| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 404,348 | T→G | intergenic (+30/‑339) | unknown → / → unknown | Glycerol‑3‑phosphate regulon repressor GlpR/TonB‑dependent receptor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 404,348 | 0 | T | G | 100.0% | 197.4 / NA | 68 | intergenic (+30/‑339) | unknown/unknown | Glycerol‑3‑phosphate regulon repressor GlpR/TonB‑dependent receptor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (33/35); total (33/35) | |||||||||||
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ttGCTAGCGTTTTATTAGTTTTTACGTAAAAAGTGCGGTGGATTTTCACCGCACTTTTTTCTTCTTTATCTCCTGTCTTCGCATTTTTTGAATTTCtttttttct < 1:389883/105‑3 (MQ=255) gCGTTTTATTAGTTTTTACGTAAAAAGTGCGGTGGATTTTCACCGCACTTTTTTCTTCTTTATCTCCTGTCTTCGCATTTTTTGAATTTC‑TTTTTTTCTTGCTAAAAACTTATTTTTCTATATAAAATAAGTTACCTTTCGATATTGATAAAAATGCttattt < 1:324612/163‑1 (MQ=255) ttttATTAGTTTTTACGTAAAAAGTGCGGTGGATTTTCACCGCACTTTTTTCTTTTTTATCTCCTGTCTTCGCATTTTTTGAATTTC‑TTTTTTTCTTGCTAAAAAc > 1:529000/1‑106 (MQ=255) attaGTTTTTACGTAAAAAGTGCGGTGGATTTTCACCGCACTTTTTTCTTCTTTATCTCCTGTCTTCGCATTTTTTGAATTTC‑TTTTTTTCTTGCTAAAAACTTATTTTTCTATATAAAATAAGTTACCTTTCGATATTGATAAAAATGCTTATTTATTGATCACTTGTAAAATTGATGCAGCTTATc < 1:221167/188‑1 (MQ=255) attaGTTTTTACGTAAAAAGTGCGGTGGATTTTCACCGCACTTTTTTCTTCTTTATCTCCTGTCTTCGCATTTTTTGAATTTC‑TTTTTTTCTTGCTAAAAACTTATTTTTCTATATAAAATAAGTTACCTTTCGATATTGATAAAAATGCTTATTTATTGATCACTTGTAAAATTGATGCAGCTTATCTGATTGATTTTTCTGCAAACACGTTTTAGCAAAAATCTTATTATTGCTTTTATTGTATTCAtt < 1:278234/251‑1 (MQ=255) gTGCGGTGGATTTTCACCGCACTTTTTTCTTCTTTATCTCCTGTCTTCGCATTTTTTGAATTTC‑TTTTTTTCTTGCTAAAAACTTATTTTTCTATATAAAATAAGTTACCTTTCGATATTGATaaaaa > 1:125431/1‑128 (MQ=255) | ACGATTATCATGAAGTGCAGGTTAAGCGGGCAATTATTGATAATTCCCGCAATACCTTGTTAGTCACCGACCATTCTAAATTCAGCCGCCGCGCTATGGTAAAACTGGGTTCAATCACCGATGTGGAATATGTTTTTACCGACATGGACGTACCACCGAGCATTGATGAACTGCTGAAAAACAAAAATGTCAATTTAGTTGTTTGCTAGCGTTTTATTAGTTTTTACGTAAAAAGTGCTGTGGATTTTCACCGCACTTTTTTCTTCTTTATCTCCTGTCTTCGCATTTTTTGAATTTCTTTTTTTTCTTGCTAAAAACTTATTTTTCTATATAAAATAAGTTACCTTTCGATATTGATAAAAATGCTTATTTATTGATCACTTGTAAAATTGATGCAGCTTATCTGATTGATTTTTCTGCAAACACGTTTTAGCAAAAATCTTATTATTGCTTTTATTGTATTCATT > 1/404110‑404576 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |