| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 2,002,092 | T→C | intergenic (‑399/‑53) | unknown ← / → unknown | Cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I (EC 1.10.3.‑)/Chromosome segregation ATPases |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 2,002,092 | 0 | T | C | 100.0% | 191.3 / NA | 67 | intergenic (‑399/‑53) | unknown/unknown | Cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I (EC 1.10.3.‑)/Chromosome segregation ATPases |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (36/31); total (36/31) | |||||||||||
AGGTGGCATATTCTACTATTAAACGTAAGGATAAAAAATAGTAAATTATGCCAAGCTGATCACATTTTTAGATATAAATCAAAAATAATCAAACATAGGTGTTTTTTACTATTTTGCTCAAGATCAAATTATAAATTTCAATAACATCTTTGCAACACAAAGCATAGCGCCCTTGACCCGGTATGATTCAGTTCTAACAGTTGAGATTAAAAACTAGACATCACACATAAATTCTGATAACTTCTCGCCCAGTTTTATTGATTTCTTCCAACTTAACAAACGTAGGTCTCTCAGATGACAAACAAAATAACCGGAATTCTAACCGCACTTTGCATGGCAATCACTGTCAACAACGTTGCAAATGCTGCTCAAAACGATAAAAAAGCAGTAGAAATGCCAAAGCAGTGCAAAGATTTATTTAGTGAAGCCGAAAATTTAATTGCCGAAGCGGAAAGACAGCCCGGTACACATACCC > 1/2001851‑2002325 | aGGTGGCATATTCTACTATTAAACGTAAGGATAAAAAATAGTAAATTATGCCAAGCTGATCACATTTTTAGATATAAATCAAAAATAATCAAACATAGGTGTTTTTTACTATTTTGCTCAAGATCAAATTATAAATTTCAATAACATCTTTGCAACACAAAGCATAGCGCCCTTGACCCGGTATGATTCAGTTCTAACAGTTGAGATTAAAAACTAGACATCACACATAAATTCTGATAACCTCTCGCCCa > 1:804082/1‑251 (MQ=255) 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caTAAATTCTGATAACCTCTCGCCCAGTTTTATTGATTTCTTCCAACTTAACAAACGTAGGTCTCTCAGATGACAAACAAAATAACCGGAATTCTAACCGCACTTTGCATGGCAATCACTGTCAACAACGTTGCAAATGCTGCTCAAAACGATAAAAAAGCAGTAGAAATGCCAAAGCAGTGCAAAGATTTATTTAGTGAAGCCGAAAATTTAATTGCCGAAGCGGAAAGACAGCCCGGTac > 1:53962/1‑242 (MQ=255) caTAAATTCTGATAACCTCTCGCCCAGTTTTATTGATTTCTTCCAACTTAACAAACGTAGGTCTCTCAGATGACAAACAAAATAACCGGAATTCTAACCGCACTTTGCATGGCAATCACTGTCAACAACGTTGCAAATGCTGCTCAAAACGATAAAAAAGCAGTAGAAATGCCAAAGCAGTGCAAAGATTTATTTAGTGAAGCCGAAAATTTAATTGCCGAAGCGGAAAGACAGCCCGGTACACATAccc < 1:485134/250‑1 (MQ=255) ttCTGATAACCTCTCGCCCAGTTTTATTGATTTCTTCCAACTTAACAAACGTAGGTCTCTCAGATGACAAACAAAATAACCGGAATTCTAACCGCACTTTGCATGGCAATCACTGTCAACAACGTTGCAAATGCTGCTCAAAACGATAAAAAAGCAGTAGAAATGCCAAAGCAGTGCAAAGATTTATTTAGTGAAGCCGAAAATTTAATTGCCGAAGCGGAAAGACAGCCCGGTac < 1:332183/236‑1 (MQ=255) cTGATAACCTCTCGCCCAGTTTTATTGATTTCTTCCAACTTAACAAACGTAGGTCTCTCAGATGACAAACAAAATAACCGGAATTCTAACCGCACTTTGCATGGCAATCACTGTCAACAACGTTGCAAAtgc < 1:590682/132‑1 (MQ=255) gATAACCTCTCGCCCAGTTTTATTGATTTCTTCCAACTTAACAAACGTAGGTCTCTCAGATGACAAACAAAATAACCGGAATTCTAACCGCACTTTGCATGGCAATCACTGTCAACAACGTTGCAAAtgc < 1:768757/130‑1 (MQ=255) | AGGTGGCATATTCTACTATTAAACGTAAGGATAAAAAATAGTAAATTATGCCAAGCTGATCACATTTTTAGATATAAATCAAAAATAATCAAACATAGGTGTTTTTTACTATTTTGCTCAAGATCAAATTATAAATTTCAATAACATCTTTGCAACACAAAGCATAGCGCCCTTGACCCGGTATGATTCAGTTCTAACAGTTGAGATTAAAAACTAGACATCACACATAAATTCTGATAACTTCTCGCCCAGTTTTATTGATTTCTTCCAACTTAACAAACGTAGGTCTCTCAGATGACAAACAAAATAACCGGAATTCTAACCGCACTTTGCATGGCAATCACTGTCAACAACGTTGCAAATGCTGCTCAAAACGATAAAAAAGCAGTAGAAATGCCAAAGCAGTGCAAAGATTTATTTAGTGAAGCCGAAAATTTAATTGCCGAAGCGGAAAGACAGCCCGGTACACATACCC > 1/2001851‑2002325 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |