| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 2,017,439 | T→G | N452K (AAT→AAG) | unknown → | Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 2,017,439 | 0 | T | G | 100.0% | 225.4 / NA | 76 | N452K (AAT→AAG) | unknown | Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (32/44); total (32/44) | |||||||||||
CACCTTAACCACAGGTTTACGTTACGATCACTTCTCATTCCGAGCTATGGATGGCAGAAAATCAAACAAAGGTAATTTAAACCCAAGTTTTGGTTTAATCTATGAAGTAACGAAGGATTTAAGTTTTAGTGCCAGCTTAAACTACGCAACCCGTAGTCCTCGTTTCCGGGAAATTCTATTGTCGTCAGGAACTACCAGAGGAAACCCCGCAGTCTATTCCATTGCCGGCAATATTAAACCTGAAAATTCACGCAATACGGAAGTCGGCTTCAACTATAAATTAGCCGATAGCCTTTCATTAAACGGTAGCTATTTCTGGCAAACGATTCAGGATACTCACGCGTTCACTCAAATTAGACCGGGTTATTTTGAAATTCAAAATGCAGGTAAGTTAAGAAATAGCGGTTACGAATTAGGTGCGGCATATAAATATGAAGGTTTAACTTTACGTGCTGGTGTAGCCTATAGCAAGCCTGAATTAGATGGCAGAAC > 1/2017193‑2017684 | cACCTTAACCACAGGTTTACGTTACGATCACTTCTCATTCCGAGCTATGGATGGCAGAAAATCAAACAAAGGTAATTTAAACCCAAGTTTTGGTTTAATCTATGAAGTAACGAAGGATTTAAGTTTTAGTGCCAGCTTAAACTACGCAACCCGTAGTCCTCGTTTCCGGGAAATTCTATTGTCGTCAGGAACTACCAGAGGAAACCCCGCAGTCTATTCCATTGCCGGCAATATTAAACCTGAAAAGTCa > 1:836997/1‑250 (MQ=255) 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> 1:771118/1‑241 (MQ=255) ggTTTAATCTATGAAGTAACGAAGGATTTAAGTTTTAGTGCCAGCTTAAACTACGCAACCCGTAGTCCTCGTTTCCGGGAAATTCTATTGTCGTCAGGAACTACCAGAGGAAACCCCGCAGTCTATTCCATTGCCGGCAATATTAAACCTGAAAAGTCACGCAATACGGAAGTCGGCTTCAACTATAAATTAGCCGATAGCCTTTCATTAAACGGTAGCTATTTCTGGCAAACGATTCAGGATACTCAcg > 1:850924/1‑250 (MQ=255) aaTCTATGAAGTAACGAAGGATTTAAGTTTTAGTGCCAGCTTAAACTACGCAACCCGTAGTCCTCGTTTCCGGGAAATTCTATTGTCGTCAGGAACTACCAGAGGAAACCCCGCAGTCTATTCCATTGCCGGCAATATTAAACCTGAAAAGTCACGCAATACGGAAGTCGGc < 1:305856/172‑1 (MQ=255) aaTCTATGAAGTAACGAAGGATTTAAGTTTTAGTGCCAGCTTAAACTACGCAACCCGTAGTCCTCGTTTCCGGGAAATTCTATTGTCGTCAGGAACTACCAGAGGAAACCCCGCAGTCTATTCCATTGCCGGCAATATTAAACCTGAAAAGTCACGCAATACGGAAGTCGGCTTCAACTATAAATTAGCCGATAGCCTTTCATTAAACGGTAGCTATTTCTGGCAAACGATTCAGGATACTCACGCGTTCa > 1:739035/1‑251 (MQ=255) cTATGAAGTAACGAAGGATTTAAGTTTTAGTGCCAGCTTAAACTACGCAACCCGTAGTCCTCGTTTCCGGGAAATTCTATTGTCGTCAGGAACTACCAGAGGAAACCCCGCAGTCTATTCCATTGCCGGCAATATTAAACCTGAAAAGTCACGCAATACGGAAGTCGGCTTCAACTATAAATTAGcc < 1:596924/187‑1 (MQ=255) 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1:296866/251‑1 (MQ=255) ccATTGCCGGCAATATTAAACCTGAAAAGTCACGCAATACGGAAGTCGGCTTCAACTATAAATTAGCCGATAGCCTTTCATTAAACGGTAGCTATTTCTGGCAAACGATTCAGGATACTCACGCGTTCACTCAAATTAGACCGGGTTATTTTGAAATTCAAAATGCAGGTAAGTTGAGAAATAGCGGTTACGAATTAGGTGCGGCATATAAATATGAAGGTTTAACTTTACGTGCTGGTGTGGCCTATAg > 1:505858/1‑250 (MQ=255) ttGCCGGCAATATTAAACCTGAAAAGTCACGCAATACGGAAGTCGGCTTCAACTATAAATTAGCCGATAGCCTTTCATTAAACGGTAGCTATTTCTGGCAAACGATTCAGGATACTCACGCGTTCACTCAAATTAGACCGGGTTATTTTGAAATTCAAAATGCAGGTAAGTTGAGAAATAGCGGTTACGAATTAGGTGCGGCATATAAATATGAAGGTTTAACTTTACGTGCTGGTGTGGCCTATAGCAAg < 1:250472/251‑1 (MQ=255) gCAATATTAAACCTGAAAAGTCACGCAATACGGAAGTCGGCTTCAACTATAAATTAGCCGATAGCCTTTCATTAAACGGTAGCTATTTCTGGCAAACGATTCAGGATACTCACGCGTTCACTCAAATTAGACCGGGTTATTTTGAAATTCAAAATGCAGGTAAGTTGAGAAATAGCGGTTACGAATTAGGTGCGGCATATAAATATGAAGGTTTAACTTTACGTGCTGgtatcataactcgtat < 1:119815/244‑15 (MQ=255) atatTAAACCTGAAAAGTCACGCAATACGGAAGTCGGCTTCAACTATAAATTAGCCGATAGCCTTTCATTAAACGGTAGCTATTTCTGGCAAACGATTCAGGATACTCACGCGTTCACTCAAATTAGACCGGGTTATTTTGAAATTCAAAATGCAGGTAAGt < 1:712797/162‑1 (MQ=255) atatTAAACCTGAAAAGTCACGCAATACGGAAGTCGGCTTCAACTATAAATTAGCCGATAGCCTTTCATTAAACGGTAGCTATTTCTGGCAAACGATTCAGGATACTCACGCGTTCACTCAAATTAGACCGGGTTATTTTGAAATTCAAAATGCAGGTAAGTTGAGAAATAGCGGTTACGAATTAgg < 1:613729/187‑1 (MQ=255) atatTAAACCTGAAAAGTCACGCAATACGGAAGTCGGCTTCAACTATAAATTAGCCGATAGCCTTTCATTAAACGGTAGCTATTTCTGGCAAACGATTCAGGATACTCACGCGTTCACTCAAATTAGACCGGGTTATTTTGAAATTCAAAATGCAGGTAAGTTGAGAAATAGCGGTTACGAATTAGGTGCGGCATATAAATATGAAGGTTTAACTTTACGTGCTGGTGTGGCCTATAGCAAGCCTGAATTa > 1:198622/1‑251 (MQ=255) atatTAAACCTGAAAAGTCACGCAATACGGAAGTCGGCTTCAACTATAAATTAGCCGATAGCCTTTCATTAAACGGTAGCTATTTCTGGCAAACGATTCAGGATACTCACGCGTTCACTCAAATTAGACCGGGTTATTTTGAAATTCAAAATGCAGGTAAGTTGAGAAATAGCGGTTACGAATTAGGTGCGGCATATAAATATGAAGGTTTAACTTTACGTGCTGGTGTGGCCTATAGCAAGCCTGAATTa > 1:81925/1‑251 (MQ=255) 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CACCTTAACCACAGGTTTACGTTACGATCACTTCTCATTCCGAGCTATGGATGGCAGAAAATCAAACAAAGGTAATTTAAACCCAAGTTTTGGTTTAATCTATGAAGTAACGAAGGATTTAAGTTTTAGTGCCAGCTTAAACTACGCAACCCGTAGTCCTCGTTTCCGGGAAATTCTATTGTCGTCAGGAACTACCAGAGGAAACCCCGCAGTCTATTCCATTGCCGGCAATATTAAACCTGAAAATTCACGCAATACGGAAGTCGGCTTCAACTATAAATTAGCCGATAGCCTTTCATTAAACGGTAGCTATTTCTGGCAAACGATTCAGGATACTCACGCGTTCACTCAAATTAGACCGGGTTATTTTGAAATTCAAAATGCAGGTAAGTTAAGAAATAGCGGTTACGAATTAGGTGCGGCATATAAATATGAAGGTTTAACTTTACGTGCTGGTGTAGCCTATAGCAAGCCTGAATTAGATGGCAGAAC > 1/2017193‑2017684 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |