| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,979,577 | T→C | K850K (AAA→AAG) | unknown ← | RTX toxins determinant A and related Ca2+‑binding proteins |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,979,577 | 0 | T | C | 100.0% | 199.8 / NA | 67 | K850K (AAA→AAG) | unknown | RTX toxins determinant A and related Ca2+‑binding proteins |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (36/31); total (36/31) | |||||||||||
CTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATCTAATCCTGCCGATGAATTAGGTTTACTAAACCATCCTTTAAATGTTACTGCTGTTCTATTATTTGTTTTCAATAGTAGATCATTGCCGTTACGCTCAAATGACACATCTTTGAGATTGATATTTGCTAATGATAATTTATCTTTATCACCGCTATGTTCCGTAATAGTGTGGTGCCCATATTCTTTACGGTAAACATAAATATCATTTCCTTCTCCACCGGCAAGTTGGTCATCGCCTTCTCCACCGTCAAGTAAATCATCTCCTTGGTTTCCAAACAACTTATCATTGCCACTTCCACCTCTTAGAATATCGGAACCATTGCCTCCCTCTAAGTGGTCGTCGCCTTCTCCACCGTCAAGATAGTTGTTGCCATATTCACCAAAGAGCCTATCGTTACCGGCACCACCATAGAGCTTATCATTA > 1/1979334‑1979817 | ctTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATTTAACCCCGCCGACGAATTAGGTTTATTAAACCATCCTTTAAATGTTACTGCTGTTCTATTATTTGTTTTCAATAGTAGATCATTGCCGTTACGTTCAAATGACACCTCTTTGAGGTTGATATTTGCTAATGATAATTTATCTTTATCACCGCTATGTTCCGTAATAGTGTGGTGGCCATATTCCTTACGGt < 1:488531/251‑1 (MQ=255) 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ggccATATTCCTTACGGTAAACATAAATATCATTTCCTTCTCCACCGGCAAGTTGATCATCACCTTTTCCGCCATCAAGCAAGTCATCTCCTTGGTTTCCAAATAATTTATCATTGCCACTTCCGCCTCTTAGAATATCGGAACCATTCCCCCCTTCTAAATGGTCGTCGCCTTCACCACCGTCTAGATAGTTGTTACCATATTCACCAAAGAGCCTGTCATTGCCGGCGCCACCATaaagtttgtcgttg > 1:340776/3‑238 (MQ=255) gccATATTCCTTACGGTAAACATAAATATCATTTCCTTCTCCACCGGCAAGTTGATCATCACCTTTTCCGCCATCAAGCAAGTCATCTCCTTGGTTTCCAAATAATTTATCATTGCCACTTCCGCCTCTTAGAATATCGGAAc > 1:787529/2‑143 (MQ=255) gccATATTCCTTACGGTAAACATAAATATCATTTCCTTCTCCACCGGCAAGTTGATCATCACCTTTTCCGCCATCAAGCAAGTCATCTCCTTGGTTTCCAAATAATTTATCATTGCCACTTCCGCCTCTTAGAATATCGGAACCATTCCCCCCTTCTAAATGGTCGTCGCCTTCACCACCGTCTAGAt < 1:135531/187‑1 (MQ=255) gccATATTCCTTACGGTAAACATAAATATCATTTCCTTCTCCACCGGCAAGTTGATCATCACCTTTTCCGCCATCAAGCAAGTCATCTCCTTGGTTTCCAAATAATTTATCATTGCCACTTCCGCCTCTTAGAATATCGGAACCATTCCCCCCTTCTAAATGGTCGTCGCCTTCACCACCGTCTAGATAGTTGTTACCATATTCACCAAAGAGCCTGTCATTGCCGGCGCCACCATaaagtttgtcgttg > 1:226947/2‑237 (MQ=255) gccATATTCCTTACGGTAAACATAAATATCATTTCCTTCTCCACCGGCAAGTTGATCATCACCTTTTCCGCCATCAAGCAAGTCATCTCCTTGGTTTCCAAATAATTTATCATTGCCACTTCCGCCTCTTAGAATATCGGAACCATTCCCCCCTTCTAAATGGTCGTCGCCTTCACCACCGTCTAGATAGTTGTTACCATATTCACCAAAGAGCCTGTCATTGCCGGCGCCACCATaaagtttgtcgttg > 1:596773/2‑237 (MQ=255) atTCCTTACGGTAAACATAAATATCATTTCCTTCTCCACCGGCAAGTTGATCATCACCTTTTCCGCCATCAAGCAAGTCATCTCCTTGGTTTCCAAATAATTTATCTTTGCCACTTCCGCCTCTTAGAATATCGGAACCATTCCCCCCTTCTAAATGGTCGTCGCCTTCACCACCGTCTAGATAGTTGTTACCATATTCACCaa > 1:760071/1‑204 (MQ=255) | CTTAAGTCGTGCACGATCCTTTTCAGGTGCGTATTCAAGAAGTTTTCTTTGATACTCATCTAATCCTGCCGATGAATTAGGTTTACTAAACCATCCTTTAAATGTTACTGCTGTTCTATTATTTGTTTTCAATAGTAGATCATTGCCGTTACGCTCAAATGACACATCTTTGAGATTGATATTTGCTAATGATAATTTATCTTTATCACCGCTATGTTCCGTAATAGTGTGGTGCCCATATTCTTTACGGTAAACATAAATATCATTTCCTTCTCCACCGGCAAGTTGGTCATCGCCTTCTCCACCGTCAAGTAAATCATCTCCTTGGTTTCCAAACAACTTATCATTGCCACTTCCACCTCTTAGAATATCGGAACCATTGCCTCCCTCTAAGTGGTCGTCGCCTTCTCCACCGTCAAGATAGTTGTTGCCATATTCACCAAAGAGCCTATCGTTACCGGCACCACCATAGAGCTTATCATTA > 1/1979334‑1979817 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |