| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 49,304 | G→T | I227I (ATC→ATA) | unknown ← | SSU rRNA pseudouridine(516) synthase (EC 5.4.99.19) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 49,304 | 0 | G | T | 100.0% | 281.4 / NA | 98 | I227I (ATC→ATA) | unknown | SSU rRNA pseudouridine(516) synthase (EC 5.4.99.19) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (48/50); total (48/50) | |||||||||||
AACTGTCGCCAAACGGTCCCCAGAACAACTGTCCGAGTGCCAAGCCATAAGCAAAGGACGTTAACGTATGCTGCACCTGATCATTAGTCACCTGAAAATCCTGCGCGATATTCAAAAATGCAGGCAGATACATATCCACGCTTAACGGCGGCAGCATGGACAAAATGCCTAAGGCAACAACAAAAATAAAATTCGTTTTTACGGTTTTGCTTGGATTCAAGAATTTATTCTCCGGAAAAATATGCGATTTCTTCCGCGTTTAACGCACGAAAATCGCCTTCTGCTAAATTGTCATCCAAGGTCAGATTACCGATTTTCCAACGATGCAACCCGAGCACTTTATTCCCCAATGCGGCAAACATCCGTTTCACCTGATGATAACGCCCTTCGCTAATGGTTAAATTCACGTTGTAATTATCTAAAATTTCAAGTACCGCCGGTTTGGTGGGATCTTTCTCGCCGCGTAGCAAAATGCCCTCAGCACAGGCT > 1/49059‑49547 | aaCTGTCGCCAAACGGTCCCCAGAACAACTGTCCGAGTGCCAAGCCATAAGCAAAGGACGTTAACGTATGCTGCACCTGATCATTAGTCACCTGAAAATCCTGCGCGATATTCAAAAATGCAGGCAGATACATATCCACGCTTAACGGCGGCAGCATGGACAAAATGCCTAAGGCAACAACAAAAATAAAATTCGTTTTTACGGTTTTGCTTGGATTCAAGAATTTATTCTCCGGAAAAATATGCTATttc < 1:786994/251‑1 (MQ=255) 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> 1:813434/1‑165 (MQ=255) ccTGAAAATCCTGCGCGATATTCAAAAATGCAGGCAGATACATATCCACGCTTAACGGCGGCAGCATGGACAAAATGCCTAAGGCAACAACAAAAATAAAATTCGTTTTTACGGTTTTGCTTGGATTCAAGAATTTATTCTCCGGAAAAATATGCTATTTCTTCCGCGTTTAACGCACGAAAATCGCCTTCTGCTAAATTGTCATCCAAGGTCAGATTACCGATTTTCCAACGATGCAACCCGAGCACttt > 1:344007/1‑251 (MQ=255) tGAAAATCCTGCGCGATATTCAAAAATGCAGGCAGATACATATCCACGCTTAACGGCGGCAGCATGGACAAAATGCCTAAGGCAACAACAAAAATAAAATTCGTTTTTACGGTTTTGCTTGGATTCAAGAATTTATTCTCCGGAAAAATATGCTATTTCTTCCGCGTTTAACGCACGAAAATCGCCTTCTGCTAAATTGTCATCCAAGGTCAGATTACCGATTTTCCAACGATGCAACCCGAGCACTTTAt > 1:352235/1‑251 (MQ=255) aaaTCCTGCGCGATATTCAAAAATGCAGGCAGATACATATCCACGCTTAACGGCGGCAGCATGGACAAAATGCCTAAGGCAACAACAAAAATAAAATTCGTTTTTACGGTTTTGCTTGGATTCAAGAATTTATTCTCCGGAAAAATATGCTATTTCTTCCGCGTTTAACGCACGAAAATCGCCTTCTGCTAAATTGTCATCCAAGGTCAGATTACCGATTTTCCAACGATGCAACCCGAGCACTTTATTcc < 1:899368/251‑1 (MQ=255) 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tatCCACGCTTAACGGCGGCAGCATGGACAAAATGCCTAAGGCAACAACAAAAATAAAATTCGTTTTTACGGTTTTGCTTGGATTCAAGAATTTATTCTCCGGAAAAATATGCTATTTCTTCCGCGTTTAACGCACGAAAATCGCCTTCTGCTAAATTGTCATCCAAGGTCAGATTACCGa < 1:165047/181‑1 (MQ=255) atCCACGCTTAACGGCGGCAGCATGGACAAAATGCCTAAGGCAACAACAAAAATAAAATTCGTTTTTACGGTTTTGCTTGGATTCAAGAATTTATTCTCCGGAAAAATATGCTATTTCTTCCGCGTTTAACGCACGAAAATCGCCTTCTGCTAAATTGTCATCCAAGGTCAGATTACCGATTTTCCAACGATGCAACCCGAGCACTTTATTCCCCAATGCGGCAAACATCCGTTTCACCTGATGATAACGc < 1:674038/251‑1 (MQ=255) atCCACGCTTAACGGCGGCAGCATGGACAAAATGCCTAAGGCAACAACAAAAATAAAATTCGTTTTTACGGTTTTGCTTGGATTCAAGAATTTATTCTCCGGAAAAATATGCTATTTCTTCCGCGTTTAACGCACGAAAATCGCCTTCTGCTAAATTGTCATCCAAGGTCAGATTACCGATTTTCCAACGATGCAACCCGAGCACTTTATTCCCCAATGCGGCAAACATCCGTTTCACCTGATGATAACGc < 1:127740/251‑1 (MQ=255) tCCACGCTTAACGGCGGCAGCATGGACAAAATGCCTAAGGCAACAACAAAAATAAAATTCGTTTTTACGGTTTTGCTTGGATTCAAGAATTTATTCTCCGGAAAAATATGCTATTTCTTCCGCGTTTAACGCACGAAAATCGcc < 1:259378/144‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |