| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 352,113 | A→C | C105W (TGT→TGG) | unknown ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 352,113 | 0 | A | C | 100.0% | 240.5 / NA | 79 | C105W (TGT→TGG) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (40/39); total (40/39) | |||||||||||
TAAACTTATCCCAGTTACATTGAAGCATATATGAATTAGAACAACCATTCCTTAGTTTATATGTAGTATATGGTGTATGCAGGTTATTCAAGTTTCTTTGAATAATATCAAAATAAAAGCCATATGAATTTACGTAATCATAATAACCATATCTATCAGGTAGAACGACCAATAAAATTGCATTACGCTTGCTTCGGTTATCTGGACGTCGCTTACTTCTTAGTGAATAAGCAATTTCCCAAGGTATACATTGATCTTTCTCTGATTTCCAAGAATTTTTTATATTGGGGGAGATAAGAACAATGGTAACGGAACTATCAAAAATCTTTTCTGCTAATTTTGAACGAATAGTCTCCGTTTTAAAGCCGGCAAGACTTTCATTATCATTTTCCCCTTTATTGATATGAATATCATCACGCTCAAATTTATTTTGAATAATATCAACATAATCACGAGCAGTTGTTTTATATTGACTATAGAATGAAAAC > 1/351866‑352353 | tAAACTTATCCCAGTTACATTGAAGCATATATGAATTAGAACAACCATTCCTTAGTTTATATGTAGTATATGGTGTATGCAGGTTATTCAAGTTTCTTTGAATAATATCAAAATAAAAGCCATATGAATTTACGTAATCATAATAACCATATCTATCAGGTAGAACGACCAATAAAATTGCATTACGCTTGCTTCGGTTATCTGGACGTCGCTTACTTCTTAGTGAATAAGCAATTTCCCAAGGTATCCAt < 1:498206/251‑1 (MQ=255) 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> 1:172766/1‑248 (MQ=255) cTGGACGTCGCTTACTTCTTAGTGAATAAGCAATTTCCCAAGGTATCCATTGATCTTTCTCTGATTTCCAAGAATTTTTTATATTGGGGGAGATAAGAACAATGGTAACGGAACTATCAAAAATCTTTTCTGCTAATTTTGAACGAATAGTCTCCGTTTTAAAGCCGGCAAGACTTTCATTATCATTTTCCCCTTTATTGATATGAATATCATCACGCTCAAATTTATTTTGAATAATATCAACATAATCa < 1:285473/251‑1 (MQ=255) cGTCGCTTACTTCTTAGTGAATAAGCAATTTCCCAAGGTATCCATTGATCTTTCTCTGATTTCCAAGAATTTTTTATATTGGGGGAGATAAGAACAATGGTAACGGAACTATCAAAAATCTTTTCTGCTAATTTTGAACGAATAGTCTCCGTTTTAAAGCCGGCAAGACTTTCATTATCATTTTCCCCTTTATTGATATGAATATCATCACGCTCAAATTTATTTTGAATAATATCAACATAATCACGAGc < 1:828319/251‑1 (MQ=255) tCGCTTACTTCTTAGTGAATAAGCAATTTCCCAAGGTATCCATTGATCTTTCTCTGATTTCCAAGAATTTTTTATATTGGGGGAGATAAGAACAATGGTAACGGAACTATCAAAAATCTTTTCTGCTAATTTTGAACGAATAGTCTCCGTTTTAAAGCCGGCAAGACTTTCATTATCATTTTccc < 1:700153/185‑1 (MQ=255) gCTTACTTCTTAGTGAATAAGCAATTTCCCAAGGTATCCATTGATCTTTCTCTGATTTCCAAGAATTTTTTATATTGGGGGAGATAAGAACAATGGTAACGGAACTATCAAAAATCTTTTCTGCTAATTTTGAACGAATAGTCTCCGTTTTAAAGCCGGCAAGACTTTCATTATCATTTTCCCCTTTATTGATATGAATatcat > 1:107074/1‑204 (MQ=255) gCTTACTTCTTAGTGAATAAGCAATTTCCCAAGGTATCCATTGATCTTTCTCTGATTTCCAAGAATTGTTTATATTGGGGGAGATAAGAACAATGGTAACGGAACTATCAAAAATCTTTTCTGCTAATTTTGAACGAATAGTCTCCGTTTTAAAGCCGGCAAGACTTTCATTATCATTTTCCCCTTTATTGATATGAATATCATCACGCTCAAATTTATTTTGAATAATATCAACAt < 1:438382/237‑1 (MQ=255) cttcttAGTGAATAAGCAATTTCCCAAGGTATCCATTGATCTTTCTCTGATTTCCAAGAATTTTTTATATTGGGGGAGATAAGAACAATGGTAACGGAACTATCAAAAATCTTTTCTGCTAATTTTGAACGAATAGTCTCCGTTTTAAAGCCGGCAAGACTTTCATTATCATTTTCCCCTTTATTGATATGAATatcat < 1:266652/199‑1 (MQ=255) cttAGTGAATAAGCAATTTCCCAAGGTATCCATTGATCTTTCTCTGATTTCCAAGAATTTTTTATATTGGGGGAGATAAGAACAATGGTAACGGAACTATCAAAAATCTTTTCTGCTAATTTTGAACGAATAGTCTCCGTTTTAAAGCCGGCAAGACTTTCATTATCATTTTCCCCTTTATTGATATGAATATCATCACGCTCAAATTTATTTTGAATAATATCAACATAATCACGAGc > 1:510681/1‑239 (MQ=255) 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ttAGTGAATAAGCAATTTCCCAAGGTATCCATTGATCTTTCTCTGATTTCCAAGAATTTTTTATATTGGGGGAGATAAGAACAATGGTAACGGAACTATCAAAAATCTTTTCTGCTAATTTTGAACGAATAGTCTCCGTTTTAAAGCCGGCAAGACTTTCATTATCATTTTCCCCTTTATTGATATGAATATCATCACGCTCAAATTTATTTTGAATAATATCAACATAATCACGAGCAGTTGTTTTatat < 1:144650/251‑1 (MQ=255) gTGAATAAGCAATTTCCCAAGGTATCCATTGATCTTTCTCTGATTTCCAAGAATTTTTTATATTGGGGGAGATAAGAACAATGGTAACGGAACTATCAAAAATCTTTTCTGCTAATTTTGAACGAATAGTCTCCGTTTTAAAGCCGGCAAGACTTTCATTATCATTTTcccc > 1:373983/1‑172 (MQ=255) ttCCCAAGGTATCCATTGATCTTTCTCTGATTTCCAAGAATTTTTTATATTGGGGGAGATAAGAACAATGGTAACGGAACTATCAAAAATCTTTTCTGCTAATTTTGAACGAATAGTCTCCGTTTTAAAGCCGGCAAGACTTTCATTATCAt > 1:799578/1‑152 (MQ=255) tCCCAAGGTATCCATTGATCTTTCTCTGATTTCCAAGAATTTTTTATATTGGGGGAGATAAGAACAATGGTAACGGAACTATCAAAAATCTTTTCTGCTAATTTTGAACGAATAGTCTCCGTTTTAAAGCCGGCAAGACTTTCATTATCATTTTCCCCTTTATTGATATGAATATCATCACGCTCAAATTTATTTTGAATAATATCAACATAATCACGAGCAGTTGTTTTatat < 1:617548/234‑1 (MQ=255) tCCCAAGGTATCCATTGATCTTTCTCTGATTTCCAAGAATTTTTTATATTGGGGGAGATAAGAACAATGGTAACGGAACTATCAAAAATCTTTTCTGCTAATTTTGAACGAATAGTCTCCGTTTTAAAGCCGGCAAGACTTTCATTATCATTTTCCCCTTTATTGATATGAATATCATCACGCTCAAATTTATTTTGAATAATATCAACATAATCACGAGCAGTTGTTTTatat > 1:633354/1‑234 (MQ=255) cccAAGGTATCCATTGATCTTTCTCTGATTTCCAAGAATTTTTTATATTGGGGGAGATAAGAACAATGGTAACGGAACTATCAAAAATCTTTTCTGCTAATTTTGAACGAATAGTCTCCGTTTTAAAGCCGGCAAGACTTTCATTATCATTTTCCCCTTTATTGATATGAATATCATCACGCTCAAATTTATTTTGAATAATATCAACATAATCACGAGCAGTTGTTTTATATTGACTATAGAATGAAAAc < 1:841710/251‑1 (MQ=255) gTATCCATTGATCTTTCTCTGATTTCCAAGAATTTTTTATATTGGGGGAGATAAGAAc > 1:450421/1‑58 (MQ=255) | TAAACTTATCCCAGTTACATTGAAGCATATATGAATTAGAACAACCATTCCTTAGTTTATATGTAGTATATGGTGTATGCAGGTTATTCAAGTTTCTTTGAATAATATCAAAATAAAAGCCATATGAATTTACGTAATCATAATAACCATATCTATCAGGTAGAACGACCAATAAAATTGCATTACGCTTGCTTCGGTTATCTGGACGTCGCTTACTTCTTAGTGAATAAGCAATTTCCCAAGGTATACATTGATCTTTCTCTGATTTCCAAGAATTTTTTATATTGGGGGAGATAAGAACAATGGTAACGGAACTATCAAAAATCTTTTCTGCTAATTTTGAACGAATAGTCTCCGTTTTAAAGCCGGCAAGACTTTCATTATCATTTTCCCCTTTATTGATATGAATATCATCACGCTCAAATTTATTTTGAATAATATCAACATAATCACGAGCAGTTGTTTTATATTGACTATAGAATGAAAAC > 1/351866‑352353 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |