| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,985,161 | C→A | V178F (GTT→TTT) | unknown ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,985,161 | 0 | C | A | 98.2% | 166.5 / NA | 57 | V178F (GTT→TTT) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base A (23/33); total (24/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.21e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
CGATTAATTCGATATGTTCTTCCTGGCGGCGGTTTTCATTTTGAATAGCTTGCCATAACACGGGATCGTAATCGGCGATGTTCATACTTTTTTTAAACATGGTGTTCTCCTCTTGGTAGTGAATTGGAACTGCGGTCTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACGCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAACGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGTTCGATTTATTCACGCGCTTACTGTATTTCTTAAACAAATTTTCTTCATAAAGTTTATATCTGGAATCCTTTTTAATGGCGTCCAAAGCCTCTTCCGTATGCCTACGTTGTACCCAATTAGTGGTAAACG > 1/1984916‑1985397 | cGATTAATTCGATATGTTCTTCCTGGCGGCGGTTTTCATTTTGAATAGCTTGCCATAACACGAGATCGTAATCGGCGATGTTCATACTTTTTTTAAACATGGTGTTCTCCTCTTGGTAGTGAATTGGAACTGCGGTCTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCa < 1:826473/249‑1 (MQ=255) cGATATGTTCTTCCTGGCGGCGGTTTTCATTTTGAATAGCTTGCCATAACACGAGATCGTAATCGGCGATGTTCATACTTTTTTTAAACATGGTGTTCTCCTCTTGGTAGTGAATTGGAACTGCGGTCTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGgtgt < 1:146593/251‑1 (MQ=255) tatGTTCTTCCTGGCGGCGGTTTTCATTTTGAATAGCTTGCCATAACACGAGATCGTAATCGGCGATGTTCATACTTTTTTTAAACATGGTGTTCTCCTCTTGGTAGTGAATTGGAACTGCGGTCTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGc < 1:193458/251‑1 (MQ=255) tcttcCTGGCGGCGGTTTTCATTTTGAATAGCTTGCCATAACACGAGATCGTAATCGGCGATGTTCATACTTTTTTTAAACATGGTGTTCTCCTCTTGGTAGTGAATTGGAACTGCGGTCTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCttttt < 1:343232/251‑1 (MQ=255) cttcCTGGCGGCGGTTTTCATTTTGAATAGCTTGCCATAACACGAGATCGTAATCGGCGATGTTCATACTTTTTTTAAACATGGTGTTCTCCTCTTGGTAGTGAATTGGAACTGCGGTCTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGTAAGCAAGCTGTGGTGTAGCtttttt > 1:485504/1‑251 (MQ=255) cATTTTGAATAGCTTGCCATAACACGAGATCGTAATCGGCGATGTTCATACTTTTTTTAAACATGGTGTTCTCCTCTTGGTAGTGAATTGGAACTGCGGTCTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTa > 1:105548/1‑251 (MQ=255) cTTGCCATAACACGAGATCGTAATCGGCGATGTTCATACTTTTTTTAAACATGGTGTTCTCCTCTTGGTAGTGAATTGGAACTGCGGTCTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTcatcat < 1:328316/249‑1 (MQ=255) cTTGCCATAACACGAGATCGTAATCGGCGATGTTCATACTTTTTTTAAACATGGTGTTCTCCTCTTGGTAGTGAATTGGAACTGCGGTCTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCata < 1:54551/250‑1 (MQ=255) ttGCCATAACACGAGATCGTAATCGGCGATGTTCATACTTTTTTTAAACATGGTGTTCTCCTCTTGGTAGTGAATTGGAACTGCGGTCTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATAtc < 1:659902/251‑1 (MQ=255) ttGCCATAACACGAGATCGTAATCGGCGATGTTCATACTTTTTTTAAACATGGTGTTCTCCTCTTGGTAGTGAATTGGAACTGCGGTCTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATAtc < 1:495402/251‑1 (MQ=255) ttGCCATAACACGAGATCGTAATCGGCGATGTTCATACTTTTTTTAAACATGGTGTTCTCCTCTTGGTAGTGAATTGGAACTGCGGTCTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATAtc < 1:29813/251‑1 (MQ=255) ttGCCATAACACGAGATCGTAATCGGCGATGTTCATACTTTTTTTAAACATGGTGTTCTCCTCTTGGTAGTGAATTGGAACTGCGGTCTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACACGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATAtc < 1:49685/251‑1 (MQ=255) acacGAGATCGTAATCGGCGATGTTCATACTTTTTTTAAACATGGTGTTCTCCTCTTGGTAGTGAATTGGAACTGCGGTCTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCaa > 1:391984/1‑251 (MQ=255) 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gtTCTCCTCTTGGTAGTGAATTGGAACTGCGGTCTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGtt > 1:809714/1‑251 (MQ=255) gtTCTCCTCTTGGTAGTGAATTGGAACTGCGGTCTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGtt > 1:475160/1‑251 (MQ=255) ctcctcTTGGTAGTGAATTGGAACTGCGGTCTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCata < 1:682805/192‑1 (MQ=255) cctcTTGGTAGTGAATTGGAACTGCGGTCTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATcgc < 1:708020/212‑1 (MQ=255) cctcTTGGTAGTGAATTGGAACTGCGGTCTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGTTCGAtt > 1:770506/1‑251 (MQ=255) cctcTTGGTAGTGAATTGGAACTGCGGTCTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGTTCGAtt > 1:105246/1‑251 (MQ=255) gTAGTGAATTGGAACTGCGGTCTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAAt > 1:864265/1‑229 (MQ=255) gAATTGGAACTGCGGTCTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTg < 1:239104/209‑1 (MQ=255) gAATTGGAACTGCGGTCTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGTTCGAtt < 1:146846/239‑1 (MQ=255) ttGGAACTGCGGTCTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGTTCGATTTATTCACGCGCTTAc < 1:353367/251‑1 (MQ=255) gAACTGCGGTCTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACaaa < 1:474033/216‑1 (MQ=255) aaCTGCGGTCTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGTTCGATTTATTCACGCGCTTACTGt < 1:34068/250‑1 (MQ=255) aaCTGCGGTCTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGTTCGATTTATTCACGCGCTTACTGTa < 1:140517/251‑1 (MQ=255) gCGGTCTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGTTCGATTTATTCACGCGCTTACTGTAttt > 1:368872/1‑250 (MQ=255) gTCTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGTTCGATTTATTCACGCGCTTACTGTATTTCTTa > 1:814900/1‑251 (MQ=255) cTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGTTCGATTTATTCACGCGCTTACTGTATTTCTTaaa > 1:395014/1‑251 (MQ=255) cTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGTTCGATTTATTCACGCGCTTACTGTATTTCTTaaa > 1:354686/1‑251 (MQ=255) gTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGTTCGATTTATTCACGCGCTTACTGTATTTCTTAAACAAAt > 1:385218/1‑251 (MQ=255) aCTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTtgt < 1:242070/128‑1 (MQ=255) aCTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGTTCGATTTATTCACGCGCTTACTGTATTTCTTAAACAAAttt > 1:345256/1‑251 (MQ=255) aTCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGTTCGATTTATTCACGCGCTTACTGTATTTCTTAAACAAATTTTCTTCATAAAGTTTatat < 1:769108/251‑1 (MQ=255) tCTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGTTCGATTTATTCACGCGCTTACTGTATTTCTTAAACAAATTTTCTTCATAAAGTTTATATc < 1:752840/251‑1 (MQ=255) cTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATAtc > 1:339470/1‑137 (MQ=255) cTTAATAACTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGTTCGATTTATTCACGCGCTTACTGTATTTCTTAAACAAATTTTCTTCATAAAGTTTatat > 1:71020/1‑249 (MQ=255) taataaCTCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAg < 1:723130/125‑1 (MQ=255) ctccGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCa > 1:791894/3‑136 (MQ=255) ctccGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGTTCGATTTATTCACGCGCTTACTg > 1:321844/3‑205 (MQ=255) ctccGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGTTCGATTTATTCACGCGCTTACTGt < 1:200785/204‑1 (MQ=255) gATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGTTCGATTTATTCACGCGCTTACTGTATTTCTTAAACAAATTTTCTTCATAAAGTTTATATCTGGAATCCttttt < 1:652159/250‑1 (MQ=255) tttttCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGTTCGATTTATTCACGCGCTTACTGTATTTCTTAAACAAATTTTCTTCATAAAGTTTATATCTGGAATCCTTTTTAATGGCGTcc < 1:289018/251‑1 (MQ=255) tttCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGTTCGATTTATTCACGCGCTTACTGTATTTCTTAAACAAATTTTCTTCATAAAGTTTATATCTGGAATCCTTTTTAATGGCGTCCAAAGCCTCTTCCGTATGCCTACgc < 1:746492/251‑2 (MQ=255) cGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGTTCGATTTATTCACGCGCTTACTGTATTTCTTACACAAATTTTCTTCATAAAGTTTATATCTGGAATCCTTTTTAATGGCGTCCAAAGCCTCTTCCGTATGCCTACgc > 1:434733/1‑243 (MQ=255) cGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGTTCGATTTATTCACGCGCTTACTGTATTTCTTAAACAAATTTTCTTCATAAAGTTTATATCTGGAATCCTTTTTAATGGCGTCCAAAGCCTCTTCCGTATGCCTACGCTGTAc > 1:766639/1‑249 (MQ=255) gCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGTTCGATTTATTCACGCGCTTACTGTATTTCt < 1:528589/165‑1 (MQ=255) gCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGTTCGATTTATTCACGCGCTTACTGTATTTCTTAAACAAATTTTCTTCATAAAGTTTATATCTGGAATCCTTTTTAATGGCGTCCAAAGCCTCTTCCGTATGCCTACgc < 1:726152/242‑2 (MQ=255) gTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCatat > 1:736071/1‑96 (MQ=255) tATTTGTCGGTGTTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGTTCGATTTATTCACGCGCTTACTGTATTTCTTAAACAAATTTTCTTCATAAAGTTTATATCTGGAATCCTTTTTAATGGCGTCCAAAGCCTCTTCCGTATGCCTACGCTGTACCCAATTAg < 1:431095/251‑1 (MQ=255) tgtTATTGGCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGTTCGATTTATTCACGCGCTTACTGTATTTCTTAAACAAATTTTCTTCATAAAGTTTATATCTGGAATCCTTTTTAATGGCGTCCAAAGCCTCTTCCGTATGCCTACGCTGTACCCAATTAGTGGTAAACg < 1:209331/250‑1 (MQ=255) ggCGAACGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGTTCGATTTATTCACGCGCTTACTGTATTTCTTAAACAAATTTTCTTCATAAAGTTTATATCTGGAATCCTTTTTAATGGCGTCCAAAGCCTCTTCCGTATGCCTACGCTGTACCCAAt > 1:709009/1‑231 (MQ=255) ggCGAAAGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGTTCGATTTATTCACGCGCTTACTGTAt > 1:467753/1‑140 (MQ=255) | CGATTAATTCGATATGTTCTTCCTGGCGGCGGTTTTCATTTTGAATAGCTTGCCATAACACGGGATCGTAATCGGCGATGTTCATACTTTTTTTAAACATGGTGTTCTCCTCTTGGTAGTGAATTGGAACTGCGGTCTATTGTACTCAATTTCGCAATAAAATCTTAATAACGCCGGATGTGTTTTTTTTCATTCTAATTATGAAAATTTTTCACTCGGCAGTATTTGTCGGTGTTATTGGCGAACGCAAGCTGTGGTGTAGCTTTTTTGTGCTGTTTTTTGCGTTAAAGTCATCATATCTCTGCCAAGCTCCATATCGCGTGTCAGTGAGCTAATCACAAAATTAATCGTGTTCGATTTATTCACGCGCTTACTGTATTTCTTAAACAAATTTTCTTCATAAAGTTTATATCTGGAATCCTTTTTAATGGCGTCCAAAGCCTCTTCCGTATGCCTACGTTGTACCCAATTAGTGGTAAACG > 1/1984916‑1985397 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |