| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 550,626 | G→A | G235G (GGG→GGA) | unknown → | Rossmann fold nucleotide‑binding protein Smf possibly involved in DNA uptake |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 550,626 | 0 | G | A | 100.0% | 261.8 / NA | 86 | G235G (GGG→GGA) | unknown | Rossmann fold nucleotide‑binding protein Smf possibly involved in DNA uptake |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (64/22); total (64/22) | |||||||||||
GTCATCAGGCTGTGGTCGATTTAAAACAACCGACCATCGCGGTTTTAGGTAGCGGATTGGAAGAAGTGTATCCCGCCAAACATCTCAAATTAGCGCAGAATATTATTGAACATGGCGGTGCGTTGGTTTCTGAATTTTTT‑CCGCTACAA‑CCGCCTATTGCAGAAAATTTT‑CCCCGCCGCAATCGCATTATCAGTGGGTTATCATTAGCAACCTTAATTATTGAAGCCACCGAACGTAGCGGGTCATTAATTACAGCACGCTATGCATTAGAACAAAAGAGAGAAATTTTTGCACTACCGGGCAATATTCAAAGTCAGTTCAGCCAAGGTTGCCATAAGC‑TTATTAAACAGGGCGCAATGCTGGTCGAAAACGTGGAAGATATTTTAGAAAATCTTGCGCCACAAATGACATGGAAAAAACGCCCGCAAAATCGACCGCACTTTCCCGCTATAACGAAAACGACGTCCGCCTCATTACCACCCC > 1/550385‑550867 | gTCATCAGGCTGTGGTCGATTTAAAACAACCGACCATCGCGGTTTTAGGTAGCGGATTGGAAGAAGTGTATCCCGCCAAACATCTCAAATTAGCGCAGAATATTATTGAACATGGCGGTGCGTTGGTTTCTGAATTTTTT‑CCGCTACAA‑CCGCCTATTGCAGAAAATTTT‑CCCCGCCGCAATCGCATTATCAGTGGGTTATCATTAGCAACCTTAATTATTGAAGCCACCGAACGTAGCGGATCattaatt > 1:68603/1‑251 (MQ=255) 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1:741398/1‑251 (MQ=255) cACCGAACGTAGCGGATCATTAATTACAGCACGCTATGCATTAGAACAAAAGAGAGAAATTTTTGCACTACCGGGCAATATTCAAAGTCAGTTCAGCCAAGGTTGCCATAAGC‑TTATTAAACAGGGCGCAATGCTGGTCGAAAACGTGGAAGATATTTTAGAAAATCTTGCGCCACAAATGACATGGAAAAAACGCCCGCAAAATCGACCGCACTTTCCCGCTATAACGAAAACGACGTCCGCCTCATTac < 1:160897/251‑1 (MQ=255) gAACGTAGCGGATCATTAATTACAGCACGCTATGCATTAGAACAAAAGAGAGAAATTTTTGCACTACCGGGCAATATTCAAAGTCAGTTCAGCCAAGGTTGCCATAAGC‑TTATTAAACAGGGCGCAATGCTGGTCGAAAACGTGGAAGATATTTTAGAAAATCTTGCGCCACAAATGACATGGAAAAAACGCCCGCAAAATCGACCGCACTTTCCCGCTATAACGAAAACGACGTCCGCCTCATTaccac > 1:266813/1‑250 (MQ=255) aCGTAGCGGATCATTAATTACAGCACGCTATGCATTAGAACAAAAGAGAGAAATTTTTGCACTACCGGGCAATATTCAAAGTCAGTTCAGCCAAGGTTGCCATAAGC‑TTATTAAACAGGGCGCAATGCTGGTCGAAAACGTGGAAGATATTTTAGAAAATCTTGCGCCACAAATGACATGGAAAAAACGCCCGCAAAATCGACCGCACTTTCCCGCTATAACGAAAACGACGTCCGCCTCATTACCAccc > 1:329391/1‑250 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |