| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 2,040,742 | G→A | P565P (CCG→CCA) | unknown → | Cytochrome c‑type biogenesis protein DsbD, protein‑disulfide reductase (EC 1.8.1.8) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 2,040,742 | 0 | G | A | 100.0% | 119.3 / NA | 41 | P565P (CCG→CCA) | unknown | Cytochrome c‑type biogenesis protein DsbD, protein‑disulfide reductase (EC 1.8.1.8) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (17/24); total (17/24) | |||||||||||
GAGTTACAACTGGTATTAACGAAGAACCCGAAACCACTGGCGCTATTGGATCTTTACGCGGATTGGTGCGTCGCTTGTAAAGAATTTGAACATAAAACCTTTGCGGAACCACAAGTGCAAGACGCTTTAAAAGACGTTTTGCTGTTAAGAATCGACATGACAAACAACAGCGAAAACAACCGCACTTTAATGAAGCAATTGTCAATAACCGGCTTGCCGACGTTGATGCTTTTTAACCCGCAGGGAAAAGAAATTTCATCGCACCGCATTACCGGTTTTATGGAAGGAGAAGCATTTTTACAAACATTACAAGCAGCAAAAGCGTTAAATAATTAACCAATATTGTTTTTTTCTTTTAAATTTACTGTTAGCATACGCGCCTTCAATTTTCATTATTTTATTTAAGGAAGAAAAAATGTTTTTAAACAAATACAGCAATTACTTTTTAGGCTTATTACGCATTACTTCAGGTTATGC > 1/2040503‑2040979 | gagTTACAACTGGTATTAACGAAGAACCCGAAACCACTGGCGCTATTGGATCTTTACGCGGATTGGTGCGTCGCTTGTAAAGAATTTGAACATAAAACCTTTGCGGAACCACAAGTGCAAGACGCTTTAAAAGACGTTTTGCTGTTAAGAATCGACATGACAAACAACAGCGAAAACAACCGCACTTTAATGAAGCAATTGTCAATAACCGGCTTGCCGACGTTGATGCTTTTTAACCCACAGGGAAAAGa > 1:585963/1‑251 (MQ=255)gagTTACAACTGGTATTAACGAAGAACCCGAAACCACTGGCGCTATTGGATCTTTACGCGGATTGGTGCGTCGCTTGTAAAGAATTTGAACATAAAACCTTTGCGGAACCACAAGTGCAAGACGCTTTAAAAGACGTTTTGCTGTTAAGAATCGACATGACAAACAACAGCGAAAACAACCGCACTTTAATGAAGCAATTGTCAATAACCGGCTTGCCGACGTTGATGCTTTTTAACCCACAGGGAAAAGa > 1:554041/1‑251 (MQ=255)gagTTACAACTGGTATTAACGAAGAACCCGAAACCACTGGCGCTATTGGATCTTTACGCGGATTGGTGCGTCGCTTGTAAAGAATTTGAACATAAAACCTTTGCGGAACCACAAGTGCAAGACGCTTTAAAAGACGTTTTGCTGTTAAGAATCGACATGACAAACAACAGCGAAAACAACCGCACTTTAATGAAGCAATTGTCAATAACCGGCTTGCCGACGTTGATGCTTTTTAACCCACAGGGAAAAGa > 1:503090/1‑251 (MQ=255) ttACAACTGGTATTAACGAAGAACCCGAAACCACTGGCGCTATTGGATCTTTACGCGGATTGGTGCGTCGCTTGTAAAGAATTTGAACATAAAACCTTTGCGGAACCACAAGTGCAAGACGCTTTAAAAGACGTTTTGCTGTTAAGAATCGACATGACAAACAACAGCGAAAACAACCGCACTTTAATGAAGCAATTGTCAATAACCGGCTTGCCGACGTTGATGCTTTTTAACCCACAGGGAAAAGaaa < 1:554849/250‑1 (MQ=255) 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tGCTTTTTAACCCACAGGGAAAAGAAATTTCATCGCACCGCATTACCGGTTTTATGGAAGGAGAAGCATTTTTACAAACATTACAAGCAGCAAAAGCGTTAAATAATTAACCAATATTGTTTTTTTCTTTTAAATTTACTGTTAGCATACGCGCCTTCAATTTTCATTATTTTATTTAAGGAAGAAAAAATGTTTTTAAACAAATACAGCAATTACTTTTTAGGCTTATTACGCATTACTTCAGGTTATGc < 1:286999/251‑1 (MQ=255) ttttAACCCACAGGGAAAAGAAATTTCATCGCACCGCATTACCGGTTTTATGGAAGGAGAAGCATTTTTACAAACATTACAAGCAGCAAAAGCGTTAAATAATTAACCAATATTGTTTTTTTCTTTTAAATTTACTGTTAGCATAc > 1:372826/1‑146 (MQ=255) | GAGTTACAACTGGTATTAACGAAGAACCCGAAACCACTGGCGCTATTGGATCTTTACGCGGATTGGTGCGTCGCTTGTAAAGAATTTGAACATAAAACCTTTGCGGAACCACAAGTGCAAGACGCTTTAAAAGACGTTTTGCTGTTAAGAATCGACATGACAAACAACAGCGAAAACAACCGCACTTTAATGAAGCAATTGTCAATAACCGGCTTGCCGACGTTGATGCTTTTTAACCCGCAGGGAAAAGAAATTTCATCGCACCGCATTACCGGTTTTATGGAAGGAGAAGCATTTTTACAAACATTACAAGCAGCAAAAGCGTTAAATAATTAACCAATATTGTTTTTTTCTTTTAAATTTACTGTTAGCATACGCGCCTTCAATTTTCATTATTTTATTTAAGGAAGAAAAAATGTTTTTAAACAAATACAGCAATTACTTTTTAGGCTTATTACGCATTACTTCAGGTTATGC > 1/2040503‑2040979 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |