| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 440,144 | T→G | intergenic (‑56/+92) | unknown ← / ← unknown | RecA protein/Bis‑ABC ATPase YheS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 440,144 | 0 | T | G | 100.0% | 240.8 / NA | 83 | intergenic (‑56/+92) | unknown/unknown | RecA protein/Bis‑ABC ATPase YheS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (42/41); total (42/41) | |||||||||||
CTCCACGATACGCCCCATCGGCAAACCGCCGATGCCTAGTGCTAGGTCAAGACCGAAAGAACCGGTGGAAATCGCTTCAATGTCCAGTTTTTGGCTGTCGCCGAGTTTCATGATGGCGCCTTTACCAAATTGTTTTTCAATTTGACCTAACGCCGCGTCGAGTGCTTTTTGCTTTTCTTCTTGAGTTGCCATTTTTATACCTCGGGGAAAATCATTATCAAAAATTCGCGCTTATAATAACTGTATCTATATACAGTATCAAGTGAAATTTTGATCTTTTTAAAAATTCTGTGATACGGCTTCCAAAACGCAATTATTTTGCCGTTATTCCGCCTTCTATTATGCTTGTGCTGTGATGTTTTCCATATCTTCCTGCAAGACTAACCATGCCGCTTCTACTTCTTCCAGTTGCTTTTTCGTCTGCACCTGATCGTTTAAAAGTGCGGTCAGTTTTGCTTTCATTTCGGCATCATACACATTCGGATCCG > 1/439897‑440384 | ctcCACGATCCGCCCCATCGGCAAACCGCCGATGCCTAGTGCTAGGTCAAGACCGAAAGAACCGGTGGAAATCGCTTCAATGTCCAGTTTTTGGCTGTCGCCGAGTTTCATGATGGCGCCTTTACCAAATTGTTTTTCAATTTGACCTAACGCCGCGTCGAGTGCTTTTTGCTTTTCTTCTTGAGTTGCCATTTTTATACCTCGGGGAAAATCATTATCAAAAATTCGCGCTTATAATAACTGTATCgata < 1:898253/251‑1 (MQ=255) 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1:550451/191‑1 (MQ=255) aCCTAACGCCGCGTCGAGTGCTTTTTGCTTTTCTTCTTGAGTTGCCATTTTTATACCTCGGGGAAAATCATTATCAAAAATTCGCGCTTATAATAACTGTATCGATATACAGTATCAAGTGAAATTTTGATCTTTTTAAAAATTCTGTGATACGGCTTCCAAAACGCAATTATTTTGCCGTTATTCCGCCTTCTATTATGCTTGTGCTGTGATGTTTTCCATATCTTCCTGCAAGACTAACCATGCCGCtt > 1:891725/1‑251 (MQ=255) gTCGAGTGCTTTTTGCTTTTCTTCTTGAGTTGCCATTTTTATACCTCGGGGAAAATCATTATCAAAAATTCGCGCTTATAATAACTGTATCGATATACAGTATCAAGTGAAATTTTGATCTTTTTAAAAATTCTGTGATACGGCTTCCAAAACGCAATTATTTTGCCGTTATTCCGCCTTCTATTATGc < 1:484525/189‑1 (MQ=255) gctttttgcttttCTTCTTGAGTTGCCATTTTTATACCTCGGGGAAAATCATTATCAAAAATTCGCGCTTATAATAACTGTATCGATATACAGTATCAAGTGAAATTTTGATCTTTTTAAAAATTCTGTGATACGGCTTCCAAAACGCAATTATTTTGCCGTTATTCCGCCTTCTATTATGCTTGTGCTGTGATGTTTTCCATATCTTCCTGCAAGACTAACCATGCCGCTTCTACTTCTTCCAGTTGCtt > 1:180775/1‑251 (MQ=255) gctttttgcttttCTTCTTGAGTTGCCATTTTTATACCTCGGGGAAAATCATTATCAAAAATTCGCGCTTATAATAACTGTATCGATATACAGTATCAAGTGAAATTTTGATCTTTTTAAAAATTCTGTGATACGGCTTCCAAAACGCAATTATTTTGCCGTTATTCCGCCTTCTATTATGCTTGTGCTGTGATGTTTTCCATATCTTCCTGCAAGACTAACCATGCCGCTTCTACTTCTTCCAGTTGCtt > 1:469762/1‑251 (MQ=255) ttgcttttCTTCTTGAGTTGCCATTTTTATACCTCGGGGAAAATCATTATCAAAAATTCGCGCTTATAATAACTGTATCGATATACAGTATCAAGTGAAATTTTGATCTTTTTAAAAATTCTGTGATACGGCTTCCAAAACGCAATTATTTTGCCGTTATTCCGCCTTCTATTATGc > 1:436849/1‑177 (MQ=255) ttgcttttCTTCTTGAGTTGCCATTTTTATACCTCGGGGAAAATCATTATCAAAAATTCGCGCTTATAATAACTGTATCGATATACAGTATCAAGTGAAATTTTGATCTTTTTAAAAATTCTGTGATACGGCTTCCAAAACGCAATTATTTTGCCGTTATTCCGCCTTCTATTATGCTTGTGCTGTGATGTTTTCCATATCTTCCTGCAAGACTAACCATGCCGCTTCTACTTCTTCCAGTTGCTTTTTCg < 1:600208/251‑1 (MQ=255) cttcttGAGTTGCCATTTTTATACCTCGGGGAAAATCATTATCAAAAATTCGCGCTTATAATAACTGTATCGATATACAGTATCAAGTGAAATTTTGATCTTTTTAAAAATTCTGTGATACGGCTTCCAAAACGCAATTATTTTGCCGTTATTCCGCCTTCTATTATGc > 1:114563/1‑169 (MQ=255) tttttATACCTCGGGGAAAATCATTATCAAAAATTCGCGCTTATAATAACTGTATCGATATACAGTATCAAGTGAAATTTTGATCTTTTTAAAAATTCTGTGATACGGCTTCCAAAACGCAATTATTTTGCCGTTATTCCGCCTTCTATTATGCTTGTGCTGTGATGTTTTCCATATCTTCCTGCAAGACTAACCATGCCGCTTCTACTTCTTCCAGTTGCtt > 1:147232/1‑223 (MQ=255) tttttATACCTCGGGGAAAATCATTATCAAAAATTCGCGCTTATAATAACTGTATCGATATACAGTATCAAGTGAAATTTTGATCTTTTTAAAAATTCTGTGATACGGCTTCCAAAACGCAATTATTTTGCCGTTATTCCGCCTTCTATTATGCTTGTGCTGTGATGTTTTCCATATCTTCCTGCAAGACTAACCATGCCGCTTCTACTTCTTCCAGTTGCTTTTTCGTCTGCACCTGATCGTTTAAAAGt > 1:818815/1‑251 (MQ=255) ttttATACCTCGGGGAAAATCATTATCAAAAATTCGCGCTTATAATAACTGTATCGATATACAGTATCAAGTGAAATTTTGATCTTTTTAAAAATTCTGTGATACGGCTTCCAAAACGCAATTATTTTGCCGTTATTCCGCCTTCTATTATGCTTGTGCTGTGATGTTTTCCATATCTTCCTGCAAGACTAAcc > 1:878481/1‑194 (MQ=255) gAAAATCATTATCAAAAATTCGCGCTTATAATAACTGTATCGATATACAGTATCAAGTGAAATTTTGATCTTTTTAAAAATTCTGTGATACGGCTTCCAAAACGCAATTATTTTGCCGTTATTCCGCCTTCTATTATGCTTGTGc > 1:370000/1‑145 (MQ=255) 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taaCTGTATCGATATACAGTATCAAGTGAAATTTTGATCTTTTTAAAAATTCTGTGATACGGCTTCCAAAACGCAATTATTTTGCCGTTATTCCGCCTTCTATTATGCTTGTGCTGTGATGTTTTCCATATCTTCCTGCAAGACTAACCATGCCGCTTCTACTTCTTCCAGTTGCTTTTTCGTCTGCACCTGATCGTTTAAAAGTGCGGTCAGTTTTGCTTTCATTTCGGCATCATACACATTc < 1:167873/244‑1 (MQ=255) aaCTGTATCGATATACAGTATCAAGTGAAATTTTGATCTTTTTAAAAATTCTGTGATACGGCTTCCAAAACGCAATTATTTTGCCGTTATTCCGCCTTCTATTATGCTTGTGCTGTGATGTTTTCCATATCTTCCTGCAAGACTAACCATGCCGCTTCTACTTCTTCCAGTTGCTTTTTCGTCTGCACCTGATCGTTTAAAAGTGCGGTCAGTTTTGc > 1:623109/1‑218 (MQ=255) aaCTGTATCGATATACAGTATCAAGTGAAATTTTGATCTTTTTAAAAATTCTGTGATACGGCTTCCAAAACGCAATTATTTTGCCGTTATTCCGCCTTCTATTATGCTTGTGCTGTGATGTTTTCCATATCTTCCTGCAAGACTAACCATGCCGCTTCTACTTCTTCCAGTTGCTTTTTCGTCTGCACCTGATCGTTTAAAAGTGCGGTCAGTTTTGCTTTCATTTCGGCATCATACACATTCGGATCCg > 1:393610/1‑250 (MQ=255) cTGTATCGATATACAGTATCAAGTGAAATTTTGATCTTTTTAAAAATTCTGTGATACGGCTTCCAAAACGCAATTATTTTGCCGTTATTCCGCCTTCTATTATGCTTGTGCTGTGATGTTTTCCATATCTTCCTGCAAGACTAACCATGCCGCtt < 1:293017/155‑1 (MQ=255) 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CTCCACGATACGCCCCATCGGCAAACCGCCGATGCCTAGTGCTAGGTCAAGACCGAAAGAACCGGTGGAAATCGCTTCAATGTCCAGTTTTTGGCTGTCGCCGAGTTTCATGATGGCGCCTTTACCAAATTGTTTTTCAATTTGACCTAACGCCGCGTCGAGTGCTTTTTGCTTTTCTTCTTGAGTTGCCATTTTTATACCTCGGGGAAAATCATTATCAAAAATTCGCGCTTATAATAACTGTATCTATATACAGTATCAAGTGAAATTTTGATCTTTTTAAAAATTCTGTGATACGGCTTCCAAAACGCAATTATTTTGCCGTTATTCCGCCTTCTATTATGCTTGTGCTGTGATGTTTTCCATATCTTCCTGCAAGACTAACCATGCCGCTTCTACTTCTTCCAGTTGCTTTTTCGTCTGCACCTGATCGTTTAAAAGTGCGGTCAGTTTTGCTTTCATTTCGGCATCATACACATTCGGATCCG > 1/439897‑440384 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |