| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,980,457 | G→C | T557R (ACA→AGA) | unknown ← | RTX toxins determinant A and related Ca2+‑binding proteins |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,980,457 | 0 | G | C | 100.0% | 127.3 / NA | 43 | T557R (ACA→AGA) | unknown | RTX toxins determinant A and related Ca2+‑binding proteins |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (21/22); total (21/22) | |||||||||||
CATCATAACCGTCTCCAGCATTAACTATTGTTGAACCGGATCCGACAAAAACATAATCATCTTTAGCACCCAAATTAGCAATTAATCTTGCTTCTAGAACTTTATTATCACGTGTAACGGCATGTTGAATTAAGTTAGAAAAATCATATACACCATTAGAATTAGGAACACCTTTTACCTTCCAATCGGTACGTCCTTTTACTTTTAATTCAGTAATAAATTCATATTTACCTGACTGACGTGTTTTCCGTTCTTCCTTACCTGCGGTTAACAACGGATTTAAAAAAGTTAGAGTGGTAGAACCTTTTATACCCGAAAGATCAATATTACCTTTGATTGGATCTAAAATCTGTTTAGTGAATTTATCGCTATGCTTTGCAAGCTCCTCACCCTTTTTCAAATAATCCACATAAGCTTTACCACTTTGAATACGATCTCCATTACGAGTGATACCTGCTAATTCACCAATGCGCTGATCCCAAC > 1/1980215‑1980697 | catcatAACCGTCTCCAGCATTAACTATTGTTGAACCGGATCCGACAAAAACATAATCATCTTTAGCACCCAAATTAGCAATTAATCTTGCTTCTAGAACTTTATTATCACGTGTAACGGCATGTTGAATTAAGTTAGAAAAATCATATACACCATTAGAATTAGGAACACCTTTTACCTTCCAATCGGTACGTCCTTTTACTTTTAATTCAGTAATAAATTCATATTTACCTGACTGACGTCTTTTCCg > 1:164487/1‑250 (MQ=255) 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< 1:316756/251‑1 (MQ=255) ttttACCTTCCAATCGGTACGTCCTTTTACTTTTAATTCAGTAATAAATTCATATTTACCTGACTGACGTCTTTTCCGTTCTTCCTTACCTGCGGTTAACAACGGATTTAAAAAAGTTAGAGTGGTAGAACCTTTTATACCCGAAAGATCAATATTACCTTTGATTGGATCTAAAATCTGTTTAGTGAATTTATCGCTATGCTTTGCAAGCTCCTCACCCTTTTTCAAATAATCCACATAAGCTTTACCAc < 1:236718/251‑1 (MQ=255) tCCAATCGGTACGTCCTTTTACTTTTAATTCAGTAATAAATTCATATTTACCTGACTGACGTCTTTTCCGTTCTTCCTTACCTGCGGTTAACAACGGATTTAAAAAAGTTAGAGTGGTAGAACCTTTTATACCCGAAAGATCAATATTACCTTTGATTGGATCTAAAATCTGTTTAGTGAATTTATCGCTATGCTTTGCAAGCTCCTCACCCTTTTTCAAATAATCCACATAAGCTTTACCACTTTGAATa > 1:632513/1‑251 (MQ=255) aTCGGTACGTCCTTTTACTTTTAATTCAGTAATAAATTCATATTTACCTGACTGACGTCTTTTCCGTTCTTCCTTACCTGCGGTTAACAACGGATTTAAAAAAGTTAGAGTGGTAGAACCTTTTATACCCGAAAGATCAATATTACCTTTGATTGGATCTAAAATCTGTTTAGTGAATTTATCGCTATGCTTTGCAAGCTCCTCACCCTTTTTCAAATAATCCACATAAGCTTTACCACTTTGAATACGAt < 1:546029/251‑1 (MQ=255) 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CATCATAACCGTCTCCAGCATTAACTATTGTTGAACCGGATCCGACAAAAACATAATCATCTTTAGCACCCAAATTAGCAATTAATCTTGCTTCTAGAACTTTATTATCACGTGTAACGGCATGTTGAATTAAGTTAGAAAAATCATATACACCATTAGAATTAGGAACACCTTTTACCTTCCAATCGGTACGTCCTTTTACTTTTAATTCAGTAATAAATTCATATTTACCTGACTGACGTGTTTTCCGTTCTTCCTTACCTGCGGTTAACAACGGATTTAAAAAAGTTAGAGTGGTAGAACCTTTTATACCCGAAAGATCAATATTACCTTTGATTGGATCTAAAATCTGTTTAGTGAATTTATCGCTATGCTTTGCAAGCTCCTCACCCTTTTTCAAATAATCCACATAAGCTTTACCACTTTGAATACGATCTCCATTACGAGTGATACCTGCTAATTCACCAATGCGCTGATCCCAAC > 1/1980215‑1980697 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |