| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 2,067,537 | G→C | intergenic (+170/‑44) | unknown → / → unknown | FMN adenylyltransferase (EC 2.7.7.2) / Riboflavin kinase (EC 2.7.1.26)/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 2,067,537 | 0 | G | C | 100.0% | 211.9 / NA | 71 | intergenic (+170/‑44) | unknown/unknown | FMN adenylyltransferase (EC 2.7.7.2) / Riboflavin kinase (EC 2.7.1.26)/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (25/46); total (25/46) | |||||||||||
ATTTCCGTCTTTTGACACACTAAAAGCGCAAATCGCGCAGGATGTGGAGACGGCGAAAAAGGTTTTTGAAGCGTAGAAAAATTTTTGCCTTCCCCTGCTTGCGGGGGAAGGTGTCCGAAGGACGGAAGGGGGCAAAATCCCCCCTCAGCCTTCGGCAGCTCCCCCCGTAAACGGAGGGAGCAAAAAAATAGGAAGGAGGCTTGGTATGACTACTTCGGCTAAACATGTACGTTTTGATGAAAACAGAATGTAGGTTGAGCTTGATGATGCGCGTATTTTAGGCATTCCTTTGGTTTGGTTTCCAAAATTGCTGCGGGCGACAAAAACGGAATTGGAAAATTATGAATTAAGTCGTCGTGGCATTCACTGGGATGCATTGGATGAAGATATTTCAATTGATGGATTACTTGCCGGTCGGGGTGATGTAACACATAACCCACAACAAGTGGCTTAAAATAAATTTAAATTTTTACACAAAACTGGAATAGAAA > 1/2067292‑2067782 | atTTCCGTCTTTTGACACACTAAAAGCGCAAATCGCGCAGGATGTGGAGACGGCGAAAAAGGTTTTTGAAGCGTAGAAAAATTTTTGCCTTCCCCTGCTTGCGGGGGAAGGTGTCCGAAGGACGGAAGGGGGCAAAATCCCCCCTCAGCCTTCGGCAGCTCCCCCCGTAAACGGAGGGAGCAAAAAAATAGGAAGGAGGCTTGGTATGACTACTTCGGCTAAACATGTACGTTTTGATGAAAACACAATGt < 1:236980/251‑1 (MQ=255) 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ATTTCCGTCTTTTGACACACTAAAAGCGCAAATCGCGCAGGATGTGGAGACGGCGAAAAAGGTTTTTGAAGCGTAGAAAAATTTTTGCCTTCCCCTGCTTGCGGGGGAAGGTGTCCGAAGGACGGAAGGGGGCAAAATCCCCCCTCAGCCTTCGGCAGCTCCCCCCGTAAACGGAGGGAGCAAAAAAATAGGAAGGAGGCTTGGTATGACTACTTCGGCTAAACATGTACGTTTTGATGAAAACAGAATGTAGGTTGAGCTTGATGATGCGCGTATTTTAGGCATTCCTTTGGTTTGGTTTCCAAAATTGCTGCGGGCGACAAAAACGGAATTGGAAAATTATGAATTAAGTCGTCGTGGCATTCACTGGGATGCATTGGATGAAGATATTTCAATTGATGGATTACTTGCCGGTCGGGGTGATGTAACACATAACCCACAACAAGTGGCTTAAAATAAATTTAAATTTTTACACAAAACTGGAATAGAAA > 1/2067292‑2067782 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |