| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 2,038,989 | C→T | intergenic (‑84/‑59) | unknown ← / → unknown | Lysine decarboxylase family/Cytochrome c‑type biogenesis protein DsbD, protein‑disulfide reductase (EC 1.8.1.8) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 2,038,989 | 0 | C | T | 100.0% | 245.5 / NA | 85 | intergenic (‑84/‑59) | unknown/unknown | Lysine decarboxylase family/Cytochrome c‑type biogenesis protein DsbD, protein‑disulfide reductase (EC 1.8.1.8) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (45/40); total (45/40) | |||||||||||
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GGAAAGTACCGTATCCGCCAACACGCCCATCAATCCCGCCTTTCCGCCGCCATAAACTAACGTATGTCGATGTTGCGTAATCCATTCGCCTAATTGAATAGTCACTTGGCGATAGCTCGGCAAATTGTCGAGTGCCGCGCCACAATAAACCACAATGTTCATTTGATTGCCTCAGTTATTTTGCATTGATAAATTTTACGCCGAATTCCATATGGAATAAATCGCAACAATAGGTATAACAACCTCCAAAGCATGATATTTTGCAGCAATTTATTTTTGCTAATGCTAGAATGAGCAACATTTTATGGAAGATAACAACCGTTTTATGAAAAGATTTCTCCTCATTATCCTCTGCTTTTTCGTGACATTCAATGTGCAAGCCGTGGATCTGTTTAACCAAAAGCCAAAATTTTTACCGGTCGATCAAGCGTTTCAACTTCAGGCAGAACAATATGGCAACGACATTTCACTTAATTGGCAAAT > 1/2038744‑2039226 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |