| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,988,074 | C→T | R83R (CGC→CGT) | unknown → | Ribosomal‑protein‑S18p‑alanine acetyltransferase (EC 2.3.1.128) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,988,074 | 0 | C | T | 100.0% | 164.8 / NA | 63 | R83R (CGC→CGT) | unknown | Ribosomal‑protein‑S18p‑alanine acetyltransferase (EC 2.3.1.128) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (34/29); total (34/29) | |||||||||||
ACACATTTCTCCTATTGAACCCTCGGATTTTGATCGTCTTTATCTCATTGAGCAGGCGGCACACGCGGTGCCTTGGAGCTTAGGCACGCTGAAAAATAATCAGGGCAAACGTTACCTCAATTTGAAAATCGGCGAAGAAAGCCGAATCGACGGTTTTGCCATTTGCCAGACGGTGTTGGATGAAGCCACGCTGTTTAATATCGCCGTGGATCCGCAACAGCAGGGATTGGGGC‑TGGGGCGCCGCTTATTAAGCGAGCTGATGACACAATTAAAACAAAAAAGCATTCTGACCTTGTGGCTGGAAGTGCGCGAATCCAATAAAAAAGCCCAAGCGCTGTATGATTCGCTGGGCTTTAATCAGGTGGATATTCGCAAAAATTATTATCCCACCCCCGACGGCAAACGGGAAAATGCCGTGGTGATGGCGGCGTATTTATAGGCTATTTTTCCCTTTTGATAGCTTGCAACATCGGCGCAAACCAAG > 1/1987831‑1988314 | acacATTTCTCCTATTGAACCCTCGGATTTTGATCGTCTTTATCTCATTGAGCAGGCGGCACACGCGATGCCTTGGAGCTTAGGCACACTGAAAAATAATCAGGGCGAACGTTACTTCAATTTGAAAATCGGCGAAGAAAGCCGAATCGACGGCTTTGCTATTTGCCAAACGGTGTTGGATGAAGCCACGCTGTTTAATATCGCCTTGGATCCGCAAAAACAGGGGCGGGGAT‑TGGGGCGCCGTTTATTaa > 1:393649/1‑251 (MQ=255) 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aaacaggggcggggattggggcGCCGTTTATTAACCGAGCTGATGACGCAGTTAAAACAAAAAGGCATTTTGACCTTGTGGCTGGAAGTGCGCGAATCCAATAAAAAAGCCCTGGCACTGTATGATTCGCTGGGCTTTAATCAAGTGGATATTCGCAAAAATTATTATCCCACCGCCGACGGCAAACGGGAAAATGCCGTGGTGATGGCGGCGTATTTATAGGCTATTTTTCCCTTTTGATAGCTTGCAAc < 1:350225/235‑1 (MQ=255) gggcggggattggggcGCCGTTTATTAACCGAGCTGATGACGCAGTTAAAACAAAAAGGCATTTTGACCTTGTGGCTGGAAGTGCGCGAATCCAATAAAAAAGCCCTGGCACTGTATGATTCGCTGGGCTTTAATCaag < 1:16303/129‑3 (MQ=255) ggattggggcGCCGTTTATTAACCGAGCTGATGACGCAGTTAAAACAAAAAGGCATTTTGACCTTGTGGCTGGAAGTGCGCGAATCCAATAAAAAAGCCCTGGCACTGTATGATTCGCTGGGCTTTAATCAAGTGGATATTCGCAAAAATTATTATCCCACCGCCGACGGCAAACGGGAAAATGCCGTGGTGATGGCGGCGTATTTATAGGCTATTTTTCCCTTTTGATAGCTTGCAACATCGGTGCaaa > 1:765826/5‑250 (MQ=255) attggggcGCCGTTTATTAACCGAGCTGATGACGCAGTTAAAACAAAAAGGCATTTTGACCTTGTGGCTGGAAGTGCGCGAATCCAATAAAAAAGCCCTGGCACTGTATGATTCGCTGGGCTTTAATCAAGTGGATATTCGCAAAAATTATTATCCCACCGCCGACGGCAAACGGGAAAATGCCGTGGTGATGGCGGCGTATTTATAGGCTATTTTTCCCTTTTGATAGCTTGCAACATCGGTGCAAAcc < 1:114452/248‑1 (MQ=255) ggggcGCCGTTTATTAACCGAGCTGATGACGCAGTTAAAACAAAAAGGCATTTTGACCTTGTGGCTGGAAGTGCGCGAATCCAATAAAAAAGCCCTGGCACTGTATGATTCGCTGGGCTTTAATCAAGTGGATATTCGCAAAAATTATTATCCCACCGCCGACGGCAAACAGGAAAATGCCGTGGTGATGGCGGCGTATTTATAGGCTATTTTTCCCTTTTGATAGCTTGCAACATCGGTGCAAACCAAg > 1:683533/1‑250 (MQ=255) | ACACATTTCTCCTATTGAACCCTCGGATTTTGATCGTCTTTATCTCATTGAGCAGGCGGCACACGCGGTGCCTTGGAGCTTAGGCACGCTGAAAAATAATCAGGGCAAACGTTACCTCAATTTGAAAATCGGCGAAGAAAGCCGAATCGACGGTTTTGCCATTTGCCAGACGGTGTTGGATGAAGCCACGCTGTTTAATATCGCCGTGGATCCGCAACAGCAGGGATTGGGGC‑TGGGGCGCCGCTTATTAAGCGAGCTGATGACACAATTAAAACAAAAAAGCATTCTGACCTTGTGGCTGGAAGTGCGCGAATCCAATAAAAAAGCCCAAGCGCTGTATGATTCGCTGGGCTTTAATCAGGTGGATATTCGCAAAAATTATTATCCCACCCCCGACGGCAAACGGGAAAATGCCGTGGTGATGGCGGCGTATTTATAGGCTATTTTTCCCTTTTGATAGCTTGCAACATCGGCGCAAACCAAG > 1/1987831‑1988314 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |