| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 470,133 | 0 | G | T | 100.0% | 209.7 / NA | 70 | G32G (GGC→GGA) | unknown | Heterodimeric efflux ABC transporter, permease/ATP‑binding subunit 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (32/38); total (32/38) | |||||||||||
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cGAACGCTCAAACGCCCATTGCAAACAAACGGCAAACACCACTGCGCTAATAATTCCGCCAATTAATGCAACCCAGTTCCACAATACATTAATCGCAATCCATTTTTTGCTGTTGGCGAc > 1:121777/1‑120 (MQ=255) tCAAACGCCCATTGCAAACAAACGGCAAACACCACTGCGCTAATAATTCCGCCAATTAATGCAACCCAGTTCCACAATACATTAATCGCAATCCATTTTTTGCTGTTGGCGACCGTATTTATCAGCCGTTTATCAATCATCATAATGTTTATCTGTCCTTAAATCACCTCAATGAAAGTGCTATATCATAACATTTATATGACAAATGCTAATTAATTTTATTCGTAAAAATAATGTATTTCGTGTTTagc < 1:183792/251‑3 (MQ=255) cAAACGCCCATTGCAAACAAACGGCAAACACCACTGCGCTAATAATTCCGCCAATTAATGCAACCCAGTTCCACaa > 1:306411/1‑76 (MQ=255) gCCCATTGCAAACAAACGGCAAACACCACTGCGCTAATAATTCCGCCAATTAATGCAACCCAGTTCCACAATACATTAATCGCAATCCATTTTTTGCTGTTGGCGACCGTATTTATCAGCCGTTTATCAATCATCATAATGTTTATCTGTCCTTAAATCACCTCAATGAAAGTGCTatat < 1:21357/180‑1 (MQ=255) ttGCAAACAAACGGCAAACACCACTGCGCTAATAATTCCGCCAATTAATGCAACCCAGTTCCACAATACATTAATCGCAATCCATTTTTTGCTGTTGGCGACCGTATTTATCAGCCGTTTATCAATCATCATAATGTTTATCTGTCCTTAAATCACCTCAATGAAAGTGCTatat < 1:170900/175‑1 (MQ=255) ttGCAAACAAACGGCAAACACCACTGCGCTAATAATTCCGCCAATTAATGCAACCCAGTTCCACAATACATTAATCGCAATCCATTTTTTGCTGTTGGCGACCGTATTTATCAGCCGTTTATCAATCATCATAATGTTTATCTGTCCTTAAATCACCTCAATGAAAGTGCTATATCATAACATTTATATGACAAATGCTAATTAATTTTATTCGTAAAAATAATGTATTTCGTGTTTAGCGGTtaaataaa > 1:462610/1‑251 (MQ=255) gCAAACACCACTGCGCTAATAATTCCGCCAATTAATGCAACCCAGTTCCACAATACATTAATCGCAATCCATTTTTTGCTGTTGGCGACCGTATTTATCAGCCGTTTATCAATCATCATAATGTTTATCTGTCCTTAAATCACCTCAATGAAAGTGCTATATCATAACATTTATATGACAAATGCTAATTAATTTTATTCGTAAAAATAATGTATTTCGTGTTTAGCGGTTAAATAAAAAAATAgcgc > 1:898619/1‑248 (MQ=255) aaaCACCACTGCGCTAATAATTCCGCCAATTAATGCAACCCAGTTCCACAATACATTAATCGCAATCCATTTTTTGCTGTTGGCGACCGTATTTATCAGCCGTTTATCAATCATCATAATGTTTATCTGTCCTTAAATCACCTCAATGAAAGTGCTatat > 1:155176/1‑160 (MQ=255) aataatTCCGCCAATTAATGCAACCCAGTTCCACAATACATTAATCGCAATCCATTTTTTGCTGTTGGCGACCGTATTTATCAGCCGTTTATCAATCATCATAATGTTTATCTGTCCTTAAATCACCTCAATGAAAGTGCTATATCATAACATTTATATGACAAATGc < 1:822851/168‑1 (MQ=255) taatTCCGCCAATTAATGCAACCCAGTTCCACAATACATTAATCGCAATCCATTTTTTGCTGTTGGCGACCGTATTTATCAGCCGTTTATCAATCATCATAATGTTTATCTGTCCTTAAATCACCTCAATGAAAGTGCTATATCATAACATTTATATGACAAATGCTAATTAATTTTATTCGTAAAAATAATGTATTTCGTGTTTAGCGGTTAAATAAAAAAATAGCGCCTGAAATAAGACGCTATTATTc < 1:451298/251‑1 (MQ=255) | ATTGTTGATTTACTTGATTAAGCGGCATGGAAGACAGTTTTTGATAAATCAGCGTGCGTAATTTGTGTTTCACCTGCGTACTGGCTTTATAGGACGCTTTCACTGCCATTTTGCCCGCCCAGGCACGTAGTGCCAAACAGGCAATTAAAACGACGGTAAAAATAACCGCACTTTGGAGGGTAAGCGAACGCTCAAACGCCCATTGCAAACAAACGGCAAACACCACTGCGCTAATAATGCCGCCAATTAATGCAACCCAGTTCCACAATACATTAATCGCAATCCATTTTTTGCTGTTGGCGACCGTATTTATCAGCCGTTTATCAATCATCATAATGTTTATCTGTCCTTAAATCACCTCAATGAAAGTGCTATATCATAACATTTATATGACAAATGCTAATTAATTTTATTCGTAAAAATAATATATTTCGTGTTTAACGGTTAAATAAAAAAATAGCGCCTGAAATAAGACGCTATTATTC > 1/469895‑470379 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |