| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 591,715 | A→G | intergenic (‑81/‑34) | unknown ← / → unknown | UPF0758 protein YicR/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 591,715 | 0 | A | G | 100.0% | 243.7 / NA | 84 | intergenic (‑81/‑34) | unknown/unknown | UPF0758 protein YicR/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (37/47); total (37/47) | |||||||||||
AAATTTCCCGCTCGATATTTGCCAGCTCCGTCTGTAAGTACATTTTCACAATGTCGGTTGAAGTAAAACAGTGGGTCTCTTTTAATTCTGCAAACAAATAACGGCGGGTCATTTCAGTACAGGCTTGCAGCTGAATAAACTGCGTAACGCCAATGCCTTTCACAGCGCAATGTAACCAACCACTTAATATTAGAAATTGATAACAGGTTAGGACTTAAGTTGAATTAAACGGAATTAAGCGGGACAGAATCAATGAAATAAAGGGCTGAAAGAAATTTTGGCCCTTTTTTATTGGGTGGTTTTGTCGTTAAAGTTAGTTTTAGAAAAAAAGTGGCTAAAATCTAAAAAGGGCGGTTTTAGCCACTTAATTGTAGAAAAACAAAAAGGCGTTTAAAAAACGTTTAAAGACCGTTTAAATTACGCTTTTGCCGATGTAGGCAACTTGTCCGATTATCTCCAATTTGTCCGCTTCCTCTTTGGTT > 1/591472‑591953 | gaaaaaacgatgggtttgagggtctattcatctacacggatcgtcgaggcaaagaagcacaaattcatcgtgatgcacgcaggggaagacagcgttattcccgccaggttgccgtaccgggtacgggcggtacatataactattttcttttgcaagaggattgtccgtccTGTAACCAACCACTTAATATTAGAAATTGATAACAGGTTAGGACTTAAGTTGAATTAAACGGAATTAAGCGGGGCAGAAt > 1:666574‑M1/171‑250 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |