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(MQ=255) gAATATACCTTACATCCGTTTAATTACTGGGCATTTATCCCTGTTAACTTTATTCTCGAAGCTGTTACTTTACTGGCTAAACCGATTTCTCTCGGCTTCCGTTTGTTCGGTAACATGTATGCGGGCGAATTAATCTTTATTCTTATTGCCGTTATGTATTCCGCCAATATGGCGATTGCGGCACTGGGAATTCCATTACACCTTGCTTGGGCGATTTTCCATATTTTGGTTATCACGTTACAGGcattcat > 1:667191/1‑251 (MQ=255) atatACCTTACATCCGTTTAATTACTGGGCATTTATCCCTGTTAACTTTATTCTCGAAGCTGTTACTTTACTGGCTAAACCGATTTCTCTCGGCTTCCGTTTGTTCGGTAACATGTATGCGGGCGAATTAATCTTTATTCTTATTGCCGTTATGTATTCCGCCAATATGGCGATTGCGGCACTGGGAATTCCATTACACCTTGCTTGGGCGATTTTCCATATTTTGGTTATCACGTTACAGGCATTCAttt < 1:333729/251‑1 (MQ=255) ataCCTTACATCCGTTTAATTACTGGGCATTTATCCCTGTTAACTTTATTCTCGAAGCTGTTACTTTACTGGCTAAACCGATTTCTCTCGGCTTCCGTTTGTTCGGTAACATGTATGc < 1:823548/118‑1 (MQ=255) ccTTACATCCGTTTAATTACTGGGCATTTATCCCTGTTAACTTTATTCTCGAAGCTGTTACTTTACTGGCTAAACCGATTTCTCTCGGCTTCCGTTTGTTCGGTAACATGTATGCGGGCGAATTAATCTTTATTCTTATTGCCGTTacgt > 1:426642/1‑147 (MQ=255) 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> 1:596711/1‑180 (MQ=255) ttAACTTTATTCTCGAAGCTGTTACTTTACTGGCTAAACCGATTTCTCTCGGCTTCCGTTTGTTCGGTAACATGTATGCGGGCGAATTAATCTTTATTCTTATTGCCGTTGTGTATTCCGCCAATATGGCGATTGCGGCACTGGGAATTCCATTACACCTTGCTTGGGCGATTTTCCATATTTTGGTTATCACGTTACAGGCATTCATTTTTATGATGTTGACGGTGGTTTATTTGAGTATTGCTTATAAc < 1:739488/251‑1 (MQ=255) ttAACTTTATTCTCGAAGCTGTTACTTTACTGGCTAAACCGATTTCTCTCGGCTTCCGTTTGTTCGGTAACATGTATGCGGGCGAATTAATCTTTATTCTTATTGCCGTTATGTATTCCGCCAATATGGCGATTGCGGCACTGGGAATTCCATTACACCTTGCTTGGGCGATTTTCCATATTTTGGTTATCACGTTACAGGCATTCATTTTTATGATGTTGACGGTGGTTTATTTGAGTATTGCTtattac < 1:816388/251‑4 (MQ=255) ttAACTTTATTCTCGAAGCTGTTACTTTACTGGCTAAACCGATTTCTCTCGGCTTCCGTTTGTTCGGTAACATGTATGCGGGCGAATTAATCTTTATTCTTATTGCCGTTATGTATTCCGCCAATATGGCGATTGCGGCACTGGGAATTCCATTACACCTTGCTTGGGCGATTTTCCATATTTTGGTTATCACGTTACAGGCATTCATTTTTATGATGTTGACGGTGGTTTATTTGAGTATTGCTTATAAc < 1:841623/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |