| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 345,427 | A→G | E625G (GAA→GGA) | unknown → | Biofilm PGA outer membrane secretin PgaA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 345,427 | 0 | A | G | 100.0% | 277.5 / NA | 95 | E625G (GAA→GGA) | unknown | Biofilm PGA outer membrane secretin PgaA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (50/45); total (50/45) | |||||||||||
CGCGATTTACACACCAAAAACCGCAGAGGGGCACGATCTTTATGTGCGTTATACGGAAAGCCGCGTACCGGTGGATGGCAATTCACTCAATGCACAATTTATTGGTGCGGGTACCGAACTGAATTTCTATCCGCTTAATGTGCGTATAGAAGCCGGTAAAGGCATTAAACTCAGCAAACGCGGTTATGTGACATCCGATTTAAGTTATGAGTTAAATCAGCGTTGGGCATTTAATTTGCGCGAACATATTAACGGCACCGATGTTCCGTCAAGAGCAGCTGCGCAAAATGTTTATACCAAAGGTGGCGGCGCGTCTGTAGTTTACACTTATTCTGATCTGTTCCAATTAGGCGGTGGTGTTTATTTTTCCCGCTTTAGTGACAGTAATTTAAGACATGATGCTAATTTATGGCTGAATACAAAAACCTTTAAGCATGATCGCTGGGCGCTAACCAACAATTTCCGTGTGGATTATACGCGAAATAAAAC > 1/345185‑345673 | cgcgATTTACACACCAAAAACCGCAGAGGGGCACGATCTTTATGTGCGTTATACGGAAAGCCGCGTACCGGTGGATGGCAATTCACTCAATGCACAATTTATTGGTGCGGGTACCGAACTGAATTTCTATCCGCTTAATGTGCGTATAGAAGCCGGTAAAGGCATTAAACTCAGCAAACGCGGTTATGTGACATCCGATTTAAGTTATGAGTTAAATCAGCGTTGGGCATTTAATTTGCGCGGACATATTa < 1:80926/251‑1 (MQ=255) 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|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |