| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,999,649 | C→T | V155V (GTG→GTA) | unknown ← | Cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II (EC 1.10.3.‑) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,999,649 | 0 | C | T | 100.0% | 236.0 / NA | 81 | V155V (GTG→GTA) | unknown | Cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II (EC 1.10.3.‑) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (47/34); total (47/34) | |||||||||||
GTGATCAATCACACTGGTGACAACAAAACCATCTTTGAAAGATAACCATACACCTGCCAACACAAAGGCGATTAATGTCACGGTTGCACCCACCTGAGAAATCACGCAAGCGCGTGCACGCAATTCTGACGTGGTTTTCATTTGCAGCCAGTTCGCACCATGGGTGGTTAACATTGCCAAACTGATTACACCACAAAGCAATGCAAACGGATTTAACAACCCAAAGAATGTACCGGTGTATTGCACCTGTTGTAACTCATTGAATTCAAACGGAACACCCTGTAATAAGTTACCAAATGCTACACCGAATACCAAGGACGGAACAAATCCACCGATAAACAACCCCCAATCCCATGCCTTACGCCAGGTTGGATTATCAATTTTGGCACGATATTCAAAACCGACAGGACGGAAAAATAAGGCGGCTAACACTAAAATCATCGCAATAAAGAAACCGGAGAATGAGGTTGCATAGACTAACGGCCATG > 1/1999406‑1999893 | gtgATCAATCACACTGGTGACAACAAAACCATCTTTGAAAGATAACCATACACCAGCCAACACAAAGGCGATTAATGTCACGGTTGCACCCACCTGAGAAATCACGCAAGCGCGTGCACGCAATTCTGACGTGGTTTTCATTTGCAGCCAGTTCGCACCATGGGTGGTTAACATTGCCAAACTGATTACACCACAAAGCAATGCACACGGATTTAACAACCCAAAGAATGTACCGGTGTATTGTACCtgtt > 1:365088/1‑251 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1:456934/161‑1 (MQ=255) | GTGATCAATCACACTGGTGACAACAAAACCATCTTTGAAAGATAACCATACACCTGCCAACACAAAGGCGATTAATGTCACGGTTGCACCCACCTGAGAAATCACGCAAGCGCGTGCACGCAATTCTGACGTGGTTTTCATTTGCAGCCAGTTCGCACCATGGGTGGTTAACATTGCCAAACTGATTACACCACAAAGCAATGCAAACGGATTTAACAACCCAAAGAATGTACCGGTGTATTGCACCTGTTGTAACTCATTGAATTCAAACGGAACACCCTGTAATAAGTTACCAAATGCTACACCGAATACCAAGGACGGAACAAATCCACCGATAAACAACCCCCAATCCCATGCCTTACGCCAGGTTGGATTATCAATTTTGGCACGATATTCAAAACCGACAGGACGGAAAAATAAGGCGGCTAACACTAAAATCATCGCAATAAAGAAACCGGAGAATGAGGTTGCATAGACTAACGGCCATG > 1/1999406‑1999893 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |