| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 470,321 | A→G | intergenic (‑93/+76) | unknown ← / ← unknown | Heterodimeric efflux ABC transporter, permease/ATP‑binding subunit 1/Anaerobic C4‑dicarboxylate transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 470,321 | 0 | A | G | 100.0% | 166.9 / NA | 55 | intergenic (‑93/+76) | unknown/unknown | Heterodimeric efflux ABC transporter, permease/ATP‑binding subunit 1/Anaerobic C4‑dicarboxylate transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (30/25); total (30/25) | |||||||||||
TAAGCGAACGCTCAAACGCCCATTGCAAACAAACGGCAAACACCACTGCGCTAATAATGCCGCCAATTAATGCAACCCAGTTCCACAATACATTAATCGCAATCCATTTTTTGCTGTTGGCGACCGTATTTATCAGCCGTTTATCAATCATCATAATGTTTATCTGTCCTTAAATCACCTCAATGAAAGTGCTATATCATAACATTTATATGACAAATGCTAATTAATTTTATTCGTAAAAATAATATATTTCGTGTTTAACGGTTAAATAAAAAAATAGCGCCTGAAATAAGACGCTATTATTCCCCGAAGCAAAATCGTGTTATAGGAAAATATTTGCAAATAATAAGCCTAAGGCTAAGCTGAATGCCATACTCAATAAGCCCGGCAACATGAAGCTGTGATTGAAAATGTATTTACCGATGCGTGTGGTGCCCGTAGTGTCAAAGTCGATAGAGGCAATGATCGGACCGTAGTTCGGAATGAAGA > 1/470075‑470563 | tAAGCGAACGCTCAAACGCCCATTGCAAACAAACGGCAAACACCACTGCGCTAATAATTCCGCCAATTAATGCAACCCAGTTCCACAATACATTAATCGCAATCCATTTTTTGCTGTTGGCGACCGTATTTATCAGCCGTTTATCAATCATCATAATGTTTATCTGTCCTTAAATCACCTCAATGAAAGTGCTATATCATAACATTTATATGACAAATGCTAATTAATTTTATTCGTAAAAATAatgtat < 1:48005/250‑1 (MQ=255) 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TAAGCGAACGCTCAAACGCCCATTGCAAACAAACGGCAAACACCACTGCGCTAATAATGCCGCCAATTAATGCAACCCAGTTCCACAATACATTAATCGCAATCCATTTTTTGCTGTTGGCGACCGTATTTATCAGCCGTTTATCAATCATCATAATGTTTATCTGTCCTTAAATCACCTCAATGAAAGTGCTATATCATAACATTTATATGACAAATGCTAATTAATTTTATTCGTAAAAATAATATATTTCGTGTTTAACGGTTAAATAAAAAAATAGCGCCTGAAATAAGACGCTATTATTCCCCGAAGCAAAATCGTGTTATAGGAAAATATTTGCAAATAATAAGCCTAAGGCTAAGCTGAATGCCATACTCAATAAGCCCGGCAACATGAAGCTGTGATTGAAAATGTATTTACCGATGCGTGTGGTGCCCGTAGTGTCAAAGTCGATAGAGGCAATGATCGGACCGTAGTTCGGAATGAAGA > 1/470075‑470563 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |