| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 2,066,401 | A→G | intergenic (+38/‑40) | unknown → / → unknown | Peptidoglycan lipid II flippase MurJ/FMN adenylyltransferase (EC 2.7.7.2) / Riboflavin kinase (EC 2.7.1.26) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 2,066,401 | 0 | A | G | 100.0% | 234.3 / NA | 78 | intergenic (+38/‑40) | unknown/unknown | Peptidoglycan lipid II flippase MurJ/FMN adenylyltransferase (EC 2.7.7.2) / Riboflavin kinase (EC 2.7.1.26) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (42/36); total (42/36) | |||||||||||
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cGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTGATGGCGTGCATCTGGGGCATCAAGCTATTTTGCGTCATTTGCGGGAAAAAGCCGACGAATTGCAt > 1:610836/1‑245 (MQ=255) tGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTGATGGCGTGCATCTGGGGCATCAAGCTATTTTGCGTCATTTGCGGGAAAAAGCCGACGAATTGCATTTGCCCAt > 1:559910/1‑251 (MQ=255) gATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACAtt > 1:654370/1‑102 (MQ=255) tttGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTGATGGCGTGCATCTGGGGCATCAAGCTATTTTGCGTCATTTGCGGGAAAAAGCCGACGAATTGCATTTGCCCAtggt > 1:830881/1‑251 (MQ=255) tGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTGATGGCGTGCATCTGGGGCATCAAGCTATTTTGCGTCATTTGCGGGAAAAAGCCGACGAATTGCATTTGCCCAtggtgg < 1:845655/251‑1 (MQ=255) ggCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGaaa < 1:568691/121‑1 (MQ=255) ggCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTGATGGCGTGCATc < 1:662740/180‑1 (MQ=255) ggCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTGATGGCGTGCATCTGGGGCATCAAGCTATTTTGCGTCATTTGCGGGAAAAAGCCGACGAATTGCAt > 1:181985/1‑233 (MQ=255) cgcgcACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATCCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATATGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAAttt > 1:48915/1‑164 (MQ=255) cgcACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTGATGGCGTGCATCTGGGGCATCAATCTATTTTGCGTCATTTGCGGGAAAAAGCCGACGAATTGCATTTGCCCATGGTGGTGATGCTg < 1:139482/250‑1 (MQ=255) ccGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTGATGGCGTGCATCTGGGGCATCAAGCTATTTTGCGTCATTTGCGGGAAAAAGCCGACGAATTGCATTTGCCCATGGTGGTGATGCTGTTTGAAc < 1:463009/251‑1 (MQ=255) cgcgTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTGATGGCGTGCATCTGGGGCATCAAGCTATTTTGCGTCATTTGCGGGAAAAAGCCGACGAATTGCATTTGCCCATGGTGGTGATGCTGTTTGAAcc < 1:124985/251‑1 (MQ=255) gTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTGATGGCGTGCATCTGGGGCATCAAGCTATTTTGCGTCATTTGCGGGAAAAAGCCGACGAATTGCAtt > 1:110477/1‑211 (MQ=255) gATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTGATGGCGTGCATCTGGGGCATCAAGCTAttt < 1:260615/159‑1 (MQ=255) gATTTATGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTGATGGCGTGCATCTGGGGCATCAAGCTATTTTGCGTCATTTGCGGGAAAAAGCCGACGAATTGCATTTGCCCATGGTGGTGATGCTGTTTGAACCGCAGCCGCGTGAATATTTTTGCGGTGaa > 1:571205/1‑251 (MQ=255) tGCGTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTGATGGCGTGCATCTGGGGCATCAAGCTATTTTGCGTCATTTGCGGGAAAAAGCCGACGAATTGCATTTGCCCATGGTGGTGATGCTGTTTGAACCGCAGCCGCGTGAATATTTTTGCGGTGAAGATgcg < 1:421263/251‑1 (MQ=255) gTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTGATGGCGTGCATCTGGGGCATCAAGCTATTTTGCGTCATTTGCGGGAAAAAGCCGACGAATTGCATTTGCCCATGGTGGTGATGCTGTTTGAACCGCAGCCGCGTGAATATTTTTGCGGTGAAg < 1:351202/243‑1 (MQ=255) gTATAATGCCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTGATGGCGTGCATCTGGGGCATCAAGCTATTTTGCGTCATTTGCGGGAAAAAGCCGACGAATTGCATTTGCCCATGGTGGTGATGCTGTTTGAACCGCAGCCGCGTGAATATTTTTGCGGTGAAGATGCGCCg > 1:341128/1‑251 (MQ=255) | GAAAGTTTTGTTTGCCGCCGTCATCATGGGATTGTTGGTTTGGTACAACAGCCCAAGCCTGACGGAATGGAACGATATGCGCTTTCTCACCCGTGTACATTGGCTGACGTGGCTCATCGTGTTGGCAGCGATGGTTTACGGTGGCATGTTGGTGCTATTGGGGATTCGCAAACGTGATTTGACGGGCGCGCACTCCGCGTGAAATTAGTTTTTGTGGCGCATGGATTTATGCGTATAATACCGAAGTATTTTTTCACCGAAATTTATGGAACACATTGAATGCAGCTGATTCGAGGCCTGGGAAATTTACCGCAAAATTTGCACGCTTGCGCGTTAACCATCGGTAATTTTGATGGCGTGCATCTGGGGCATCAAGCTATTTTGCGTCATTTGCGGGAAAAAGCCGACGAATTGCATTTGCCCATGGTGGTGATGCTGTTTGAACCGCAGCCGCGTGAATATTTTTGCGGTGAAGATGCGCCG > 1/2066162‑2066644 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |