| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,988,095 | A→G | T90T (ACA→ACG) | unknown → | Ribosomal‑protein‑S18p‑alanine acetyltransferase (EC 2.3.1.128) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,988,095 | 0 | A | G | 100.0% | 164.9 / NA | 59 | T90T (ACA→ACG) | unknown | Ribosomal‑protein‑S18p‑alanine acetyltransferase (EC 2.3.1.128) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (32/27); total (32/27) | |||||||||||
ATTTTGATCGTCTTTATCTCATTGAGCAGGCGGCACACGCGGTGCCTTGGAGCTTAGGCACGCTGAAAAATAATCAGGGCAAACGTTACCTCAATTTGAAAATCGGCGAAGAAAGCCGAATCGACGGTTTTGCCATTTGCCAGACGGTGTTGGATGAAGCCACGCTGTTTAATATCGCCGTGGATCCGCAACAGCAGGGATTGGGGC‑TGGGGCGCCGCTTATTAAGCGAGCTGATGACACAATTAAAACAAAAAAGCATTCTGACCTTGTGGCTGGAAGTGCGCGAATCCAATAAAAAAGCCCAAGCGCTGTATGATTCGCTGGGCTTTAATCAGGTGGATATTCGCAAAAATTATTATCCCACCCCCGACGGCAAACGGGAAAATGCCGTGGTGATGGCGGCGTATTTATAGGCTATTTTTCCCTTTTGATAGCTTGCAACATCGGCGCAAACCAAGCGTTTACCTGCCGATTGATCCAATTC > 1/1987857‑1988340 | aTTTTGATCGTCTTTATCTCATTGAGCAGGCGGCACACGCGATGCCTTGGAGCTTAGGCACACTGAAAAATAATCAGGGCGAACGTTACTTCAATTTGAAAATCGGCGAAGAAAGCCGAATCGACGGCTTTGCTATTTGCCAAACGGTGTTGGATGAAGCCACGCTGTTTAATATCGCCTTGGATCCGCAAAAACAGGGGCGGGGAT‑TGGGGCGCCGTTTATTAACCGAGCTGATGACGCAGTTAAAACa < 1:133945/250‑1 (MQ=255) ttGATCGTCTTTATCTCATTGAGCAGGCGGCACACGCGATGCCTTGGAGCTTAGGCACACTGAAAAATAATCAGGGCGAACGTTACTTCAATTTGAAAATCGGCGAAGAAAGCCGAATCGACGGCTTTGCTATTTGCCAAACGGTGTTGGATGAAGCCACGCTGTTTAATATCGCCTTGGATCCGCAAAAACAGGGGCGGGGAT‑TGGGGCGCCGTTTATTAACCGAGCTGATGACGCAGTTAAAACaaaaa > 1:548931/1‑251 (MQ=255) tCTTTATCTCATTGAGCAGGCGGCACACGCGATGCCTTGGAGCTTAGGCACACTGAAAAATAATCAGGGCGAACGTTACTTCAATTTGAAAATCGGCGAAGAAAGCCGAATCGACGGCTTTGCTATTTGCCAAACGGTGTTGGATGAAGCCACGCTGTTTAATATCGCCTTGGATCCGCAAAAACAGGGGCGGGGAT‑TGGGGCGCCGTTTATTAACCGAGCTGATGACGCAGTTAAAACAAAAAGGCAttt > 1:5945/1‑250 (MQ=255) tATCTCATTGAGCAGGCGGCACACGCGATGCCTTGGAGCTTAGGCACACTGAAAAATAATCAGGGCGAACGTTACTTCAATTTGAAAATCGGCGAAGAAAGCCGAATCGACGGCTTTGCTATTTGCCAAACGGTGTTGGATGAAGCCACGCTGTTTAATATCGCCTTGGATCCGCAAAAACAGGGGCGGGGAT‑TGGGGCGCCGTTTATTAACCGAGCTGATGACGCAGTTAAAACAAAAAGGCATTTTGAc < 1:9096/251‑1 (MQ=255) tcATTGAGCAGGCGGCACACGCGATGCCTTGGAGCTTAGGCACACTGAAAAATAATCAGGGCGAACGTTACTTCAATTTGAAAATCGGCGAAGAAAGCCGAATCGACGGCTTTGCTATTTGCCAAACGGTGTTGGATGAAGCCACGCTGTTTAATATCGCCTTGGATCCGCAAAAACAGGGGCGGGGAT‑TGGGGCGCCGTTTATTAACCGAGCTGATGACGCAGTTAAAACAAAAAGGCATTTTGACCTtg > 1:584400/1‑251 (MQ=255) cATTGAGCAGGCGGCACACGCGATGCCTTGGAGCTTAGGCACACTGAAAAATAATCAGGGCGAACGTTACTTCAATTTGAAAATCGGCGAAGAAAGCCGAATCGACGGCTTTGCTATTTGCCAAACGGTGTTGGATGAAGCCACGCTGTTTAATATCGCCTTGGATCCGCAAAAACAGGGGCGGGGAT‑TGGGGCGCCGTTTATTAACCGAGCTGATGACGCAGTTAAAACAAAAAGGCATTTTGACCTtgt > 1:55893/1‑251 (MQ=255) cATTGAGCAGGCGGCACACGCGATGCCTTGGAGCCTAGGCACACTGAAAAATAATCAGGGCGAACGTTACTTCAATTTGAAAATCGGCGAAGAAAGCCGAATCGACGGCTTTGCTATTTGCCAAACGGTGTTGGATGAAGCCACGCTGTTTAATATCGCCTTGGATCCGCAAAAACAGGGGCGGGGAT‑TGGGGCGCCGTTTATTAACCGAGCTGATGACGCAGTTAAAACAAAAAGGCATTTTGACCTtgt > 1:605146/1‑251 (MQ=255) 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tattaACCGAGCTGATGACGCAGTTAAAACAAAAAGGCATTTTGACCTTGTGGCTGGAAGTGCGCGAATCCAATAAAAAAGCCCTGGCACTGTATGATTCGCTGGGCTTTAATCAAGTGGATATTCGCAAAAATTATTATCCCACCGCCGACGGCAAACGGGAAAATGCCGTGGTGATGGCGGCGTATTTATAGGCTATTTTTCCCTTTTGATAGCTTGCAACATCGGTGCAAACCAAGCGTTTACCTGc > 1:684889/1‑250 (MQ=255) atgaCGCAGTTAAAACAAAAAGGCATTTTGACCTTGTGGCTGGAAGTGCGCGAATCCAATAAAAAAGCCCTGGCACTGTATGATTCGCTGGGCTTTAATCAAGTGGATATTCGCAAAAATTATTATCCCCCCGCCGACGGCAAACGGGAAAATGCCGTGGTGATGGCGGCGTATTTATAGGCTATTTTTCCCTTTTGATAGCTTGCAACATCGGTGCAAACCAAGCGTTTACCTGCCGATTGATCCAATTc < 1:629382/251‑1 (MQ=255) | ATTTTGATCGTCTTTATCTCATTGAGCAGGCGGCACACGCGGTGCCTTGGAGCTTAGGCACGCTGAAAAATAATCAGGGCAAACGTTACCTCAATTTGAAAATCGGCGAAGAAAGCCGAATCGACGGTTTTGCCATTTGCCAGACGGTGTTGGATGAAGCCACGCTGTTTAATATCGCCGTGGATCCGCAACAGCAGGGATTGGGGC‑TGGGGCGCCGCTTATTAAGCGAGCTGATGACACAATTAAAACAAAAAAGCATTCTGACCTTGTGGCTGGAAGTGCGCGAATCCAATAAAAAAGCCCAAGCGCTGTATGATTCGCTGGGCTTTAATCAGGTGGATATTCGCAAAAATTATTATCCCACCCCCGACGGCAAACGGGAAAATGCCGTGGTGATGGCGGCGTATTTATAGGCTATTTTTCCCTTTTGATAGCTTGCAACATCGGCGCAAACCAAGCGTTTACCTGCCGATTGATCCAATTC > 1/1987857‑1988340 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |