| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 2,026,259 | A→G | intergenic (‑197/‑69) | unknown ← / → unknown | Octaprenyl diphosphate synthase (EC 2.5.1.90)/LSU ribosomal protein L21p |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 2,026,259 | 0 | A | G | 100.0% | 236.7 / NA | 83 | intergenic (‑197/‑69) | unknown/unknown | Octaprenyl diphosphate synthase (EC 2.5.1.90)/LSU ribosomal protein L21p |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (45/38); total (45/38) | |||||||||||
TTGCATATCCCCATGGCTTAACGCCTGGATTGCCTTCATATCCATTAAATTTGTTGTATTCATTCTGTTAATTCGACTGATTAAAACTGATTAAATCAGGTTCGGAGGAAACTAAAAACTAAAGTGCGGTGGATTTTACCTGATTTTTCAGGCTTTCTGAAATCAAACTGCCGAAATTGCGAAATTTTTTATTTTCTCGTAAATAAATTCTTGCTATCCCCTAAATTTTTCCGTAGAATTCACGCCCTATTTATATGAATTTTATGTGCGAAATGAAACAACATTAGAGCACAATTATAGCGGAGTATTTATGTACGCAGTTTTCCAAAGTGGCGGTAAACAACACCGAGTAAGCGAAGGTCAAGTGGTTCGTTTGGAAAAACTTGAACTTGCAGCCGGCGCAACAGTTGAGTTTGATTCGGTGTTGATGGTTGCTAATGGTGAAGATGTTAAAATCGGTGCACCGGTCGTTGCCGGCGCGAAAGTAG > 1/2026018‑2026505 | ttGCATATCCCCATGGCTTAACGCCTGGATTGCCTTCATATCCATTAAATTTGTTGTATTCATTCTGTTAATTCGACTGATTAAAACTGATTAAATCAGGTTCGGAGGAAACTAAAAACTAAAGTGCGGTGGATTTTACCTGATTTTTCAGGCTTTCTGAAATCAAACTGCCGAAATTGCGAAATTTTTTATTTTCTCGTAAATAAATTCTTGCTATCCCCTAAATTTTTCCGTAGAATTCGCGCCCTAtt > 1:357426/1‑251 (MQ=255) 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cTGAAATCAAACTGCCGAAATTGCGAAATTTTTTATTTTCTCGTAAATAAATTCTTGCTATCCCCTAAATTTTTCCGTAGAATTCGCGCCCTATTTATATGAATTTTATGTGCGAAATGAAACAACATTAGAGCACAATTATAGCGGAGTATTTATGTACGCAGTTTTCCAAAGTGGCGGTAAACAACACCGAGTAAGCGAAGGTCAAGTGGTTCGTTTGGAAAAACTTGAACTTGCAGCCGGCGCAACAg < 1:749750/251‑1 (MQ=255) gAAATCAAACTGCCGAAATTGCGAAATTTTTTATTTTCTCGTAAATAAATTCTTGCTATCCCCTAAATTTTTCCGTAGAATTCGCGCCCTATTTATATGAATTTTATGTGCGAAATGAAACAACATTAGAGCACAATTATAGCGGAGTATTTATGTACGCAGTTTTCCAAAGTGGCGGTAAACAACACCGAGTAAGCGAAGGTCAAGTGGTTCGTTTGGAAAAACTTGAACTTGCAGCCGGCGCAACAGtt > 1:893147/1‑251 (MQ=255) tCAAACTGCCGAAATTGCGAAATTTTTTATTTTCTCGTAAATAAATTCTTGCTATCCCCTAAATTTTTCCGTAGAATTCGCGCCCTATTTATATGAATTTTATGTGCGAAATGAAACAACATTAGAGCACAATTATAGCGGAGTATTTATg < 1:312329/151‑1 (MQ=255) cGAAATTTTTTATTTTCTCGTAAATAAATTCTTGCTATCCCCTAAATTTTTCCGTAGAATTCGCGCCCTATTTATATGAATTTTATGTGCGAAATGAAACAACATTAGAGCACAATTATAGCGGAGTATTTATGTACGCAGTTTTCCAAAGTGGCGGTAAACAACACCGAGTAAGCGAAGGTCAAGTGGTTCGTTTGGAAAAACTTGAACTTGCAGCCGGCGCAACAGTTGAGTTTGATTCGGTGTTGAt < 1:661698/250‑1 (MQ=255) aTTTTTTATTTTCTCGTAAATAAATTCTTGCTATCCCCTAAATTTTTCCGTAGAATTCGCGCCCTATTTATATGAATTTTATGTGCGAAATGAAACAACATTAGAGCACAATTATAGCGGAGTATTTATGTACGCAGTTTTCCAAAGTGGCGGTAAACAACACCGAGTAAGCGAAGGTCAAGTGGTTCGTTTGGAAAAACTTGAACTTGCAGCCGGCGCAACAGTTGAGTTTGATTCGGTGTTGATGGTTg > 1:226751/1‑251 (MQ=255) aTTTTCTCGTAAATAAATTCTTGCTATCCCCTAAATTTTTCCGTAGAATTCGCGCCCTATTTATATGAATTTTATGTGCGAAATGAAACAACATTAGAGCACAATTATAGCGGAGTATTTATGTACGCAGTTTTCCAAAGTGGCGGTAAACAACACCGAGTAAGCGAAGGTCAAGTGGTTCGTTTGGAAAAACTTGAACTTGCAGCCGGCGCAACAGTTGAGTTTGATTCGGTGTTGATGGTTGCTAATgg < 1:659215/251‑1 (MQ=255) ctcGTAAATAAATTCTTGCTATCCCCTAAATTTTTCCGTAGAATTCGCGCCCTATTta > 1:516759/1‑58 (MQ=255) ctcGTAAATAAATTCTTGCTATCCCCTAAATTTTTCCGTAGAATTCGCGCCCTATTTATATGAATTTTATGTGCGAAATGAAACAACATTAGAGCACAATTATAGCGGAGTATTTATGTACGCAGTTTTCCAAAGTGGCGGTAAACAACACCGAGTAAGCGAAGGTCAAGTGGTTCGTTTGGAAAAACTTGAACTTGCAGCCGGCGCAACAGTTGAGTTTGATTCGGTGTTGATGGTTGCTAATGGTGAAg < 1:391521/251‑1 (MQ=255) 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TTGCATATCCCCATGGCTTAACGCCTGGATTGCCTTCATATCCATTAAATTTGTTGTATTCATTCTGTTAATTCGACTGATTAAAACTGATTAAATCAGGTTCGGAGGAAACTAAAAACTAAAGTGCGGTGGATTTTACCTGATTTTTCAGGCTTTCTGAAATCAAACTGCCGAAATTGCGAAATTTTTTATTTTCTCGTAAATAAATTCTTGCTATCCCCTAAATTTTTCCGTAGAATTCACGCCCTATTTATATGAATTTTATGTGCGAAATGAAACAACATTAGAGCACAATTATAGCGGAGTATTTATGTACGCAGTTTTCCAAAGTGGCGGTAAACAACACCGAGTAAGCGAAGGTCAAGTGGTTCGTTTGGAAAAACTTGAACTTGCAGCCGGCGCAACAGTTGAGTTTGATTCGGTGTTGATGGTTGCTAATGGTGAAGATGTTAAAATCGGTGCACCGGTCGTTGCCGGCGCGAAAGTAG > 1/2026018‑2026505 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |