255) gcTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTTGTTTATGTTTATatgat > 1:155728/1‑145 (MQ=255) tAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTTGTTTATGTTTATatgat < 1:51227/142‑1 (MQ=255) tGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGGAATACCCGTCGTTTTTGTTTATGTTTATATGATGATTCTGCGTTAAATTTGAGGGCGATTAGTCGTTATTCATGTGTAAAATTTACGTAGTGttgtt > 1:775368/1‑196 (MQ=255) gCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTTGTTTATGTTTATATGATGATTCTGCGTTAAATTTGAGGGCGATTAGTCGTTATTCATGTGTAAAATTTACGTAGTGttgttttatta > 1:440256/1‑171 (MQ=255) aaaTAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTTGTTTATGTTTATATGATGATTCTGCGTTAAATTTGAGGGCGATTAGTCGTTATTCATGTGTAAAATTTACGTAGTGttgttt < 1:258670/156‑5 (MQ=255) aTAGTAGTTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTTGTTTATGTTTATATGATGATTCTGCGTTAAATTTGAGGGCGATTAGTCGTTATTCATGTGTAAAATTTACGTAGTGttgttttattaaat < 1:284319/162‑13 (MQ=255) gtTAAGCTCTACTCATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTTGTTTATGTTTATATGATGATtc < 1:191995/88‑1 (MQ=255) | GGGGCGTTAGATTTATTTGAGCAAGCTGTAGCGGAAAAAGATTAATGACAGTTAAAAATAAGTTGGCTGCCGGCAATTAAAAGGAGTAAGATTTAAAACGCCAGAGCAATCTAGCGGTTTTATGCAGCCTGAAAGGCTGAGTGTTGAAGCAAACAAAGCTTAACTGCTGAATAAGCAGCTTAGAAAATGGTAGCTCTTACTGAAAGTTCACTGCCGAACAGGCAGCTTAGAAAATAGTAGTTAAGTTCTACTTATTCACTGCCGAACAGGCAGACAAAAACGGCGGGGTAATACCCGTCGTTTTTGTTTATGTTTATATGATGATTCTCCGTTAAATTTGAGGGTTGTTAGTTGTTGGTGATGTGTAAAATTTACGTAGTGTTACTTAATTTAAAACCATATAA > 1/593085‑593488 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |