| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 483,350 | A→G | Q241Q (CAA→CAG) | unknown → | ATP synthase F0 sector subunit a (EC 3.6.3.14) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 483,350 | 0 | A | G | 100.0% | 275.8 / NA | 91 | Q241Q (CAA→CAG) | unknown | ATP synthase F0 sector subunit a (EC 3.6.3.14) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (34/57); total (34/57) | |||||||||||
TTAAGGAATATACCTTACATCCGTTTAATTACTGGGCATTTATCCCTGTTAACTTTATTCTCGAAACTGTTACTTTACTGGCTAAACCGATTTCTCTCGGCTTCCGTTTGTTCGGTAACATGTATGCGGGCGAATTAATCTTTATTCTTATTGCCGTTATGTATTCCGCCAATATGGCGATTGCGGCACTGGGAATTCCATTACACCTTGCTTGGGCGATTTTCCATATTTTGGTTATCACGTTACAAGCATTCATTTTTATGATGTTGACGGTGGTTTATTTGAGTATTGCTTATAACAAAGCAGAACATTAATTTTTTATTAACCGGCTCTAGGGCTAAAAACTTAACTTCTATTGGAGAACATTATGGAAACTGTAATTACAGCTACAATTATCGGTGCATCTATCCTTCTTGCATTCGCTGCATTGGGCACGGCAATCGGCTTTGCTATCTTAGGCGGTAAATTCTTAGAATCATCCGCCCGTCAG > 1/483103‑483592 | ttAAGGAATATACCTTACATCCGTTTAATTACTGGGCATTTATCCCTGTTAACTTTATTCTCGAAGCTGTTACTTTACTGGCTAAACCGATTTCTCTCGGCTTCCGTTTGTTCGGTAACATGTATGCGGGCGAATTAATCTTTATTCTTATTGCCGTTATGTATTCCGCCAATATGGCGATTGCGGCACTGGGAATTCCATTACACCTTGCTTGGGCGATTTTCCATATTTTGGTTATCACGTTACAGGca < 1:808419/251‑1 (MQ=255) 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gggAATTCCATTACACCTTGCTTGGGCGATTTTCCATATTTTGGTTATCACGTTACAGGCATTCATTTTTATGATGTTGACGGTGGTTTATTTGAGTATTGCTTATAACAAAGCAGAACATTAATTTTTTATTAACCGGCTCTAGGGCTAAAAACTTAACTTCTATTGGAGAACATTATGGAAACTGTAATTACAGCTACAATTATCGGTGCATCTa < 1:237357/217‑1 (MQ=255) ccATTACACCTTGCTTGGGCGATTTTCCATATTTTGGTTATCACGTTACAGGCATTCATTTTTat > 1:265935/1‑65 (MQ=255) ccATTACACCTTGCTTGGGCGATTTTCCATATTTTGGTTATCACGTTACAGGCATTCATTTTTATGATGTTGACGGTGGTTTATTTGAGTATTGCTTATAAc < 1:125534/102‑1 (MQ=255) ccATTACACCTTGCTTGGGCGATTTTCCATATTTTGGTTATCACGTTACAGGCATTCATTTTTATGATGTTGACGGTGGTTTATTTGAGTATTGCTTATAAc > 1:810045/1‑102 (MQ=255) cacCTTGCTTGGGCGATTTTCCATATTTTGGTTATCACGTTACAGGCATTCATTTTTATGATGTTGACGGTGGTTTATTTGAGTATTGCTTATAACAAAGCAGAACATTAATTTTTTATTAACCGGCTCTAGGGCTAAAAACTTAACTTCTATTGGAGAACATTATGGAAACTGTAATTACAGCTACAATTATCGGTGCATCTATCCTTCTTGCATTCGCTGCATTGGGCACGGCAATCGGCTTTGCTAt > 1:390522/1‑250 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |