| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 589,859 | G→T | T201T (ACC→ACA) | unknown ← | Formamidopyrimidine‑DNA glycosylase (EC 3.2.2.23) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 589,859 | 0 | G | T | 100.0% | 260.2 / NA | 90 | T201T (ACC→ACA) | unknown | Formamidopyrimidine‑DNA glycosylase (EC 3.2.2.23) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (43/47); total (43/47) | |||||||||||
CAAACACTGCCGAAACACTAAGGTTATCCCTTCTTCTGGCACGTCGGGCAATAAAAACTATTCCGTTGCCCGATGACTAAACTCTCGATTTTTGTACCGCACTTCGGACATGGTTTGCCTTTGTTGCCGTAAACCAGCAATTCTTGTGCAAAATACCCCGGTCTGCCGTCGGGCTGGAGAAAATCTTTTAGCGTGGTGCCGCCTTGTTCAATGGCTTTGGCAAGCACCGATTTAATGGTATCCACCAAGCGTTCGCATTGTTTTCGAGTTAGATTAGCGGCGAGCTTCAAAGGATGTAACCCGCACAGAAATAGACTTTCATTGGCATAAATGTTGCCAATACCAACCACCACGGTGTTATCCATTAATACGGTTTTAAGTGCGGTTGTTTTTTTGTGTAATTTTTTAAACAAGTACTCTGCATTGAATTCCTCTGATAGCGGCTCAGGTCCCAGTTTTAAGAATAAATGGAATTCATC > 1/589623‑590101 | cAAACACTGCCGAAACACTAAGGTTATCCCTTCTTCTGGCACGTCGGGCAATAAAAACTATTCCGTTGCCCGATGACTAAACTCTCGATTTTTGTACCGCACTTCGGACATGGTTTGCCTTTGTTGCCGTAAACCAGCAATTCTTGTGCAAAATACCCCGGTCTGCCGTCGGGCTGGAGAAAATCTTTTAGCGTGGTGCCGCCTTGTTCAATGGCTTTGGCAAGCACCGATTTAATTGTATCCACCAAGCg < 1:790532/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |